Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 4,380,469 | C→T | E17K (GAA→AAA) | frdB ← | fumarate reductase iron‑sulfur protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,380,469 | 0 | C | T | 98.2% | 336.3 / NA | 108 | E17K (GAA→AAA) | frdB | fumarate reductase iron‑sulfur protein |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.00e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
GAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCAGTTTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGACCAGCGGTAGCTCAGGTCCGGTGCCAGGTTGTCTTTGATGTAGCCCAGCGCATCCAGTAATGAGGTAGTTG‑CGTCATAAGGCACTTCATAGAATGCGCTATGCGGTGCGGTATCGACTTCCGGGTTATAGCGCACCACCTCAATTTTCAGGTTTTTCATCTCAGCCATTCGCCTTCTCCTTCTTATTGGCTGCTTCCGCCTTATCGGCTGCATCCGCTTCGCCACCGTAAACGCGTTTAGCTGGCGGCAGCGTAGTAATCTTCACGTCGCTGTACTCCAGGCGAGTCGTGCCATCAGCATCGCGGAAGGCGAGGGTGTGTTTGAGGAAGTTGACGTCGTCACGCTCGGTGCAACCTTCGTCC > NC_000913/4380227‑4380711 | gAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATGCCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCAGTTTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGACCAGCGGTAGCTCAGGTCCGGTGCCAGGTTGTCTTTGATGTAGCCCAGCGCATCCAGTAATGAGGTAGTTG‑CGTCATAAGGCACTTCATAGAATGCGCTATGCGGTGCGGTATCGACTTTCGGGTtat < 2:402747/251‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |