Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 3,914,648 | C→T | A185T (GCG→ACG) | glmU ← | fused N‑acetylglucosamine‑1‑phosphate uridyltransferase and glucosamine‑1‑phosphate acetyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,914,648 | 0 | C | T | 98.7% | 260.5 / NA | 79 | A185T (GCG→ACG) | glmU | fused N‑acetylglucosamine‑1‑phosphate uridyltransferase and glucosamine‑1‑phosphate acetyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (36/42); total (37/42) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.68e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 |
CGTACCACGCAGATCAAAACGCGCTGGATCGCGCAGCATAACGCCTGCTAACAGCAGTTTTTCAGCCTGTTCGGACTGATAAACACGCTCCAGACGGGAGAGTTGCAGGCGGTTATTCACGCCTTCTACTTCGCTTAAACGTTGCGGATGAACGGCGACGATTTC‑ACGCCCTTCCTGATACGCCAGCGCAATAATGTCGGTGATGTAGTATTCGCCCTGAGCATTATTGTTGGTCAGCTT‑CGCCAGCCAGCGTTTCATATCTGCGCCGTTGGCAATCAGAATGCC‑GGTGTTGATCTCCTGAATCTGACGCTGCTCGTCGGTGGCATCTTTGTGCTCAACAATGCCGGTAACTTTGCCGTTTTCACGGGTGATACGTCCATAACCGGTCGGATCATCCAGTTTCACCGTCAGCAGACCAATGCCACCCTGCGGTTTAGCATCACGCAGACGCTGGAGTGTTTCGACAGAGATCAGCGGCACGTCGCCG > NC_000913/3914406‑3914892 | cGTACCACGCAGATCAAAACGCGCTGGATCGCGCAGCATAACGCCTGCTAACAGCAGTTTTTCAGCCTGTTCGGACTGATAAACACGCTCCAGACGGGAGAGTTGCAGGCGGTTATTCACGCCTTCTACTTCGCTTAAACGTTGCGGATGAACGGCGACGATTTC‑ACGCCCTTCCTGATACGCCAGCGCAATAATGTCGGTGATGTAGTATTCGCCCTGAGCATTATTGTTGGTCAGCTT‑CGTcagccagc < 1:177479/251‑1 (MQ=255) gTACCACGCAGATCAAAACGCGCTGGATCGCGCAGCATAACGCCTGCTAACAGCAGTTTTTCAGCCTGTTCGGACTGATAAACACGCTCCAGACGGGAGAGTTGCAGGCGGTTATTCACGCCTTCTACTTCGCTTAAACGTTGCGGATGAACGGCGACGATTTC‑ACGCCCTTCCTGATACGCCAGCGCAATAATGTCGGTGATGTAGTATTCGCCCTGAGCATTATTGTTGGTCAGCTT‑CGTCAGCCAGCg < 1:341436/251‑1 (MQ=255) aCCACGCAGATCAAAACGCGCTGGATCGCGCAGCATAACGCCTGCTAACAGCAGTTTTTCAGCCTGTTCGGACTGATAAACACGCTCCAGACGGGAGAGTTGCAGGCGGTTATTCACGCCTTCTACTTCGCTTAAACGTTGCGGATGAACGGCGACGATTTC‑ACGCCCTTCCTGATTCGCCAGCGCAATAATGTCGGTGATGGAGTATTCGCCCTGAGCATTATTGTTGGTCAGCTT‑CGTCAGCCAGCGtt < 1:282486/251‑1 (MQ=255) aTCAAAACGCGCTGGATCGCGCAGCATAACGCCTGCTAACAGCAGTTTATCAGCCTGTTCGGACTGATAAACACGCTCCAGACGGGAGAGTTGCAGGCGGTTATTCACGCCTTCTACTTCGCTTAAACGTTGCGGATGAACGGCGACGATTTC‑ACGCCCTTCCTGATACGCCAGCGCAATAATGTCGGTGATGTAGTATTCGCCCTGAGCATTATTGTTGGTCAGCTT‑CGTCAGCCAGCGTTTCATATCTg < 2:193116/251‑1 (MQ=255) aaaCGCGCTGGATCGCGCAGCATAACGCCTGCTAACAGCAGTTTTTCAGCCTGTTCGGACTGATAAACACGCTCCAGACGGGAGAGTTGCAGGCGGTTATTCACGCCTTCTACTTCGCTTTAACGTTGCGGATGAAAGGCGACGATTTCCAC‑CCCTTCCTGATACGCCAGCGCAATAAAGAAGGTGGTGTAGAATTCCCCCCTAGCATTATTGTTTGTCCACTT‑CGTCAGCCCGCGTTTTCTATCTTCGcc > 1:563892/1‑251 (MQ=255) cgcTGGATCGCGCAGCATAACGCCTGCTAACAGCAGTTTTTCAGCCTGTTCGGACTGATAAACACGCTCCAGACGGGAGAGTTGCAGGCGGTTATTCACGCCTTCTACGTCGCTTAAACGTTGCGGATGAACGGCGACGATTTC‑ACGCCCTGCCTGATTCTCCAGCGCAATAATGTCGGTGATGTAGTATTCGCCCTGAGCATTATTGTTGGTCAGCTT‑CGTCAGCCAGCGTTTCATATCTGCGCCGTTgg < 2:517278/251‑1 (MQ=255) aTCGCGCAGCATAACGCCGGCTAACAGCAGTTTTTCAGCCTGTTCGGACTGATAAACACGCTCCAGACGGGAGAGTTGCAGGCGGTTATTCACGCCTTCTACTTCGCTTAAACGTTGCGGATGAACGGCGACGATTTC‑ACGCCCTGCCTGATACGCCAGCGCAATAATGTCGGTGATGTAGTATTCGCCCTGAGCATTATTGGTGGTCAGCTT‑CGTCAGCCAGCGTTTCATATCTGCGCCGTTGGCAATCa < 2:580393/251‑1 (MQ=255) 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CGTACCACGCAGATCAAAACGCGCTGGATCGCGCAGCATAACGCCTGCTAACAGCAGTTTTTCAGCCTGTTCGGACTGATAAACACGCTCCAGACGGGAGAGTTGCAGGCGGTTATTCACGCCTTCTACTTCGCTTAAACGTTGCGGATGAACGGCGACGATTTC‑ACGCCCTTCCTGATACGCCAGCGCAATAATGTCGGTGATGTAGTATTCGCCCTGAGCATTATTGTTGGTCAGCTT‑CGCCAGCCAGCGTTTCATATCTGCGCCGTTGGCAATCAGAATGCC‑GGTGTTGATCTCCTGAATCTGACGCTGCTCGTCGGTGGCATCTTTGTGCTCAACAATGCCGGTAACTTTGCCGTTTTCACGGGTGATACGTCCATAACCGGTCGGATCATCCAGTTTCACCGTCAGCAGACCAATGCCACCCTGCGGTTTAGCATCACGCAGACGCTGGAGTGTTTCGACAGAGATCAGCGGCACGTCGCCG > NC_000913/3914406‑3914892 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |