| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 4,139,298 | G→A | A137A (GCC→GCT) | fsaB ← | fructose‑6‑phosphate aldolase 2 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,139,298 | 0 | G | A | 98.2% | 167.6 / NA | 55 | A137A (GCC→GCT) | fsaB | fructose‑6‑phosphate aldolase 2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (26/27); total (27/28) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.89e-01 | |||||||||||
GGCATTCCAGTCGTGTTCGAACTTCTCTATAGCTGACTCTACCGCAGGGGTGT‑TGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTCTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCGGGATTTTCACCACAATACCCGGAATAGCGTCGCGCAGGCGCTTCGCTTCTTCCACCATCCCCTGCGCGTCGCGGCTCATGGTCTG > NC_000913/4139070‑4139534 | ggCATTCCAGTCGTGTTCGAACTTCTCTATAGCTGACTCTACCGCAGGGGTGT‑TGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTCTCCGCCCTGAGCATCTACGCGGTTCACATACg > 2:83627/1‑251 (MQ=255) cAGTCGGGTTCGAACTTCTCTAGAGCGGACTCGCCCGCAGGGG‑GTGTGGGCATTTGTTGCGCTACATCGAAGGGCAGGGTGAGGGATTCTCATCCTGCCAGGAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGATCCGTACGAATGCCGTCTCCGCCCTGAGCAGCTTCGCGGTTAACATACGGAGCAAc < 2:464961/251‑1 (MQ=255) cGTGTTCGAACTTCTCTATAGCTGACTCTACCGCAGGGGTGT‑TGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTCTCCGCCCTGAGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTa < 1:141468/250‑1 (MQ=255) ttCTCTATAGCTGACTCTACCGCAGGGGTGT‑TGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCAAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTCTCCGCCCTGAGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGc > 2:36362/1‑251 (MQ=255) ataGCTGACTCTACCGCAGGGGTGT‑TGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTCTCCGCCCTGAGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAg < 2:31161/248‑1 (MQ=255) aGCTGACTCTACCGCAGGGGTGT‑TGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTCTCCGCCCTGAGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCg < 1:428220/250‑1 (MQ=255) ctctCCCGCAGGTGTGT‑TGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTCTCCGCCCTGAGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTTCCCCTGCCAGTGCGGCtaat > 2:448773/1‑250 (MQ=255) aCCGCAGGGGTGT‑TGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCCGGGTGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTCTCCGCCCTGAGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAAccc > 2:536572/1‑251 (MQ=255) cGCAGGGTTGT‑TGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGGGAGGGATGCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCGGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGGGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTCTCCTCCCGGAGCATCTACGCGGTTAACATACGGATCAACGGATTTTGCCCCTGCCAGTTCCGCTAATAACCCtt < 2:392837/251‑1 (MQ=255) ggggTGT‑TGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTCTCCGCCCTGAGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTgc > 1:373243/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |