Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
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RA | NC_000913 | 3,827,026 | C→T | A606V (GCG→GTG) | recG → | ATP‑dependent DNA helicase RecG |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,827,026 | 0 | C | T | 98.1% | 328.6 / NA | 108 | A606V (GCG→GTG) | recG | ATP‑dependent DNA helicase RecG |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); major base T (40/64); minor base A (2/0); total (43/65) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.55e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
GGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTC‑TGGGTCTGGCGCAGTTACACCAGCTGCGCGGGCGCGTAGGTCGTGGCGCGGTGGCTTCTCACTGCGTGCTGCTCTACAAAACGCCGCTTTCTAAAACGGCGCAAATTCGCCTGCAAGTGCTGCGCGACAGTAACGACGGTTTTGTGATTGCGCAAAAAGATCTGGAGATTCGCGGCCCTGGCGAATTGTTAGGCACGCGTCAGACGGGTAATGCTGAATTTAAAGTGGCGGATTTACTGCGCGATCAGGCGATGATCCCGGAAGTTCAGCGCCTGGCACGCCATATTCACGAACGTTACCCACAACAGGCAAAAGCCCTGATAGAACGCTGGATGCCGGAGAC > NC_000913/3826782‑3827269 | ggctgATGAAACCTGCCGAGAAACGGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGGTAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTAGTGAAGACGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATGATCGAAAACCCGGAGCGTC‑TGGGTGTGGCGCAGTGACACCAGCGGCGCGGGTGCGTAGGTCGTGGCGCGGTGGCTTCTCACTGCGTGGTGCGCTACAAAAGGCCGCTTTCGAAAAAGGTGCAAAtt < 2:85781/247‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |