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1:221353‑M2/145‑110 (MQ=255) ccTCTCCCCAGTCAATTCTTGCTAAATCTCTCGCTTgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggtgactcacatgacaaaaacagtatcaaccagtaaaaaaccccgtaaacagcat > 2:221353‑M2/1‑36 (MQ=255) gtgtccatattacgtgggtaggatcaGCTTTACTAAAATTCATCGTCAATGTATTGGCTTTAACCTGCGCTCCGCGCTCTGCTTGTGAAGTTGAACGAAAAAAATGCACTAAGTATGCACTGACTGCATAGTCACGGCAGCGGGCTACTACATCGCGTAAACTCCAGTTAATCGCATTGAGGCGAAGAGAAAGAGGAATTGCGATTTTGCTCCCGGTCTTTTCCTGAATGACATGAAGATGATCATccc < 1:495909‑M2/223‑1 (MQ=255) gtgtccatattacgtgggtaggatcaGCTTTACTAAAATTCATCGTCAATGTATTGGCTTTAACCTGCGCTCCGCGCTCTGCTTGTGAAGTTGAACGAAAAAAATGCACTAAGTATGCACTGACTGCATAGTCACGGCAGCGGGCTACTACATCGCGTAAACTCCAGTTAATCGCATTGAGGCGAAGAGAAAGAGGAATTGCGATTTTGCTCCCGGTCTTTTCCTGAATGACATGAAGATGATCATccc < 1:356531‑M2/223‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |