| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 4,139,298 | G→A | A137A (GCC→GCT) | fsaB ← | fructose‑6‑phosphate aldolase 2 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,139,298 | 0 | G | A | 95.9% | 236.4 / NA | 74 | A137A (GCC→GCT) | fsaB | fructose‑6‑phosphate aldolase 2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); major base A (36/34); minor base C (3/0); total (39/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.43e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
CGGCATTCCAGTCGTGTTCGAACTTCTCTATAGCTGACTCTACCGCAGGGGTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTCTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCGGGATTTTCACCACAATACCCGGAATAGCGTCGCGCAGGCGCTTCGCTTCTTCCACCATCCCCTGCGCGTCGCGGCTCATGGTCTGAGCAAACAGA > NC_000913/4139069‑4139544 | cGGCATTCCAGTCGTGTTCGAACTTCTCTATAGCTGACTCTACCGCAGGGGTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTCTCCGCCCTGAGCATCTACGCGGTTAACATAc > 1:62531/1‑251 (MQ=255) tCCAGTCGTGTTCGAACTTCTCTATAGCTGACTCTACCGCAGGGGTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTCTCCGCCCTGAGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGc > 1:147969/1‑250 (MQ=255) ccAGTCGTGTTCGAACTTCTCTATAGCTGACTCTACCGCAGGGGTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTCTCCGCCCTGAGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCa < 2:62531/250‑1 (MQ=255) gtTCGAACTGCTCTATAGCAGACTCTACCGCAGGGGTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTATGGGCAGGGTGACGGATTCTCATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTGAAAGCTGGCGGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATGTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCGGAACCCTACGAATGCCGTCTCCGCCCTGAGCATCTACGCGGCTAACATACGGAGcttcggattgt < 2:257305/251‑11 (MQ=255) tctATAGCTGCCTCTCCCGCAGGGGTGTTGAGCATTTGCTGCGCTACATCTAAGGGCACGGTGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTCTCCGCCCTGAGCCTATCCGCGGTTAACATACGGAGAAACGTATTTTGCCCCTGcc > 2:390047/1‑249 (MQ=255) tctAGAGCTGACTCTACCGCAGGGGTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTCTCCGCCCTGAGCATCTACGCGGTTAACATACGGCGCAACGTATTTAGCCCCTGcc > 2:322221/1‑249 (MQ=255) ataGCTGACTCTACCGCAGGGGTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTCTCCGCCCTGAGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGc > 1:167480/1‑251 (MQ=255) 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cAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTCTCCGCCCTGAGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTGGCCCCTGCCAGTGCGGCtaat < 2:305638/136‑1 (MQ=255) cAGCACCATGATTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTCTCCGCCCTGAGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTc > 1:466246/1‑219 (MQ=255) aGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTCTCCGCCCTGAGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCGGGCTTTTCACCACAATACCCgg > 2:317323/1‑251 (MQ=255) cACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGCATGCCGTCTCCGCCCTGAGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCGGGATTTTCACCACAATACCCGGa > 2:366471/1‑250 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |