| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 3,744,369 | C→T | A14A (GCC→GCT) | yiaM → | 2,3‑diketo‑L‑gulonate:Na(+) symporter ‑ membrane subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,744,369 | 0 | C | T | 98.5% | 218.0 / NA | 66 | A14A (GCC→GCT) | yiaM | 2,3‑diketo‑L‑gulonate:Na(+) symporter ‑ membrane subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (33/32); minor base G (0/1); total (33/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.54e-01 | |||||||||||
CACCGACCAGGTTGTATTATGCAAACAGCCTCTGAGATACGAAAAATTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATGTTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAGGAATAGCTATGAAAAAAATACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATGAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCTGGTGGAGAAACTCTCCCCCGCATGGCAGCGACGAGTCGCTCTGGTTACCCATTCCTTAATCTTATTTATTTGTG > NC_000913/3744130‑3744604 | cACCGACCAGGTTGTATTATGCAAACAGCCTCTGAGATACGAAAAATTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATGTTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAGGAATAGCTATGAAAAAAATACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCTGTACTTTCCtg < 1:551067/251‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) aTGAAAAAAATACTCGAATCAATACTGGCGATTAATCTCGCTGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATGTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATGAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCTGGTGGAGAAACTCTCCCCCGCATGGCAGCGACGAGTCGCTCTGGTTa < 2:214130/250‑1 (MQ=255) aTGAAAAAAATACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCTGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATGAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCTGGTGGAGAAACTCTCCCCCGCATGGCAGCGACGAGTCGCTCTGGtt < 1:110536/249‑1 (MQ=255) gAAAAAAATACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCTGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATGAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCTGGTGGAGAAACTCTCCCCCGCATGGCAGCGACGAGTCGCTCTGGTTAcc < 2:281051/250‑1 (MQ=255) aaaaaaaTACTCGCAGCACTACTGGCGATTAATCTCGCTGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATGAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCTGGTGGTGAAACTCTCCCCCCCCTGGCAGCGCCGAGTCGCTCTGGTTAccc > 2:354685/1‑250 (MQ=255) aaaaaTACTCGAAGCACTACTGGCGATTCATCTCGCTGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATGAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGACCACGTTCAGGTCACCTTTCTGGTGGAGAAACTCTCCCCCGCATGGCAGCGACGCGTCGCTCTGGTTACCCAtt > 2:185339/1‑251 (MQ=255) aCTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCTGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATGAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCTGGTGGAGAAACTCTCCCCCGCATGGCAGCGACGAGTCGCTCTGGTTACCCATTCCTTa < 2:164008/250‑1 (MQ=255) cGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCTGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATGAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTGCTGGTGGAGAAACTCTCCCCCGCATGGCAGCGACGAGTCGCTCTGGTTACCCATTCCTTAATc < 2:71347/250‑1 (MQ=255) aaGCAATACTGGCGATTAATCTCGCTGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATGAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGTTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCTGGTGGAGAAACTCTCCCCCGCATGGCAGCGACGAGTCGCTCTGGTTACCCATTCCTTAATCtta < 2:378496/251‑1 (MQ=255) aGCAATCCTGGCGATTAATCTCGCTGTACTTTCCAGTATTGAATTTATAAGCATTATTTTACGATATGGTTTTAAGACAAGCATTTTCTCTGTTAATGAATTGTCACGTTATTTATTTGGCTGGTTCACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCATGGCACCTTTCTGGTTGAGAAACTCTCCCCCGCCTGCCCGCGACGAGTCGCTCTGGTTACCCATTCCTTACTCttat > 2:561588/1‑251 (MQ=255) gCAATACTGGCGATTAATCTCGCTGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATGAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCTGGTGGAGAAACTCTCCCCCGCATGGCAGCGACGAGTCGCTCTGGTTACCCATTCCTTAATCttatt < 1:297054/251‑1 (MQ=255) cTGGCGATTAATCTCGCTGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATGAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCTGGTGGAGAAACTCTCCCCCGCATGGCAGCGACGAGTCGCTCTGGTTACCCATTCCTTAATCTTATTTATTtg > 1:70705/1‑251 (MQ=255) ggCGATTAATCTCGCTGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATGAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCTGGTGGAGAAACTCTCCCCCGCATGGCAGCGACGAGTCGCTCTGGTTACCCATTCCTTAATCTTATTTATTtgtg > 1:413629/1‑251 (MQ=255) | CACCGACCAGGTTGTATTATGCAAACAGCCTCTGAGATACGAAAAATTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATGTTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAGGAATAGCTATGAAAAAAATACTCGAAGCAATACTGGCGATTAATCTCGCCGTACTTTCCTGTATTGTATTTATAAACATTATTTTAAGATATGGTTTTCAGACAAGCATTTTATCTGTTGATGAATTGTCACGTTATTTATTTGTCTGGTTAACGTTTATTGGCGCGATTGTAGCTTTTATGGATAACGCCCACGTTCAGGTCACCTTTCTGGTGGAGAAACTCTCCCCCGCATGGCAGCGACGAGTCGCTCTGGTTACCCATTCCTTAATCTTATTTATTTGTG > NC_000913/3744130‑3744604 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |