Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,384,808 | C→T | K305K (AAG→AAA) | yfbK ← | IPR002035/DUF3520 domain‑containing protein YfbK |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,384,808 | 0 | C | T | 97.4% | 116.0 / NA | 40 | K305K (AAG→AAA) | yfbK | IPR002035/DUF3520 domain‑containing protein YfbK |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); major base T (15/23); minor base G (0/1); total (15/25) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
ACTTTCTGCGCTTCAGAGAGGGTATCAATGTAGCTGTAGTTGCCGTTACCAACATCGGCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCCT‑TCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGAAGGCAATGCAATACGGGAGTCGCCAGCGTAGGTCACGATGGCAATGTTATCCTGCTCACGAAGTTCTTTGACCAATAATTTCAACGAAGACTGGATAAGTGGCAAACGTTCATCAGAAATC > NC_000913/2384569‑2385042 | aCTTTCTGCGCTTCAGAGAGGGCATCAATGTAGCTGTAGTTGCCGTTACCAACATCGGCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTT‑TCGTCGCctg > 2:9554/1‑251 (MQ=255) agagagGGTATCAATGTAGCTGTAGTTGCCGTTACCAACATCGGCAATTCGCCCCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTT‑TCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGtt > 2:344138/1‑251 (MQ=255) gTATCAATGTAGCTGTAGTTGCCGTTACCAACATCGGCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTT‑TCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGccc < 1:495385/251‑1 (MQ=255) aGCTGTAGTTGCCGTTACCAACATCGGCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTT‑TCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCAcc < 1:451974/247‑1 (MQ=255) aGCTGTAGTTGCCGTTACCAACATCGGCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTT‑TCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCAcc > 2:451974/1‑247 (MQ=255) ggCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCTCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAATTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTT‑TCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCg < 1:396295/251‑1 (MQ=255) catcatTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTT‑TCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGACTCAATTGCgg > 1:37224/1‑251 (MQ=255) tGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTT‑TCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCAt > 1:266226/1‑227 (MQ=255) ggCCTCGTTGTAATTGCTATCCCCCCCGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTT‑TCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTCCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCAt < 2:266226/226‑1 (MQ=255) cGTTGTAATTGCTATTCCCCCCGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGCCTCCAGCTGTTTTTTGACCATCGATTCAATCGATTTTGGACCGTCAATGCCAACGTTAAAGCCGCCGTCAGTGGTTAATAAAATGCGAGTGATGCCGCCTTTAA‑AACCCCTT‑TCCTCGCCTGGTGTTAGGCCATTTCCAGCCCGGCTCCGCCATTGGTCCTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCg < 1:93065/251‑1 (MQ=255) tttGTAATTGCTATTCCCACCGCCAAACGTCGACAGAGTAACCCCAGACCCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATACAATCTATTTTGAATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGTCTAATAAAGTGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTT‑TCGTCGCCTGCTGATAATCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTcc < 2:217281/249‑1 (MQ=255) gTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTT‑TCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCg > 2:246569/1‑251 (MQ=255) tGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTT‑TCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGc < 1:148667/250‑1 (MQ=255) 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tATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTT‑TCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGa > 2:78743/1‑248 (MQ=255) tATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTAAAAGCCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTT‑GCGTCGCCGGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGa < 1:78743/248‑1 (MQ=255) cGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGAGCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAA‑CCCCTGTCTTCGCCGGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTTCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGAAGgca < 1:497329/251‑1 (MQ=255) 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tGGATCGTCAATGCAAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGAGATTGATGCAGCCCTTAATAAACCCTT‑TCGTAGACTGATGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGAAGGCAATGCAATACGGGAGTCGCCAGCGTAGGTCACGATGGCAATGTTATCCTGCTCACGa > 1:85806/1‑250 (MQ=255) tGGATAGTCAATGCAAAAGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTACTTAACCCTT‑TCGTCGCCTGCTGATAAGGCAGTTCCCGCCAGGCACCGCCATTGGTACTGACTTCGGCATCCAGCGCATCCATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGACGGCAATGCAATACGGGAGTCGCCAACGTAGGTCACGATGGCCATGTTATCCTGATCACGa > 2:520803/1‑250 (MQ=255) ggATCGTCAATGCCACCTGTAAAGTCCCCTTAAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTT‑TCGTCGCCTGCTGAAAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGAAGGCAATGCAATACGGGAGTCGCCAGCGTAGGTCACGATGGCAATGTTATCCTGCTCACGAAg < 1:415164/251‑1 (MQ=255) 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aaTGCGATTGATGCCGCCCTAAATAACCCCTT‑TCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCCCCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGAAGGCAATGCAATACGGGAGTCGCCAGCGTAGGTCACGATGGCAATGTTATCCTGCTCACGAAGTTCTTTGACCAATAATGTCTACGAAGACTGGATAAGTGGCAAAc < 2:36389/251‑1 (MQ=255) cgccCTTAATAAACCCTT‑GCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGAAGGCAATGCAATACGGGAGTCGCCAGCGTAGGTCACGATGGCAATGTTATCCTGCTCACGAAGTTCTTTGGCCAATAATTTCAACGAAGACTGGATAAGTGGCAAACGTTCATCAGAAATc < 1:344138/251‑1 (MQ=255) | ACTTTCTGCGCTTCAGAGAGGGTATCAATGTAGCTGTAGTTGCCGTTACCAACATCGGCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCCT‑TCGTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGAAGGCAATGCAATACGGGAGTCGCCAGCGTAGGTCACGATGGCAATGTTATCCTGCTCACGAAGTTCTTTGACCAATAATTTCAACGAAGACTGGATAAGTGGCAAACGTTCATCAGAAATC > NC_000913/2384569‑2385042 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |