| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,380,292 | 2 bp→A | coding (225‑226/735 nt) | frdB ← | fumarate reductase iron‑sulfur protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,380,292 | 0 | G | . | 98.4% | 277.7 / ‑0.6 | 63 | coding (226/735 nt) | frdB | fumarate reductase iron‑sulfur protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base . (35/26); minor base A (1/0); total (37/26) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.38e-01 | |||||||||||
| * | NC_000913 | 4,380,293 | 0 | T | A | 98.4% | 204.4 / NA | 62 | K75N (AAA→AAT) | frdB | fumarate reductase iron‑sulfur protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base A (36/25); total (36/26) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.19e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CGTAGCACAAACCACAGTTGATGCAACCGGAGAACTGGTGATACTTCGCCATCTGCGCCGGGGTCTGGATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCAGTTTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGACCAGCGGTAGCTCAGGTCCGGTGCCAGGTTGTCTTTGATGTAGCCCAGCGCATCCAGTAATGAGGTAGTTGCGTCATAAGGCACTTCATAGAATGCGCTATGCGGTGCGGTATCGACTTCCGGGTTATAGCGCACCACCTCAATTTTCAGGTTTTTCATCTCAGCCATTCGCCTTCTCCTTCTT > NC_000913/4380049‑4380533 | cgTAGCACAAACCACAGTTGATGCAACCGGAGAACTGGTGATACTTCGCCATCTGCGCCGGGGTCTGGATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCAAtttggcc > 1:200645/1‑247 (MQ=255) aGCACACACCACCGTTGATGCAACCGGAGAACTGGTGATACTTCGCCATCTGCGCCGGGGTCTGGATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCTGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACgt > 1:346361/1‑251 (MQ=255) acaAACCACAGTTGATGCAACCGGAGAACTGGTGATACTTCGCCATCTGCGCCGGGGTCTGGATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACgttgt > 2:132860/1‑251 (MQ=255) aGTTGATGCAACCGGAGAACTGGTGATACTTCGCCATCTGCGCCGGGGTCTGGATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACcatca < 1:106607/251‑1 (MQ=255) aGTTGATGCAACCGGAGAACTGGTGATACTTCGCCATCTGCGCCGGGGTCTGGATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACcatc > 1:296620/1‑250 (MQ=255) aTGCAACCGGAGAACTGGTGATACTTCGCCAGCTGCGCCGGGGTCTGGATGTTAGTACCCTGTTCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCg < 2:332223/251‑1 (MQ=255) gaactgtggattcctCGCCATCTGCGCCGTGGGCTGGATGGTAGTAGCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGACGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTGTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCCCCAGACCGCGTTCCATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGGCGGTGTAATCACGCAAGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACcaca < 2:80735/237‑1 (MQ=255) ggTGATACTTCGCCATCTGCGACGGGGTCTGGATGTTAGTACCCTGATCAGCGGAGCGGGAGTTGCAGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGCCTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACAGTCGGTGTCATCACGCAGGCAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATACCCCAGGAACCACAAAt > 2:441650/1‑249 (MQ=255) acctCGCCCTCTTCGCCGGGGTCTGGATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTTGGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCGAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCTCAGGAACCACAAATCGCCATa < 1:50841/247‑1 (MQ=255) cTTCGCCATCTGCGCCGGGGTCTGGATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACg > 1:189287/1‑251 (MQ=255) ccATCTGCGCCGGGGTCTGGATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGCTGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGAGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGcc > 2:432548/1‑241 (MQ=255) ccATCTGCGCCGGGGTCTGGATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTATCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGGAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGcc < 1:432548/241‑1 (MQ=255) ccATCTGAGCCGGAGACTGGATGTTAGCACACTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGGGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGATTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCCTCATGCCGCAGGAACCAAAAATCGCCATACGACAgg > 2:152212/1‑251 (MQ=255) aTCTGCGCCGGGGTCTGGATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGAc > 1:11190/1‑251 (MQ=255) gcgcCGGGGTCTGGATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGACCAGc < 2:125854/251‑1 (MQ=255) ggggTCTGCATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGACCAGCGGt > 1:99953/1‑249 (MQ=255) gggTCTGGATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGACCAGCGGTAGc < 1:325567/251‑1 (MQ=255) ggATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCTAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGACCAGCGGTAGCTCAGGt < 2:340223/251‑1 (MQ=255) tatccTGATCAGCGGAACGGGCGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTACAGACTTTCGGTGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATAGCGTTCAATCGGGAAGATAGCTACCGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAACTCGCCATACGGCAGGAACAGCGGTAGATCAGGACCGGTGcc > 2:159526/4‑250 (MQ=255) cccTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCCGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGACCAGCCGTCGCTCAGGTCCGGTGCCAgg > 2:406223/1‑251 (MQ=255) cccTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGTACCAGCTGTAGCTCAGGTCCGGTGCCAgg < 2:17944/251‑1 (MQ=255) ggTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGGGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGACCAGCGGTAGCTCAGGTCCGGTGCCAGGTTGTCTTTGAt > 1:188830/1‑251 (MQ=255) gggAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTGCCAGACTGTCGATGAAGTGGTTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCATCCTTCATGCCGTCGGTGTAATCACGCAGGAATGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGACCAGCGGTAGGTCAGGTCCGGTGCCAGGTTGGCTGGGATGTAGc < 2:220946/251‑1 (MQ=255) ggAGTTGACGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGACCAGCGGTAGCTCAGGTCCGGTGCCAGGTTGTCTTTGATGTAGcc > 1:124218/1‑251 (MQ=255) gTTGCCGATGATGTAAGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGACCAGCGGTAGATCAGGTCCGGTGCCAGGTTGTCTTTGATGTAGccc > 2:192519/1‑249 (MQ=255) cGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGACCAGCGGTAGCTCAGGTCCGGTGCCAGGTTGTCTTTGAGGTAGCCCAGCGCAt < 1:76658/251‑1 (MQ=255) cGATGATGTACGGTTCGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGACATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCCTACGGCAGGACCAGCGGTAGCTCAGGTCCGGTGCCAGGTTGTCTTTGATGTAGCCCAGCGCAt > 1:155635/1‑251 (MQ=255) tACGGATTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCCATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGACCAGCGGTAGCTACGGTCCGGGGCCCGGTTGTCTTTGGTGTAGCCCAgagcctcccggaat > 2:269758/1‑238 (MQ=255) 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gACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGACCAGCGGTAGCTCAGGTCCGGTGCCAGGTTGTCTTTGCTGTAGCCCAGCGCATCCAGTAATGAGGTAGTTGCGTCATa > 2:233936/1‑249 (MQ=255) gATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGACCAGCGGTAGCTCAGGTCCGGTGCCAGGTTGTCTTTGATGTAGCCCAGCGCATCCAGTAATGAGGTAGTTGCGTCATAAGGCACTTc > 2:178750/1‑251 (MQ=255) aTGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGACGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGa > 2:245857/1‑163 (MQ=255) aTGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGa < 1:245857/163‑1 (MQ=255) 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> 1:207982/1‑251 (MQ=255) gTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGACCAGCGGTAGCTCAGGTCCGGTGCCAGGTTGTCTTTGATGTAGCCCAGCGCATCCAGTAATGAGGTAGTTGCGTCATAAGGCACTTCATAGAATGCGCTATGCGGTGCGGTATCGACTTCCGGGTTATAGCGCACCACCTCAATTTTCAGGTTTTTCAt > 1:217099/1‑251 (MQ=255) aaTCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGACCAGCGGTAGCTCAGGTCCGGTGCCAGGTTGTCTTTGATGTAGCCCAGCGCATCCAGTAATGAGGTAGTTGCGTCATAAGGCACTTCATAGAATGCGCTATGCGGTGCGGTATCGACTTCCGGGTTATAGCGCACCACCTCAATTTTCAGGTTTTTCATCTCAGcc > 1:134544/1‑250 (MQ=255) aTCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGACCAGCGGTAGCTCAGGTCCGGTGCCAGGTTGTCTTTGATGTAGCCCAGCGCATCCAGTAATGAGGTAGTTGCGTCATAAGGCACTTCATAGAATGCGCTATGCGGTGCGGTATCGACTTCCGGGTTATAGCGCACCACCTCAATTTTCAGGTTTTTCATCTCAGCCAt < 1:68992/251‑1 (MQ=255) gCAGGAAAGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGACCAGCGGTAGCTCAGGTCCGGTGCCAGGTTGTCTTTGATGAAGCCCAGCGCATCCAGTAATGAGGTAGTTGCGTCATAAGGCACTTCATAGAATGCGCTATGCGGTGCGGTATCGACTTCCGGGTTATAGCGCACCACCTCAATTTTCAGGTTTTTCATCTCAGCCATTCGcc > 2:55149/1‑251 (MQ=255) cAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGACCAGCGGTAGCTCAGGTCCGGTGCCAGGTTGTCTTTGATGTAGCCCAGCGCATCCAGTAATGAGGTAGTTGCGTCATAAGGCACTTCATAGAATGCGCTATGCGGTGCGGTATCGACTTCCGGGTTATAGCGCCCCACCTCAATTTTCAGGTTTTTCATCTCAGCCATTCGcct > 1:378078/1‑251 (MQ=255) aGGAAGGTTTTACATGACA‑ATTTGGCACGTTGTTAACAATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGACCAGCGGTAGCTCAGGTCCGGTGCCAGGTTGTCTTTGATGTAGCCCAGCGCATCCAGTAATGAGGTAGTTGCGTCATAAGGCACTTCATAGAATGCGCTATGCGGTGCGGTAACGACTTCCGGGTTCTAGCGCACCACCTCAATTTTCAGGTTTTTCATCTCAGCCATTCGcctt > 2:337229/1‑251 (MQ=255) ggAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGACCAGCGGTAGCTCAGGTCCGGTGCCAGGTTGTCTTTGATGTAGCCCAGCGCATCCAGTAATGAGGTAGTTGCGTCATAAGGCACTTCATAGAATGCGCTATGCGGTGCGGTATCGACTTCCGGGTTATAGCGCACCACCTCAATTTTCAGGTTTTTCATCTCAGCCATTCGccttc < 1:132860/251‑1 (MQ=255) aaGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGACCAGCGGTAACTCAGGTCCGGAGCCAGGTTGTCTTTGATGTAGCCCAGCGCATCCAGTAATGAGGTAGTTGCGTCATAAGGCACTTCATAGAATGCGCTATGCGGTGCGGTATCGACTTCCGGGTTATAGCGCACCACCTCAATTTTCAGGTTTTTCATCTCAGCCATTCGccttctc > 1:371713/1‑251 (MQ=255) ttACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTCAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGACCAGCGGTAGCTCAGGTCCGGTGCCAGGTTGTCTTTGATGTAGCCCAGCGCATCCAGTAATGAGGTAGTTGCGTCATAAGGCACTTAATAGAATGCGCTATGCGGTGCGGTATCGACTTCCGGGTTATAGAGCACCACCTCAATTTTCAGGTTTTTCATCTCAGCCATTCGCCTTCTCcttctt > 1:250849/1‑251 (MQ=255) | CGTAGCACAAACCACAGTTGATGCAACCGGAGAACTGGTGATACTTCGCCATCTGCGCCGGGGTCTGGATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCAGTTTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGACCAGCGGTAGCTCAGGTCCGGTGCCAGGTTGTCTTTGATGTAGCCCAGCGCATCCAGTAATGAGGTAGTTGCGTCATAAGGCACTTCATAGAATGCGCTATGCGGTGCGGTATCGACTTCCGGGTTATAGCGCACCACCTCAATTTTCAGGTTTTTCATCTCAGCCATTCGCCTTCTCCTTCTT > NC_000913/4380049‑4380533 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |