| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 88,571 | G→A | V182M (GTG→ATG) | cra → | DNA‑binding transcriptional dual regulator Cra |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 88,571 | 0 | G | A | 98.7% | 224.9 / ‑6.9 | 77 | V182M (GTG→ATG) | cra | DNA‑binding transcriptional dual regulator Cra |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (47/29); minor base C (1/0); total (48/29) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.95e-01 | |||||||||||
AGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAAC‑GCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGGCTGCCCAGTTATTCGAAAAATGGCTGGAAACGCATCCGATGCCGCAGGCGCTGTTCACAACGTCGTTTGCGTTGTTGCAAGGAGTGATGGATGTCACGCTGCGTCGCGACGGCA > NC_000913/88324‑88814 | agaagaTCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGTTTGATGCCTTTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAAC‑GCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGc < 1:465043/251‑1 (MQ=255) tCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGATGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAAC‑GCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATc > 2:447991/1‑251 (MQ=255) cAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAAC‑GCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCt > 1:135799/1‑251 (MQ=255) gAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCACC‑GCTGGGCTAACGACCCGTTCACGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCATCGATCGTGCACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATAACGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTAcc > 1:305600/1‑251 (MQ=255) gCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAAC‑GCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCggcgc > 2:472070/1‑248 (MQ=255) gTGCATGGAGCACTTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCTTTATTGTTTCAACGTCGTTGCCTCCGGCGCACCCTTTTTAGCAAC‑GCTGGGCTACCGCCCGGTTCCCGATTGCCGCGCTGGACCGCGCCCGCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTCCGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCttt < 2:146566/251‑1 (MQ=255) cATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAAC‑GCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGCTCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTg > 2:147082/1‑251 (MQ=255) gAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAAC‑GCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTc > 1:387559/1‑249 (MQ=255) aCCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAAC‑GCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTc > 1:542512/1‑251 (MQ=255) aCAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAAC‑GCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTg > 1:176449/1‑251 (MQ=255) aGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAAC‑GCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGa > 1:256605/1‑250 (MQ=255) gCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAAC‑GCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGCTCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAAc > 2:560435/1‑251 (MQ=255) gTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAAC‑GCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACa > 1:529650/1‑250 (MQ=255) 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aTGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCATGAGCTTCCTTTTTACCAAC‑GCGGGGTTAACGACCCGTTCCGGTTTGTCGCGCTGGCCCGCGCCCTCGATCGTGAACACGTCCCCAGCGTGGTTGGTGCCGAGCAGGATTATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGt < 1:440684/251‑1 (MQ=255) tGCCATTATTGTTTCGAAGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAAC‑GCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATAATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGt > 2:82473/1‑250 (MQ=255) cATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCCTCCTTTTTATCAAC‑GCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTg > 1:467795/1‑251 (MQ=255) attGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAAC‑GCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGCCCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCt < 1:86263/250‑1 (MQ=255) cGACGTCGTGGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAAC‑GCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCGGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAgat < 1:99385/251‑1 (MQ=255) gACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAAC‑GCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCCGCTTCCTGCGTGACCAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAgatg > 2:203362/1‑251 (MQ=255) gtcgtTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAAC‑GCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATc > 1:324068/1‑251 (MQ=255) gcgtTGCCTCCTGAGCATCTTTTTTACCAAC‑GCTGGGCTAACGCCCCGTTCCCGATTGGCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATcc < 1:34982/250‑1 (MQ=255) gtTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAAC‑GCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGAGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCcgc > 2:252100/1‑251 (MQ=255) 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tttttATCAAC‑GCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGt > 1:273475/1‑251 (MQ=255) ttttAGCAAC‑GCTGGGCTACCGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGGGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTg < 1:310816/249‑1 (MQ=255) ttATCAAC‑GCTGGGCTAACCACCTGTTACCGATTATCGCGCTGGACCGCGCCATCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGCTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGACATGCTGGCGGAAGCGTTACGTACGTTTCCCGCCGTGCCGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGACAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTTCCTGGATATATGACCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTAtt > 2:63823/1‑250 (MQ=255) 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ggCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACCCTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGTTGCGCTACCGGTGCTTTATGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGATATg > 2:274503/1‑251 (MQ=255) gCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGACCACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGCTGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTACGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGCACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGCTGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATg > 2:338049/1‑250 (MQ=255) cccGTTACCGATTGCCGCGCTGGACCGAGCCCTCGATCGTGAACAAACCACCAGAGTGGCTGGTGACGATCAGGATGATGCCGTAATGCTGGCGGCAGAGCTACGTACGTTTCCCGCCGAGACGATGATTTATCTTGGAGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACACGGTTTCCGTACTGCCTGGAACGATGATCCGCGCGACGTGCCTTTCCTGTATGCCAACAGATATGAGCGGGAgg > 2:523244/1‑251 (MQ=255) 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ccTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTTGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGAGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATAAGAGGGAGGCGGCTGCCCAGTTATTCGCAAAATGGCTgg > 2:426741/1‑251 (MQ=255) cTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACACGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGACGCGGCTGCCCAGTTATTCGAAAAATGGCTgg > 1:400434/1‑250 (MQ=255) aTCGTGACCACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGACCAGGATGCTGCCGACATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGCCGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGACGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGCGGCGGATGCCCAGTTATTCGCAACGTGGCTGGAAACg > 2:248678/1‑251 (MQ=255) tCGTGAACACTTCCCCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCAAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAgat 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ggttggtGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGGCTGCCCAGTTATTCGAAAAATGGCTGGAAACGCATCCGATGCCGCAGGCGCTGt > 1:546495/1‑251 (MQ=255) tGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGGCTGCCCAGTTATTCGAAAAATGGCTGGAAACGCATCCGATGCCGCAGGCGCTGTTcaca > 2:275101/1‑250 (MQ=255) gCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTAATGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGGCTGCCCAGTTATTCGAAAAATGGCTGGAAAAGCATCCGATGCCGCAGGCGCTGTTCACAAc > 2:120377/1‑251 (MQ=255) gATCAGGATGATGCAGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGGCTGCCCAGTTATTCGAAAAATGGCTGGAAACGCATCCGATGCCGCAGGCGCTGTTCACAAcgtc > 1:376275/1‑251 (MQ=255) ggATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGTGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGGCTGCCCAGTTATTCGAAAAATGGCTGGAAACGCATCCGAAGCCGCAGGCGCTGTTCACAACGTCGtttt > 2:288357/1‑250 (MQ=255) ccGAAATGCAGGAGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGGCTGCCCAGTTATTCGAAAAATGGCTGGAAACGCATCCGATGCCGCAGGCGCTGTTCACACCGTCGTTTGCGttgttg > 2:36424/1‑251 (MQ=255) cGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGGCTGCCCAGTTATTCGAAAAATGGCTGGAAACGCATCCGATGCCGCAGGCGCTGTTCACAACGTCGTTTGCGTTGTTGc < 1:252100/251‑1 (MQ=255) ggccgggcggacggttgaCGTAGGTGTCCCGGCGAGACGATGCTTTATCTTGGTGCGCGACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCGGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGGCTGCCCAGTTATTCGAAAAATGGCTGGAAACGCATCCGATGCCGCAGGCGCTGTTCACAACGTCGTTTGCGTTGTTGCAAgg < 2:175720/234‑1 (MQ=255) ggAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGCCGATGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACCAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGGCTGCCCAGTTATTCGAAAAATGGCTGGAAACGCATCCGACGCCGCAGGCGCTGTTCACAACGTCGTTTGCGTTGTTGCACGGAGTgatgg > 2:73715/1‑251 (MQ=255) 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AGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAAC‑GCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGGCTGCCCAGTTATTCGAAAAATGGCTGGAAACGCATCCGATGCCGCAGGCGCTGTTCACAACGTCGTTTGCGTTGTTGCAAGGAGTGATGGATGTCACGCTGCGTCGCGACGGCA > NC_000913/88324‑88814 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |