Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 157,585 | C→T | D50N (GAT→AAT) | folK ← | 2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑ hydroxymethyldihydropteridine diphosphokinase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 157,585 | 0 | C | T | 98.4% | 215.5 / NA | 65 | D50N (GAT→AAT) | folK | 2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑ hydroxymethyldihydropteridine diphosphokinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (42/21); total (43/22) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 |
ACAGCATAAATCCACGATTCTTCATATCGTAGTGCGGAACGGTCAGGCGTTCAGTATTTATCACTTCATTACCAAACAGCATGATGTCGAGATCCAGCGTGCGTGGTCCCCAGCGTTCAGCTTTGCGGACGCGACCTTGCTGCAATTCAATACGCTGTGTGTGATTGAGTAGCTCTTCAGGTGCAAGAGAGGTTTCCAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATCTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCATCCCTTTTTGGT > NC_000913/157354‑157829 | acaGCATAAATCCACGATTCTTCATATCGTAGTGCGGAACGGTCAGGCGTTCAGTATTTATCACTTCATTACCAAACAGCATGATGTCGAGATCCAGCGTGCGTGGTCCCCAGCGTTCAGCTTTGCGGACGCGACCTTGCTGCAATTCAATACGCTGTGTGTGATTGAGTAGCTCTTCAGGTGCAAGAGAGGTTTCCAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATTTTGCGGCCCCAGCGGTggg > 1:220900/1‑251 (MQ=255) gCATAAATCCACGATTCTTCATATCGTAGTGCGGAACGGTCAGGCGTTCAGTATTTATCACTTCATTACCAAACAGCATGATGTCGAGATCCAGCGTGCGTGGTCCCCAGCGTTCAGCTTTGCGGACGCGACCTTGCTGCAATTCAATACGCTGTGTGTGATTGAGTAGCTCTTCAGGTGCAAGAGAGGTTTCCAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATTTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTg > 1:238693/1‑251 (MQ=255) aaaTCCACGATTCTTCATATCGTAGTGCGGAACGGTCAGGCGTTCAGTATTTATCACTTCATTACCAAACAGCATGATGTCGAGATCCAGCGTGCGTGGTCCCCAGCGTTCAGCTTTGCGGACGCGACCTTGCTGCAATTCAATACGCTGTGTGTGATTGAGTAGCTCTTCAGGTGCAAGAGAGGTTTCCAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATTTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCggg > 1:158698/1‑250 (MQ=255) aaaTCCACGATTCTTCATATCGTAGTGCGGAACGGTCAGGCGTTCAGTATTTATCACTTCATTACCAAACAGCATGATGTCGAGATCCAGCGTGCGTGGTCCCCAGCGTTCAGCTTTGCGGACGCGACCTTGCTGCAATTCAATACGCTGTGTGTGATTGAGTAGCTCTTCAGGTGCAAGAGAGGTTTCCAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATTTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGt > 1:328242/1‑251 (MQ=255) aaaTCCACGATTCTTCATATCGTAGTGCGGAACGGTCAGGCGTTCAGTATTTATCACTTCATTACCAAACAGCATGATGTCGAGATCCAGCGTGCGTGGTCCCCAGCGTTCAGCTTTGCGGACGCGACCTTGCTGCAATTCAATACGCTGTGTGTGATTGAGTAGCTCTTCAGGTGCAAGAGAGGTTTCCAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATTTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGt > 1:136709/1‑251 (MQ=255) aaaTCCACGATTCTTCATATCGTAGTGCGGAACGGTCAGGCGTTCAGTATTTATCACTTCATTACCAAACAGCATGATGTCGAGATCCAGCGTGCGTGGTCCCCAGCGTTCAGCTTTGCGGACGCGACCTTGCTGCAATTCAATACGCTGTGTGTGATTGAGTAGCTCTTCAGGTGCAAGAGAGGTTTCCAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATTTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGt > 2:435216/1‑251 (MQ=255) aaaTCCACGATTCTTCATATCGTAGTGCGGAACGGTCAGGCGTTCAGTATTTATCACTTCATTACCAAACAGCATGATGTCGAGATCCAGCGTGCGTGGTCCCCAGCGTTCAGCTTTGCGGACGCGACCTTGCTGCAATTCAATACGCTGTGTGTGATTGAGTAGCTCTTCAGGTGCAAGAGAGGTTTCCAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATTTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGt < 1:274940/251‑1 (MQ=255) ccACGATTCTTCATATCGTAGTGCGGAACGGTCAGGCGTTCAGTATTTATCACTTCATTACCACACAGCATGATGTCGAGATCCAGCGTGCGTGGTCCCCAGCGTTCAGCTTTGCGGACGCGACCTTGCTGCAATTCAATACGCTGTGTGTGATTGAGTAGCTCTTCAGGTGCAAGAGAGGTTTCCAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATTTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGAGGTaaa > 2:67691/1‑250 (MQ=255) cACGATTCTTCATATCGTAGTGCGGAACGGTCAGGCGTTCAGTATTTATCACTTCATTACCAAACAGCATGATGTCGAGATCCAGCGTGCGTGGTCCCCAGCGTTCAGCTTTGCGGACGCGACCTTGCTGCAATTCAATACGCTGTGTGTGATTGAGTAGCTCTTCAGGTGCAAGAGAGGTTTCCAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATTTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAAc > 1:391336/1‑251 (MQ=255) atatCGTAGTGCGGAACGGTCAGGCGTTCAGTATTTATCACTTCATTACCAAACAGCATGATGTCGAGATCCAGCGTGCGTGGTCCCCAGCGTTCAGCTTTGCGGACGCGACCTTGCTGCAATTCAATACGCTGTGTGTGATTGAGTAGCTCTTCAGGTGCAAGAGAGGTTTCCAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATTTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACgaagaa > 2:118548/1‑246 (MQ=255) 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agaTCCAGCGTGCGTGGTCCCCAGCGTTCAGCTTTGCGGACGCGACCTTGCTGCAATTCAATACGCTGTGTGTGATTGAGTAGCTCTTCAGGTGCAAGAGAGGTTTCCAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATTTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGGGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGc > 2:464241/1‑240 (MQ=255) tCCAGCGTGCGTGGTCCCCAGCGTTCAGCTTTGCGGCAGCGACCTTGCTGCAATTCAATACGCTGTGTGGGATTGAGTAGCTCGTCAGGTGCAAGAGCGGTTTCCAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATTTTGCGGCTGCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGACAAGGTAAGCATGTGGCTTTCCGGGTTATCGCCTAATGTTTTCAGGGCAGCTGTGGCCTGACCCAGCGGAGGGGc > 2:588016/1‑251 (MQ=255) ccAGCGTGCGTGGTCCCCAGCGTTCAGCTTTGCGGACGCGACCTTGCTGCAATTCAATACGCTGTGTGTGATTGAGTAGCTCTTCAGGTGCAAGAGAGGTTTCCAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATTTTGCGGCCCTAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCGCCAGCGGAGAGGcc < 1:104139/251‑1 (MQ=255) ccAGCGTGCGTGGTCCCCAGCGTTCAGCTTTGCGGACGCGACCTTGCTGCAATTAAATACGCTGTGTGTGATTGAGTAGCTCTTCAGGTGCAAGAGAGGTTTCCAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATTTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCTTTGACCTGCTCCCGAGGAGAGGcc > 2:322534/1‑251 (MQ=255) gtgcgtgGTCCCCAGCGTTCAGCTTTGCGGACGCGACCTTGCTGCAATTCAATACGCTGTGTGTGATTGAGTAGCTCTTCAGGTGCAAGAGAGGTTTCCAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATTTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGAtt > 1:283739/1‑251 (MQ=255) tCAGCTTTGCGGACGCGACCTTGCTGCAATTCAATACGCTGTGTGTGATTGAGTAGCTCTTCAGGTGCAAGAGAGGTTTCCAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATTTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAatat < 2:158698/250‑1 (MQ=255) aGCTTTGCGGACGCGACCTTGCTGCAATTCAATACGCTGTGTGTGATTGAGTAGCTCTTCAGGTGCAAGAGAGGTTTCCAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATTTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACg < 1:549038/251‑1 (MQ=255) aGCTTTGCGGACGCGACCTTGCTGCAATTCAATACGCTGTGTGTGATTGAGTAGCTCTTCAGGTGCAAGAGAGGTTTCCAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGAAATCGGGTTGATTTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGCGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACg > 1:365860/1‑251 (MQ=255) gCTTTGCGGACGCGACCTTGCTGCAATTCACTACGCTGTGTGTGATTGAGTAGCTCTTCAGGTGCAAGAGAGGTTTCCAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATTTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGc > 2:142881/1‑251 (MQ=255) 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ggTGCAAGAGAGGTTTCCAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATTTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTacgacgc > 2:125020/1‑250 (MQ=255) ggTGCAAGAGAGGTTTCCAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATTTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTacgacg > 1:219237/1‑250 (MQ=255) gTGCAAGAGAGGGTTCCAGCGCCACGGCTGCGTGTAAGGAATCGGGTTGATTTTGCGGCCCCAGCGGTGGGTTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGTGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTacgacgac < 1:588016/251‑1 (MQ=255) ggTTTCCAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATTTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACgg > 1:254537/1‑251 (MQ=255) ccACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATTTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCa < 1:538644/251‑1 (MQ=255) cACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATTTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAg < 1:441393/251‑1 (MQ=255) aCGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATTTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGc > 1:113021/1‑251 (MQ=255) cTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATTTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGt > 2:144466/1‑251 (MQ=255) gCGTTTAAGTAATCGGGTTGATTTTGCGGCCAAAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGCAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGGACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGCCGCGGGTCCGGATCTTCATCCAGCTCgatg > 2:60649/1‑248 (MQ=255) ttAAGTAATCGGGTTGATTTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGc > 1:284178/1‑250 (MQ=255) gTTGATTTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACTACGAGTACGACGACGCgg < 1:155254/210‑1 (MQ=255) gTTGATTTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCgg > 2:155254/1‑210 (MQ=255) gTTGATTTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCGCGTTGAGCATCCCTTTTTGGt < 1:478316/251‑1 (MQ=255) | ACAGCATAAATCCACGATTCTTCATATCGTAGTGCGGAACGGTCAGGCGTTCAGTATTTATCACTTCATTACCAAACAGCATGATGTCGAGATCCAGCGTGCGTGGTCCCCAGCGTTCAGCTTTGCGGACGCGACCTTGCTGCAATTCAATACGCTGTGTGTGATTGAGTAGCTCTTCAGGTGCAAGAGAGGTTTCCAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATCTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCATCCCTTTTTGGT > NC_000913/157354‑157829 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |