Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,297,496 | G→A | A209V (GCT→GTT) | adhE ← | fused acetaldehyde‑CoA dehydrogenase and iron‑dependent alcohol dehydrogenasealdehyde/alcohol dehydrogenase AdhE |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,297,496 | 0 | G | A | 97.9% | 145.1 / NA | 47 | A209V (GCT→GTT) | adhE | fused acetaldehyde‑CoA dehydrogenase and iron‑dependent alcohol dehydrogenasealdehyde/alcohol dehydrogenase AdhE |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (27/19); minor base C (1/0); total (28/19) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GTTTTTCAGGATAACATCCTGAACAGCTTTCAGCTCTTTACCCTGCAACAGATAGCCGCCGTGGGTTGCAAAACGTTCACGTACAGCGTCATAAACAGAGTCAACAACAACAACAGACTGTTCAGAAGCACAGATTACGCCGTTGTCGAAGGTTTTGGACATCAGTACAGATGCAACTGCACGTTTGATATCAGCAGTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACAGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCTTTGTTGGTGGCATCTTTTGCACGCGGGTGCGGGGAGAAGATAATGGCGTTACGGGTCTTC > NC_000913/1297255‑1297738 | gTTTTTCAGGATAACATCCTGAACAGCTTTCAGCTCTTTACCCTGCAACAGATAGCCGCCGTGGGTTGCAAAACGTTCACGTACAGCGTCATAAACAGAGTCAACAACAACAACAGACTGTTCAGAAGCACAGATTACGCCGTTGTCGAAGGTTTTGGACATCAGTACAGATGCAACTGCACGTTTGATATCAGCAGTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGCTAACTGGTTTAc > 1:4108/1‑251 (MQ=255) cAGGATAACATCCTGAACAGCTTTCAGCTCTTTACCCTGCAACAGATAGCCGCCGTGGGTTGCAAAACGTTCACGTACAGCGTCATAAACAGAGTCAACAACAACAACAGACTGTTCAGAAGCACAGATTACGCCGTTGTCGAAGGTTTTGGACATCAGTACAGATGCAACTGCACGTTTGATATCAGCAGTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAACTGGTTTACCGGAGc < 1:84660/251‑1 (MQ=255) aaCATCCGGAACAGCTTTCAGCTCTTTGCCCTGCAACAGATAGCCGCCGTGGGTTGCAAAACGTTCACGTACAGCGTCATAAACAGAGTCAACAACAACAACAGACTGTTCAGAAGCACAGATTACGCCGTTGGCGAAGGTTTTGGACATCAGTACAGATGCAACGGCACGGTTGATATCAGCAGTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACGCCGATAACTGGTTTACCGGAGCTGTATg < 2:354130/251‑1 (MQ=255) aCATCCTGAACAGCTTTCAGCTCTTTACCCTGCAACAGATAGCCGCCGTGGGTTGCAAAACGTTCACGTACAGCGTCATAAACAGAGTCAACAACAACAACAGACTGTTCAGAAGCACAGATTACGCCGTTGTCGAAGGTTTTGGACATCAGTACAGATGCAACTGCACGTTTGATATCAGCAGTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCACGCGCCTACACCGATAACTGGTTTACCGGAGCTGTATGc > 2:213074/1‑251 (MQ=255) gAACAGCTTTCAGCTCTTTACCCTGCAACAGATAGCCGCCGTGGGTTGCAAAACGTTCACGTACAGCGTCATAAACAGAGTCAACAACAACAACAGACTGTTCAGAAGCACAGATTACGCCGTTGTCGAAGGTTTTGGACATCAGTACAGATGCAACTGCACGTTTGATATCAGCAGTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAACTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCttt < 1:143386/250‑1 (MQ=255) tCAGCTCTTTACCCTGCAACAGATAGCCGCCGTGGGTTGCAAAACGTTCAAGTACAGCGTCATAAACGGCGACAACAACAACAACAGCCTGTTCAGAAGCACAGATTACGCCGTTGTCGAAGGTTTTGGACATCAGTACAGATGCAACTGCACGTTTGATATCAGCAGTTTCATCGATAACAACTGGAGAGTTGCCCGCGCCTACACCGATAACTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGccc > 1:237982/1‑251 (MQ=255) tctTTACCCTGCAACAGATAGCCGCCGTGGGTTGCAAAACGTTCACGTACAGCGTCATAAACAGAGTCAACAACAACAACAGACTGTTCAGAAGCACAGATTCCGCCGTTGTCGAAGGTTTTGGACATCAGTACAGATGCAACTGCACGTTTGATATCAGCAGTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAACTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGacc > 1:357255/1‑251 (MQ=255) 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aCGTACAGCGTCATAAACAGAGTCAACAACAACAACAGACTGTTCAGAAGCACAGATTACGCCGTTGTCGAAGGTGTTGGACATCAGTACAGATGCAACTGCACGTTTGATAACAGCAGTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACTCCGATAACTGGTTTACCGGAGCTGTAGGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTTATGTCTGGGTGGTGCATCAGTg < 2:237019/251‑1 (MQ=255) tCATAAACAGAGTCAACAACAACCACAGACTGTTCAGAAGCACAGATTACGCCGTTGTCGAAGGTTTTGGACATCAGTACAGATGCAACTGCACGTTTGATATCAGCAGTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAACTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCCGGTTGTTGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGAc > 2:119469/1‑249 (MQ=255) aaCAGAGTCAACAACAACAACAGACTGTTCAGAAGCACAGATTACGCCGTTGTCGAAGGTTTTGGACATCAGTACAGATGCAACTGCACGTTTGATATCAGCAGTTTCATCGATAACAACTGGCGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAACTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGAGCGTTAGACAGTTCa > 2:120992/1‑250 (MQ=255) 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tGCCCGCGCCGACACCGATAACTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTGTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGGCTGGGTGGTTCATCAGTGCGTTAGACAGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCTTTGTTGGTGGCATCTTTTGCACGCGGGTGCGGGGAGAAGATAATGGc < 2:357255/250‑1 (MQ=255) cgcCTACACCGATAACTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACAGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCTTTGTTGGTGGCATCTTTTGCACGCGGGTGCGGGGAGAAGATAATGGCGTTACgg > 2:228358/1‑251 (MQ=255) cacCGATAACTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACAGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCTTTGTTGGTGGCATCTTTTGCACGCGGGTGCGGGGAGAAGATAATGGCGTTACGGGTCTTc < 2:424894/251‑1 (MQ=255) cacCGATAACTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACAGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCTTTGTTGGTGGCATCTTTTGCACGCGGGTGCGGGGAGAAGATAATGGCGTTACGGGTCTTc < 1:40882/251‑1 (MQ=255) | GTTTTTCAGGATAACATCCTGAACAGCTTTCAGCTCTTTACCCTGCAACAGATAGCCGCCGTGGGTTGCAAAACGTTCACGTACAGCGTCATAAACAGAGTCAACAACAACAACAGACTGTTCAGAAGCACAGATTACGCCGTTGTCGAAGGTTTTGGACATCAGTACAGATGCAACTGCACGTTTGATATCAGCAGTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACAGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCTTTGTTGGTGGCATCTTTTGCACGCGGGTGCGGGGAGAAGATAATGGCGTTACGGGTCTTC > NC_000913/1297255‑1297738 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |