Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,286,033 | C→T | A447T (GCG→ACG) | acs ← | acetyl‑CoA synthetase (AMP‑forming) |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,286,033 | 0 | C | T | 99.0% | 307.7 / NA | 102 | A447T (GCG→ACG) | acs | acetyl‑CoA synthetase (AMP‑forming) |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); major base T (55/45); minor base G (0/1); total (55/47) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.55e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.16e-01 |
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
GTCCCCAGACGGTGACCGGAGACGTTCAGCACGTCGTCCACACGCCCGGTTATCCAGTAATAGCCATCTTCATCGCGACGCGCGCCGTCGCCGCTGAAATACATATTTTTGAAGGTGGAGAAGTAGGTCTGTTCAAAACGTTCGTGATCGCCAAACAGCGTACGCGCCTGACCCGGCCAGGAGTCGGTGATTACCAGGCTACCTTCGGTGGCCCCCTCCAGCGGGTTACCTTCGTTATCGACCAGCGCCGGTTGCAC‑GCCGAAGAACGGACGTGTTG‑CCGAACCGGCTTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCGACCACCGGACATTTCTCGTTGCCGATTTTTTTCCAGTACCACTCCCACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCAT > NC_000913/4285786‑4286279 | gTCCCCAGACGGTGACCGGAGACGTTCAGCACGTCGTCCACACGCCCGGTTATCCAGTAATAGCCATCTTCATCGCGACGCGCGCCGTCGCCGCTGCAATACATATTTTTGAAGGTGGAGAAGTAGGTCTGTTCAAAACGTTCGTGATCGCCAAACAGCGTACGCGCCTGCCCCGGCCAGGAGTCGGTGATTACCAGGCTACCTTCGGTGGCCCCCTCCAGCGGGTTACCTTCGTTATCGACCAGCGTCgg > 2:223157/1‑251 (MQ=255) cccAGACGGTGACCGGAGACGTTCAGCACGTCGTCCACACGCCCGGTTATCCAGTAATAGCCATCTTCATCGCGACGCGCGCCGTCGCCGCTGAAATACATATTTTTGAAGGTGGAGAAGTAGGTCTGTTCAAAACGTTCGTGATCGCCAAACAGCGTACGCGCCTGACCCGGCCAGGAGTCGGTGATTACCAGGCTACCTTCGGTGGCCCCCTCCAGCGGGTTACCTTCGTTATCGACCAGCGTCGGTTg > 1:408012/1‑251 (MQ=255) cccAGACGGTGACCGGAGACGTTCAGCACGTCGTCCACACGCCCGGTTATCCAGTAATAGCCATCTTCATCGCGACGCGCGCCGTCGCCGCTGAAATACATATTTTTGAAGGTGGAGAAGTAGGTCTGTTCAAAACGTTCGTGATCGCCAAACAGCGTACGCGCCTGACCCGGCCAGGAGTCGGTGATTACCAGGCTACCTTCGGTGGCCCCCTCCAGCGGGTTACCTTCGTTATCGACCAGCGTCGGTTg > 1:164515/1‑251 (MQ=255) cccGGAGCCGTTCAGCACGTCGTCCCCACGCCCGGTTATCCAGTAATAGCGATCTTCATCGCGACGCGCGCCGTCGCCGCTGAAATACATATTTTTGAAGGAGGAGAAGTAGGTCTGTTCAAAACGTTCGTGATCGCCAAACAGCGTACCCGCCTGACCCGGCCAGGAGTCGGTGATTACCAGGCTACCTTCGGTGGCCCCCTCCAGCGGGTTACGTTCGTTATCGACCACCGTCGGTTgaactccgc > 2:89362/2‑240 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |