| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,429,986 | IS3 (–) +5 bp :: +T | coding (34‑38/258 nt) | yrdB ← | DUF1488 domain‑containing protein YrdB |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 315229 = | NA (NA) | 49 (1.030) +T |
39/484 | 0.3 | 100% | noncoding (1/1255 nt) | IS3 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 3429986 = | 0 (0.000) | coding (38/258 nt) | yrdB | DUF1488 domain‑containing protein YrdB | |||||
| * | ? | NC_000913 | 1094245 = | NA (NA) | 69 (1.450) | 59/484 | 0.1 | 100% | noncoding (1258/1258 nt) | IS3 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3429990 | 0 (0.000) | coding (34/258 nt) | yrdB | DUF1488 domain‑containing protein YrdB | |||||
GCGAAAGCTTTAGCGGAAAGGATTCGGGAAAATGTTGAGCGTTTAACTGGCGATAATCCTGAATACGCTATACCACAAAAAGTGACGATTAGTATTGGCGCTGTTGTGACTCAGGAAAATGCGTTAAACCCAAATGAGATCTATCGACTGGCTGATAACGCACTTTACGAGGCGAAAG‑AGACCGGGCGTAATAAGGTGGTT‑GTGAGGGATGTGGTGAATTTTTGTGAGTCACCATAAAGCGGCATTTTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCCATGGATACATTCCACTTTCAGCGAATGAAAGAAGCTTTCCACGCAGGCATTATCGTAGCAGCAACCTTTTGCGCTC > NC_000913/1093998‑1094488 | gCGAAAGCTTTAGCGGAAAGGATTCGGGAAAATGTTGAGCGTTTAACTGGCGATAATCCTGAATACGCTATACCACAAAAAGTGACGATTAGTATTGGCGCTGTTGTGACTCAGGAAAATGCGTTAAACCCAAATGAGAGCTATCGACTGGCTGATAACGCACTTTACGAGGCGAAAG‑AGACCGGGCGTAATAAGGTGGTT‑GTGAGGGATGTGGTGAATTTTTGTGAGTCACCATAAAGCGGCATTTTGAt < 1:447482/251‑1 (MQ=255) 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tGGCGATAATCCTGAATACGCTATACCACAAAAAGTGACGATTAGTATTGGCGCTGTTGTGACTCAGGAAAATGCGTTAAACCCAAATGAGATCTATCGACTGGCTGATAACGCACTTTACGAGGCGAAAG‑AGACCGGGCGTAATAAGGTGGTT‑GTGAGTGATGTGGTGAATTTTTGTGAGTCACCATAAAGCGGCATTTTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTc > 2:138183/1‑251 (MQ=255) cGATAATCCTGAATACGCTATACCACAAAAAGTGACGATTAGTATTGGCGCTGTTGTGACTCAGGAAAATGCGTTAAACCCAAATGAGATCTATCGACTGGCTGATAACGCACTTTACGAGGCGAAAG‑AGACCGGGCGTAATAAGGTGGTT‑GTGAGGGATGTGGTGAATTTTTGTGAGTCACCATAAAGCGGCATTTTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCaa > 1:372785/1‑250 (MQ=255) gATAATCCTGAATACGCTATACCACAAAAAGTGACGATTAGTATTGGCGCTGTTGTGACTCAGGAAAATGCGTTAAACCCAAATGAGATCTATCGACTGGCTGATAACGCACTTTACGAGGCGAAAG‑AGACCGGGCGTAATAAGGTGGTT‑GTGAGGGATGTGGTGAATTTTTGTGAGTCACCATAAAGCGGCATTTTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAAt < 1:482020/251‑1 (MQ=255) 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aaGGCGAAAG‑AGACCGGGCGTAATAAGGTTGTT‑GTGATGGATGTGGTGAATTTTTTAGAGACACCTTAAAGCGTCATTTTGATCCTACCCACGAAATATGGACAAAGGCCTACGCTAGGTTCTTGTGTTCAAATTGTCCCGGCATGAGTCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTTTTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCCATgg < 1:463616/250‑1 (MQ=17) gggCGAAAG‑AGACCGGGCGTAATAAGGTGGTT‑GTGAGGGATGTGGTGAATTTTTGTGAGTCACCATAAAGCGGCATTTTGATCCTACCCACGTAAGATGGACACAGGCCTTAGCGAGGTTCTTGTTTTCAATTTGTTCCGGACTGAGTCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCGCCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCCATGGa < 1:260150/250‑1 (MQ=255) aaG‑AGACCGGGCGTAATAAGGTGGTT‑GTGAGGGATGTGGTGAATTTTTGTGAGTCACCATAAAGCGGCATTTTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCat > 1:44418/1‑213 (MQ=255) 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gtggtgAATTTTTGTGAGTCACCATAAAGCGGCATTTTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCCATGGATACATTCCACTTTCAGCGAATGAAAGAAGCTTTCCACGc > 1:373379/1‑249 (MQ=255) gtggtgAATTTTTGTGAGTCACCATAAAGCGGCATTTTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCCATGGATACATTCCACTTTCAGCGAATGAAAGAAGCTTTCCACGCAg < 1:387812/251‑1 (MQ=255) aCCATAAAGCGGCCTTTTGCTCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCAACGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGAGTTCTCCATGGATCCATTCCACTTTCAGCGCATGAAAGAAACTTTCCCCACAGGCATTATCGTAGCAGCAAcc > 1:271/1‑251 (MQ=11) aaGCGGTATTTTTAACCTCCCCACGTAATAGGTACACAGTCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTTTTCCCGACTGAGGCCGCCACACCAACTTTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTTCCCGCATTATTTCCCGGCTTATAAAGTGTTCTCCATGGATACATTCCACTTTCAGCGAATGAAAGAAGCTTTCCACGCAGGCATTAACGTAGCAGCAACCTTTTgc < 2:303970/251‑1 (MQ=11) aaGCGGCATTTTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGACCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCCATGGATACATTCCACTTTCATCGAATGAAAGAAGCTTTCCACGCAGGCATTATCGTAGCAGCAACCTTTTgc > 1:272451/1‑251 (MQ=18) ggCATTTTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCCATGGATACATTCCACTTTCAGCGAATGAAAGAAGCTTTCCACGCCGGCATTATCGTAGCAGCAACCTTTTGCGCTc > 2:386893/1‑251 (MQ=17) | GCGAAAGCTTTAGCGGAAAGGATTCGGGAAAATGTTGAGCGTTTAACTGGCGATAATCCTGAATACGCTATACCACAAAAAGTGACGATTAGTATTGGCGCTGTTGTGACTCAGGAAAATGCGTTAAACCCAAATGAGATCTATCGACTGGCTGATAACGCACTTTACGAGGCGAAAG‑AGACCGGGCGTAATAAGGTGGTT‑GTGAGGGATGTGGTGAATTTTTGTGAGTCACCATAAAGCGGCATTTTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCCATGGATACATTCCACTTTCAGCGAATGAAAGAAGCTTTCCACGCAGGCATTATCGTAGCAGCAACCTTTTGCGCTC > NC_000913/1093998‑1094488 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |