| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,270,497 | C→T | noncoding (96/377 nt) | rnpB ← | RNase P catalytic RNA component |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,270,497 | 0 | C | T | 96.1% | 144.0 / NA | 51 | noncoding (96/377 nt) | rnpB | RNase P catalytic RNA component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (22/27); minor base G (0/2); total (22/29) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.00e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 | |||||||||||
CATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGG‑TTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGA‑AGAGGACGACGACGAAGCG‑GCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACG‑GCAGATATTGTCATAAGCCCCGCGGAATGCTTCGTCCAACGTACCTATGCTGGTCAA > NC_000913/3270261‑3270738 | catCTAGGCCACCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTGACCGCCCCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGG‑TTTCCCCCCCAGGCGTTATCTGGCAACCTGccc < 2:368559/251‑1 (MQ=255) atcAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGG‑TTTCCCCCCCAGGCGTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGccc < 1:303400/249‑1 (MQ=255) gCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTGTCTCTTTTGCCCTGGTCGGGGG‑GTTCCCCCCCCGGCGTTATCTTGCAACCCGCCCTCTGGAGcccc > 1:49109/1‑250 (MQ=255) cAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTTTTGCACTGGTCGGGGGGTTTCCCCCCC‑CGCGGTTTCTGGCACCCCGCCCCATTGAGCCCCGACCTTtctcccctccc > 1:323498/1‑250 (MQ=255) aaGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTTTTTCACTGGGCGTGGGGTTTCCCCCCC‑GGCGTTATTTGGGCCCCTGCCCttt > 1:456725/1‑223 (MQ=255) aaGCAGCCTACCCGGGTGCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCAGCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGG‑TTTCCCCCCCAGGCGTTATCTGGCACCCTGCCCTAt < 2:456725/225‑1 (MQ=255) ccGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTTTCTCTTTTGCTCTGGTGGTGGGGTTTCCCCCCCCGCCGTT‑TCTGGCACCCTGCCCCCTGGGGCCCCGGCTTTCCTCCCCCCCCCCCCCCTccccc > 1:101081/1‑251 (MQ=255) gTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGATTGCTCTCTGTTTCACTGGGCGTGGG‑GTTCCCCCCCCGGCGGTATCTGGCACCCCGCCCTCTGGGGCCCGGGCTTTCCCCCCCCCCCCCCCTCTccccccc > 1:193141/1‑247 (MQ=255) tCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGG‑TTTCCCCCCCAGGCGTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGA‑aga < 1:213790/250‑1 (MQ=255) gggCCGTACCTTATGACCCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCCCCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGG‑TTTCCCCCCCAGGCGTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGA‑AGAGgacgacg < 2:323498/251‑1 (MQ=255) tACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTTTTGTCCTGGGCGTGGGGTTTCCCCCCC‑GGCGTTATCTGTCACCCTGCCCTCTGGAGGCCGGACTTTTCTCCCCCCCTCCCCGCTCCCCCCC‑AGAGGAccacgccga > 1:356786/1‑249 (MQ=255) ccTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTTTTGCACTTGTCGTGGGGTTTCCCCCCCAGG‑GGTATCTTGCACCCCGCCCCATGGCGCCCCGACTTTCCCCCCCTCCCCCCCCCTTCCCCCC‑AGAGGACGACGACCAAgcc > 1:389419/1‑250 (MQ=255) aaCCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGGGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCGTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGG‑TTTCCCCCCCAGGCGTTAGCGTGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCTTCTCCCCCGA‑AGAGGACGACGACGAAGCG‑ACGACTg < 2:62550/251‑1 (MQ=255) ccTATTGGGCCGTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACTCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGG‑TTTCCCCCCCAGGCGTTATCTGGCACCCGGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCTTCTCCCCCGA‑AGAGGACGACGACGAAGCT‑GCGACTGTCTg < 2:359420/251‑1 (MQ=255) aTTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGG‑TTTCCCCCCCAGGCGTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGA‑AGAGGACGACGACGAAGCG‑GCGACTGTCTgg < 1:504327/249‑1 (MQ=255) gcaccGGGTGGAGTTTACCGTGCCCCGGACTGTTACCCGCCTCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTGACCTGATCCCGCTTGCTCTGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTGGCACTGGTCGTGGG‑TTTCCCCCCCAGGCGTTATCTGGCATCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTTCGCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGA‑AGAGGACGACGGCGAAGCG‑GCGGCTGTCTTATCAGATTCGgcg < 2:569475/248‑1 (MQ=255) gggTGGAGTTTACCGTGCCTCGGACTGTTACCAGCCTCGCGGTGCGCTCTTACCGCCCCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGG‑TTTCCCCCCCAGGCGTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGA‑AGAGGACGACGACGAAGCG‑GCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAg < 2:519785/251‑1 (MQ=255) tttACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGAGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCCCTGGTCGGGGG‑TTTTCCCCCCCGGCGTTATCTTGCACCCTGCCCTCTTGAGCCCGGACTTTCCTCCCCCCCCCCCCCCTCCCCCCC‑CGAGGACGACGCCGAAACG‑GCGACTGTCTGGTCAGCCTCGGCGCGCACTATAGAgg > 1:148330/1‑251 (MQ=255) ttACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGCTTTCTCTCTTTTGCACTGGCCGTGGG‑GTTCCCCCCCCGGCCTTATCCGGCACCCTGCCCTATAGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCCCCCGTCTCCCCCGC‑AGAGGACGACCACGCAACG‑GCGACTGTCTTGGCAACGTCGGCGGGCAGGATAGAggg > 1:343966/1‑251 (MQ=255) aCCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTGTTGCCCCGGTCGTGGG‑GTTCCCCCCCCGGCGGTTTCTGGCGCCCTGCCCCCTGGAGGCCGGGCCTTCCCCCCCCCCCCCCCGCTCCCCCCACAG‑GGGCGACGACGGAGCC‑GCGGCCAGCTGGTCGGCTTCCGGGCGCAGTCTAGAggggt > 1:90806/1‑249 (MQ=255) cAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGG‑TTTCCCCCCCAGGCGTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGA‑AGAGGACGACGACGAAGCG‑GCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCcg < 1:369049/251‑1 (MQ=255) ccGCGCGGGTCGGTCTTACCGCCCCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCGCTCTGTTGCACTGGGCGGGGG‑TTTCCCCCCCAGGCGTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACGTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGA‑AGAGGACGACGACGAAGCG‑GCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGt < 2:194/251‑1 (MQ=255) cgcgcgGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTGTTTAACTGGTCGTGGG‑TTTTACCCCCCGGCGGTTTCTGGCCCCCCGCCCCCTTGCGGCCGGGCTTTCCCCCCCCCCGCCCGTCTCCCCCCC‑AGAGGACGCAGAAGCA‑CGAGCGGCTGTCTGGTCAACCTCGGCGCGCCGGATAGAGGGTGTTCGCGcccctggacccccaccgg > 1:399794/1‑236 (MQ=255) gcgcgGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGG‑TTTCCCCCCCAGGCGTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGA‑AGAGGACGACGACGAAGCG‑GCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTg < 1:122966/251‑1 (MQ=255) gTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGG‑TTTCCCCCCCAGGCGTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGA‑AGAGGACGACGACGAAGCG‑GCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCAt < 2:101081/251‑1 (MQ=255) cGCACCCTTTCCCCCTTACCCGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGG‑TTTCCCCCCCAGGCGTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGA‑AGAGGACGACGACGAAGCG‑GCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAg < 2:8804/251‑1 (MQ=255) cACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGG‑TTTCCCCCCCAGGCGTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGA‑AGAGGACGACGACGAAGCG‑GCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAgtg < 1:502280/251‑1 (MQ=255) ccccTTTCACCCTTGCCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGG‑TTTCCCCCCCAGGCGTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGA‑AGAGGACGACGACGAAGCG‑GCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAgtgt < 2:90806/250‑1 (MQ=255) cccTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGG‑TTTCCCCCCCAGGCGTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGA‑AGAGGACGACGACGAAGCG‑GCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGat < 1:305784/251‑1 (MQ=255) gATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACGGGTCGTGGG‑TTTCCCCCCCAGGCGGTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGA‑AGAGGACGACGACGAAGCG‑GCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACggga < 2:468844/251‑4 (MQ=255) ccccGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGG‑TTTCCCCCCCAGGCGTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGA‑AGAGGACGACGACGAAGCG‑GCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAg < 1:408304/250‑1 (MQ=255) cctggCCCTCGGCGTTTTTCTCTCTGTTGCTCTGGTCGTGTG‑TTTCCCCCCCAGGCGTTATCTGGCCCCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGA‑AGAGGACGACGACGAAGCG‑GCGACTGTCTGGTCAGCTTCTGCGCTCAGTATAGAGTTTTTGCGCGCCCTTGTCTCCCCGCGTTGCGCTTTCCAATCGCCATTGTCGCGGCGATATTACGTGaatctcgtcagat < 2:551527/248‑12 (MQ=255) ggCCATCGGCGGTTTGCCCTCTGTTGCACTGGTCGTGGG‑TTTCCCCCCCAGGCGTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGA‑AGAGGACGACGACGAAGCG‑GCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACG‑GCAGATAtt < 1:482887/251‑1 (MQ=255) ggcggTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGG‑TTTCCCCCCCAGGCGTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGA‑AGAGGACGACGACGAAGCG‑GCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCAGTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACG‑GCAGATATTGTCATaa < 2:49109/251‑1 (MQ=255) cggTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGG‑TTTCCCCCCCAGGCGTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGA‑AGAGGACGACGACGAAGCG‑GCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACG‑GCAGATATTGTCATAAGc > 1:31920/1‑251 (MQ=255) ggTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGG‑TTTCCCCCCCAGGCGTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGA‑AGAGGACGACGACGAAGCG‑GCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACG‑GCAGATATTGTCATACGcc > 2:37554/1‑251 (MQ=255) ggTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGG‑TTTCACCCCCAGGCGTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGA‑AGAGGACGACGACGAAGCG‑GCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACG‑GCAGATATTGTCATAAGcc > 1:493430/1‑251 (MQ=255) tGCACTGGTCGTGGG‑TTTCCCCCCCAGGCGTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGA‑AGAGGACGACGACGAAGCG‑GCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACG‑GCAGATATTGTCATAAGCCCCGCGGAATGCtt < 1:72572/250‑1 (MQ=255) gTCGTGGG‑TTTCCCCCCCAGGCGTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGA‑AGAGGACGACGACGAAGCG‑GCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACG‑GCAGATATTGTCATAAGCCCCGCGGAATGCTTCGTCCAAc < 2:493430/251‑1 (MQ=255) cGTGGG‑TTTCCCCCCCAGGCGTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGA‑AGAGGACGACGACGAAGCG‑GCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACG‑GCAGATATTGTCATAATCCCCGCGGAATGCTTCGTCCAACg < 1:118367/250‑1 (MQ=255) gTGGG‑TTTCCCCCCCAGGCGTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGA‑AGAGGACGACGACGAAGCG‑GCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACG‑GCAGATATTGTCATACGCCCCGCGGAATGCTTCGTCCAACGt > 1:190737/1‑250 (MQ=255) ggg‑TTTCCCCCCCAGGCGTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGA‑AGAGGACGACGACGAAGCG‑GCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACG‑GCAGATATTGTCATAAGCCCCGCGGAATGCTTCGTCCAACGTAcc > 1:320544/1‑251 (MQ=255) g‑TTTCCCCCCCAGGCGTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGA‑AGAGGACGACGACGAAGCG‑GCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACG‑GCAGATATTGTCATAAGCCCCGCGGAATGCTTCGTCCAACGTACCt > 1:342015/1‑250 (MQ=255) g‑TTTCCCCCCCAGGCGTTAGCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGA‑AGAGGACGACGACGAAGCG‑GCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACG‑GCAGATATTGTCATAAGCCCCGCGGAATGCTTCGTCCAACGTACCTa < 1:72907/251‑1 (MQ=255) ttCCCCCCCAGGCGTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGA‑AGAGGACGACGACGAAGCG‑GCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACG‑GCAGATATTGTCATAAGCCCCGCGGAATGCTTCGTCCAACGTACCTATg > 1:228862/1‑251 (MQ=255) tCCCCCCCAGGAGTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGA‑AGAGGACGACGACGAAGCG‑GCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATCGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCAAGTGTCGCGGCGCTATTACGTGAAGCACG‑GCAGATATTGTCATAAGCCCCGCGGAATGCTTCGTCCAACGTACCTATGc > 2:223995/1‑251 (MQ=255) cccccccAGGTGTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGA‑AGAGGACGACGACGAAGCG‑TCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCTATTCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACG‑GCAGATATTGTCATAAGCCTCGCGGAATGCTTCGTCCAACGTACCTATGc < 2:406072/250‑1 (MQ=255) cccccccAGGCGTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGA‑AGAGGACGACGACGAAGCG‑GCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACG‑GCAGATATTGTCATAAGCCCCGCGGAATGCTTCGTCCAACGTACCTATGCt < 2:559217/251‑1 (MQ=255) ccccAGGCGTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGA‑AGAGGACGACGACGAAGCG‑GCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACG‑GCAGATATTGTCATAAGCCCCGCGGAATGCTTCGTCCAACGTACCTATGCTGGt > 1:565297/1‑251 (MQ=255) ccAGGCGTTATCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGA‑AGAGGACGACGACGAAGCG‑GCGACTGTCTGGTCCGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACG‑GCAGATATTGTCATAAGCCCCGCGGAATGCTTCGTCCAACGTACCTATGCTGGTc > 2:344824/1‑250 (MQ=255) cAGGCGTTATCCGGCACGCTGCCCGATGGAGCCCAGAATTACCTCCCCTCCTCCCGACTCCCCCGA‑ACAGGACGACGACTTAGCA‑GCCACTGCCTCGTCAGCTTCAGAGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCATCGTTGCGCATTCCAATCGCCGGTGGCGCGACGCTATCACGAGACGC‑CGTGCCGCTATTGTCATAATCACCGCGAAATGCTACGTccgacataactctactgctcac > 2:190852/1‑231 (MQ=255) | CATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGG‑TTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGA‑AGAGGACGACGACGAAGCG‑GCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACG‑GCAGATATTGTCATAAGCCCCGCGGAATGCTTCGTCCAACGTACCTATGCTGGTCAA > NC_000913/3270261‑3270738 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |