Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,084,330 | C→T | A42T (GCA→ACA) | tsuB ← | putative thiosulfate sulfurtransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,084,330 | 0 | C | T | 97.8% | 150.4 / NA | 46 | A42T (GCA→ACA) | tsuB | putative thiosulfate sulfurtransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (24/21); minor base G (0/1); total (24/22) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.78e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
AATTGCAGATGCTGGTACAACAATATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGCCTGGGTGCAATCAAACTCAATCACTAACTCATCGCCGCTGACCATTTCTGCCAGAGCTGCTTTTGCTTCTATGAGTGGAAACGGACAGACCTGCGTCACCACATCCAGCTTTTTAATCACCATCTTTACACCTTACTTAATTTGCCGCAGCAGTTGCCAGTCGCGCCTTACGCTGCGGTCGAACATACACAAGCCAGGACGCAGTCCAGACTCCGAGAATCATAAATACAAGGCCAA > NC_000913/2084092‑2084567 | aaTTGCAGATGCTGGTACAACAATATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCACTGTTAAAAGCACTTTGCCCGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGACTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAAAGCTGCGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCAACCATGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATTTCCTTCTTCTGCCGCCCAATTTGGGATTGCTTCCGTTGTCTGGGAGCAATc > 1:335444/1‑251 (MQ=255) acaacaATATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCCCTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGTCTGGGTGCAATCAAACTCAATCACTaa < 1:184271/250‑1 (MQ=255) acaacaATATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGTCTGGGTGCAATCAAACTCAATCACTAAc > 1:123450/1‑251 (MQ=255) aaTATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCATTACGCGGAAGAGATTTTCTAATTTGAAGGCTCCGCCGCTGGTACTGCGGAGGACAATGTTGATTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTTATAATCGGTGATGGCATGTCTTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGTCTGGGTGCAATCAAACTCAATCACTAACTCATc < 1:267229/251‑1 (MQ=255) atatGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGTCTGGGTGCAATCAAACTCAATCACTAACTCATcg < 1:297642/251‑1 (MQ=255) tatGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGTCTGGGTGCAATCAAAATCAATCACTAACTCATcgc > 1:560820/1‑251 (MQ=255) ccGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGTCTGGGTGCAATCAAACTCAATCACTAACTCATCGCCGCt > 1:329507/1‑251 (MQ=255) aCAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCCCTGTGGGATTGCTTCAGTTGTCTGGGTGCAATCAAACTCAATCACTAACTCATCGCCGCTGCCCAt > 1:52834/1‑251 (MQ=255) aaGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGGGTCAGGCTTTTTGCACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTTTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGTCTGGGTGCAATCAAACTCAATCACTAACTCATCGCCGCTGACCATTTCTGcc > 2:278393/1‑249 (MQ=255) gTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGTCTGGGTGCAATCAAACTCAATCACTAACTCATCGCCGCTGACCATTTCTGCCagag < 1:542603/251‑1 (MQ=255) 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cggcggAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGTCTGGGTGCAATCAAACTCAATCACTAACTCATCGCCGCTGACCATTTCTGCCAGAGCTGCTTTTGCTTCTATGAGTGGAAACGGACAGACCTGCGTCACCACATCCAGCTTTTTAATCACCATCtt > 2:118010/1‑251 (MQ=255) ggaggaCAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGTCTGGGTGCAATCAAACTCAATCACTAACTCATCGCCGCTGACCATTTCTGCCAGAGCTGCTTTTGCTTCTATGAGTGGAAACGGACAGACCTGCGTCACCACATCCAGCTTTTTAATCACCATCTTTac > 1:497409/1‑250 (MQ=255) gaggaCAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGTCTGGGTGCAATCAAACTCAATCACTAACTCATCGCCGCTGACCATTTCTGCCAGAGCTGCTTTTGCTTCTATGAGTGGAAACGGACAGACCTGCGTCACCACATCCAGCTTTTTAATCACCATCTTTgcac > 2:294954/1‑251 (MQ=255) cAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCACACTGTGGGATTGCTTCAGTTGTCTGGGTGCAATCAAACTCAATCACTAACTCATCGCCGCTGACCATTTCTGCCAGAGCTGCTTTTGCTTCTATGAGTGGAAACGGACAGACCTGCGTCACCACCTCCCGCTTTTTCATCACCATCTTTACACcttac > 2:255832/1‑251 (MQ=255) cAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGTCTGGGTGCAATCAAACTCAATCACTAACTCATCGCCGCTGACCATTTCTGCCAGAGCTGCTTTTGCTTCTATGAGTGGAAACGGACAGACCTGCGTCACCACATCCAGCTTTTTAATCACCATCTTTACACCTTACTTAATTTGcc < 2:329507/250‑1 (MQ=255) tCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGTCTGGGTGCAATCAAACTCAATCACTAACTCATCGCCGCTGACCATTTCTGCCAGAGCTGCTTTTGCTTCTATGAGTGGAAACGGACAGACCTGCGTCACCACATCCAGCTTTTTAATCACCATCTTTACACCTTACTTAATTTGCCGCAGCAGTTGCCAGTCGCGCCtt > 1:98844/1‑251 (MQ=255) ccACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGTCTGGGTGCAATCAAACTCAATCACTAACTCATCGCCGCTGACCATTTCTGCCAGAGCTGCTTTTGCTTCTATGAGTGGAAACGGACAGACCTGCGTCACCACATCCAGCTTTTTAATCACCATCTTTACACCTTACTTAATTTGCCGCAGCAGTTGCCAGTCGCGCCtt > 1:22525/1‑250 (MQ=255) gCTGCATCGCCAATCTTCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGTCTGGGTGCAATCAAACTCAATCACTAACTCATCGCCGCTGACCATTTCTGCCAGAGCTGCTTTTGCTTCTATGAGTGGAAACGGACAGACCTGCGTCACCACAGCCAGCTTTGTAATCACCATCTTTACACCTTACTTAATTTTCCGCAGCAGTTGCCAGTcgcg < 2:275337/242‑1 (MQ=255) gCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGTCTGGGTGCAATCAAACTCAATCACTAACTCATCGCCGCTGACCATTTCTGCCAGAGCTGCTTTTGCTTCTATGAGTGGAAACGGACAGACCTGCGTCACCACATCCAGCTTTTTAATCACCATCTTTACACCTTACTTAATTTGCCGCAGCAGTTGCCAGTcgcg > 1:275337/1‑242 (MQ=255) gcagcGCCAATCTGCTGAGAATCGGTGATGGCATGGCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGTCTGGGTGCAAGCAAACTCAATCACTAAATCATCGCCGCTGACCATTTCTGCCAGAGCTGCTTTTGCTTCTATGAGTGGAAACGGACAGACCTGCGTCACCACAGCCAGCTTTTTAATCACCATCTTTACACCTTACTTAATTTGCCGCCGCAGTTGCCAGTCGCGCCTAACGCTg < 2:112012/245‑1 (MQ=255) cGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGTCTGGGTGCAATCAAACTCAATCACTAACTCATCGCCGCTGACCATTTCTGCCAGAGCTGCTTTTGCTTCTATGAGTGGAAACGGACAGACCTGCGTCACCACATCCAGCTTTTTAATCACCATCTTTACACCTTACTTAATTTGCCGCAGCAGTTGCCAGTCGCGCCTTACGCTGCGGTc < 2:98844/250‑1 (MQ=255) ctgctgATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGTCTGGGTGCAATCAAACTCAATCACTAACTCATCGCCGCTGACCATTTCTGCCAGAGCTGCTTTTGCTTCTATGAGTGGAAACGGACAGACCTGCGTCACCACATCCAGCTTTTTAATCACCATCTTTACACCTTACTTAATTTGCCGCAGCAGTTGCCAGTCGCGCCTTACGCTGCGGTCGAACATac > 2:318005/1‑251 (MQ=255) ctgATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGTCTGGGTGCAATCAAACTCAATCACTAACTCATCGCCGCTGACCATTTCTGCCAGAGCTGCTTTTGCTTCTATGAGTGGAAACGGACAGACCTGCGTCACCACATCCAGCTTTTTAATCACCATCTTTACACCTTACTTAATTTGCCGCAGCAGTTGCCAGTCGCGCCTTACGCTGCGGTCGAACATacac > 2:105728/1‑250 (MQ=255) gATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGTCTGGGTGCAATCAAACTCAATCACTAACTCATCGCCGCTGACCATTTCTGCCAGAGCTGCTTTTGCTTCTATGAGTGGAAACGGACAGACCTGCGTCACCACATCCAGCTTTTTAATCACCATCTTTACACCTTACTTAATTTGCCGCAGCAGTTGCCAGTCGCGCCTTACGCTGCGGTCGAACATAcaca < 2:158711/249‑1 (MQ=255) gATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGTCTGGGTGCAATCAAACTCAATCACTAACTCATCGCCGCTGACCATTTCTGCCAGAGCTGCTTTTGCTTCTATGAGTGGAAACGGACAGACCTGCGTCACCACATCCAGCTTTTTAATCACCATCTTTACACCTTACTTAATTTGCCGCAGCAGTTGCCAGTCGCGCCTTACGCTGCGGTCGAACATACACaa < 1:577706/250‑1 (MQ=255) tAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGTCTGGGTGCAATCAAACTCAATCACTAACTCATCGCCGCTGACCATTTCTGCCAGAGCTGCTTTTGCTTCTATGAGTGGAAACGGACAGACCTGCGTCACCACATCCAGCTTTTTAATCACCATCTTTACACCTTACTTAATTTGCCGCAGCAGTTGCCAGTCGCGCCTTACGCTGCGGTCGAACATACACAAGcc > 1:7204/1‑251 (MQ=255) tAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGTCTGGGTGCAATCAAACTCAATCACTAACTCATCGCCGCTGACCATTTCTGCCAGAGCTGCTTTTGCTTCTATGAGTGGAAACGGACAGACCTGCGTCACCACATCCAGCTTTTTAATCACCATCTTTACACCTTACTTAATTTGCCGCAGCAGTTGCCAGTCGCGCCTTACGCTGCGGTCGAACATACACAAGcc > 1:12785/1‑251 (MQ=255) gTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGTCTGGGTGCAATCAAACTCAATCACTAACTCATCGCCGCTGACCATTTCTGCCAGAGCTGCTTTTGCTTCTATGAGTGGaa > 1:586797/1‑130 (MQ=255) gTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGTCTGGGTGCAATCAAACTCAATCACTAACTCATCGCCGCTGACCATTTCTGCCAGAGCTGCTTTTGCTTCTATGAGTGGAAACGGACAGACCTGCGTCACCACATCCAGCTTTTTAATCACCATCTTTACACCTTACTTAATTTGCCGCAGCAGTTGCCAGTCGCGCCTTACGCTGCGGTCGAACATACACAAGCCAGGACg < 2:457259/251‑1 (MQ=255) gTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGTCTGGGTGCAATCAAACTCAATCACTAACGCAGCGCCGCTGACCATTTCTGCCAGAGCTGCTTTTGCTTCTATGAGTGGaa < 2:586797/130‑1 (MQ=255) gATGGCATGGCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGTCTGGGTGCAATCAAACTCAATCACTAACTCATCGCCGCTGACCATTTCTGCCAGAGCTGCTTTTGCTTCTATGAGTGGAAACGGACAGACCTGCGTCACCACATCCAGCTTTGTAAGCACCATCTTTACACCGTACTTAATTTGCCGCAGCAGTTTCCAGTCGCGCCTTACGCTGCGGTCGAACATACACAAGCCAGGACGCa < 1:251251/251‑1 (MQ=255) tcttctGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGTCTGGGTGCAATCAAACTCAATCACTAACTCATCGCCGCTGACCATTTCTGCCAGAGCTGCTTTTGCTTCTATGAGTGGAAACGGACAGACCTGCGTCACCACATCCAGCTTTTTAATCACCATCTTTACACCTTACTTAATTTGCCGCAGCAGTTGCCAGTCGCGCCTTACGCTGCGGTCGAACATACACAAGCCAGGACGCAGTCCAGACTcc < 1:118010/249‑1 (MQ=255) ctGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGTCTGGGTGCAATCAAACTCAATCACTAACTCATCGCCGCTGACCATTTCTGCCAGAGCTGCTTTTGCTTCTATGAGTGGAAACGGACAGACCTGCGTCACCACATCCAGCTTTTTAATCACCATCTTTACACCTTACTTAATTTGCCGCAGCAGTTGCCAGTCGCGCCTTACGCTGCGGTCGAACATACACAAGCCAGGACGCAGTCCAGACTCCGAGAAt > 2:8304/1‑251 (MQ=255) 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aTTGCTTCAGTTGGCTGGGTGCAATCAAACTCAATCACTAACTCATCGCCGCTGACCATTTCTGCCAGAGCTGCTTTTGCTTCTATGAGTGGAAACGGACAGACCTGCGTCACCACATCCAGCGTTTTAATCACCATCTTTACACCTTACTTAATTTGCCGCAGCAGTTGCCAGTCGCGCCTTACGCTGCGGTCGAACATACACAAGCCAGGACGCAGTCCAGACTCCGAGAATCATAAATACAAGGCCaa < 1:255832/251‑1 (MQ=255) | AATTGCAGATGCTGGTACAACAATATGCCGATGACAAAGAGAAAGTGGCGCTGTTAAAAGCACTTTGGCAGTACGCGGAAGAGATTGTCTAATTTGAAGCCTCCGCCGCTGGTACGGCGGAGGACAATGTTGAGTCAGGCTTTTTGAACGGTGATGCTCCACGCTGCATCGCCAATCTGCTGATAATCGGTGATGGCATGTCCTTCTTCTGCCGCCCACTGTGGGATTGCTTCAGTTGCCTGGGTGCAATCAAACTCAATCACTAACTCATCGCCGCTGACCATTTCTGCCAGAGCTGCTTTTGCTTCTATGAGTGGAAACGGACAGACCTGCGTCACCACATCCAGCTTTTTAATCACCATCTTTACACCTTACTTAATTTGCCGCAGCAGTTGCCAGTCGCGCCTTACGCTGCGGTCGAACATACACAAGCCAGGACGCAGTCCAGACTCCGAGAATCATAAATACAAGGCCAA > NC_000913/2084092‑2084567 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |