| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 4,433,459 | C→T | G189D (GGC→GAC) | qorB ← | NAD(P)H:quinone oxidoreductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 4,433,459 | 0 | C | T | 98.8% | 284.7 / NA | 86 | G189D (GGC→GAC) | qorB | NAD(P)H:quinone oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (56/29); total (56/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.49e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAA‑CAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTC‑TGTTT‑GGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAA‑CGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGCCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACGCCGTGTTCCAGTGCTGCCGGGGCGCTGGCGAGGTAGTTTTCGCTGTACCAGCCGTTGCGCAGCAGGGTGTAAACGA‑TGCCAGAATCAGCCAGCATTTTCTCCGTCTCGATGTGCTCATCGGCGAGGCCGAGCGGGGAGGTATCTG > NC_000913/4433212‑4433705 | cGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAA‑CAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTC‑TGTTT‑GGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAA‑CGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGTCtt > 2:7544/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |