| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3583428 = | NA (NA) | 38 (1.440) | 35/488 | 0.1 | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 4620757 | 0 (0.000) | coding (1155/1224 nt) | deoB | phosphopentomutase | |||||
CTTCGACTCTTCCTGGGGCCACCGTCGCGACGTCGCCGGTTATGCCGCGGGTCTGGAACTGTTCGACCGCCGTCTGCCGGAGCTGATGTCTCTGCTGCGCGATGACGACATCCTGATCCTCACCGCTGACCACGGTTGCGATCCGACCTGGACCGGTACTGACCACACGCGTGAACACATTCCGGTACTGGTATATGGCCCGAAAGTAAAACCGGGCTCACTGGGTCATCGTGAAACCTTCGCGGATATCGGCCAGACTCTGGCAAAATATTTTGGTACTTCTGATATGGAATATGGCAAAGCCATGTTCTGATGGATTTGGGCGGAGCGTTGACTCCGCCTTTGTTATGTCACAAAAAGGATAAAACAATGGCTACCCCACACATTAATGCAGAAATGGGCGATTTCGCTGACGTAGTTTTGATGCCAGGCGACCCGCTGCGTGCGAAGTATATTGCTGAAACTTTCCTTGAAGATGCCCGTGAAGTGAACA > NC_000913/4620514‑4621006 | ccgcgacTCTTCCTGGGGCCACCGTCGCGACGTCGCCGGGTATGCTGCGGGTCTGGAGCTGATCGACCGCCGTCTGCCGGAGCTGATGTCTCTGCTGCGCGATGACGACATCCTGATCCTCACTGCTGACCACGGTTGTGATCCGACCTGGACCGGTACTGACCACACGCGTGAACACATGCCGGTACTGGTTTACGGCCCGAAAGTAAAACCGGGCTCACTGAGGCACCGGGAAACCTGCTCGggtgatg > 2:246063‑M2/4‑244 (MQ=255) aCTCTTCCTGGGGCCACCGTCGCGACGTCGCCGGTTATGCAGCGGGTCTGGAGCGGTTCGACCGCCGTCTGCCGGAGCTGATGTCTCTGCTGCGCGATGACGACATCCTGATCCTCACTGCTGACCACGGTTGTGATCCGACCTGGACCGGTACTGACCACACGCGTGAACACATTACGGTACTGGTTTACGGCCCGAAAGTAAAACCGGGCTCACTGGGTCACCGTGACACCTTCGCGggtgatgctgcc < 2:59558‑M2/251‑13 (MQ=255) aCTCTTCCTGGGGCCACAGTCGCGACGTCGCCGGCTATGCTGCGGGTCTGGAGCTGTTCGACCGCCGTCTGCCGGAGCTGATGTCTCTGCTGCGCGATGACGACATCCTGATCCTCACTGCTGACCACGGTTGTGATCCGACCTGGACCGGTACTGACCACACGCGTGAACACATTCAGGTACTGGTTTACGGCCCGAAAGTAAAAACGGGCTCACTGGGTCACCGTGAAACCTCCGCGggtgatgaggcc < 2:185004‑M2/251‑13 (MQ=255) ccTGGGGCCCCCGTCGCGACGTCGCCGGTTATTCTGCGGGTCTGGAGCTGTTCGACCGCAGTCTGCCGGAGCTGATGTCTCTGCTGCGCGATGACGACATCCTGATCCTCACTGCTGACCCCGGTTGTGATCCGACCTGGACCGGTACTGACCACACGCGTGAACACATTCCGGTACTGGGTTACGGCCCGAAAGTAAAACCGGGCTCACTGGGTCACCGTGAAACCTTCGCGggtgatgctgcaaactt > 2:180835‑M2/1‑233 (MQ=255) ccTGGGGCCACCGTCGCGACGTCGCCGGTTATGCTGCGGGTCTGGAGCTGTTCGACCGCCGTCTGCCGGAGCTGATGTCTCTGCTGCGCGATGACGACATCCTGATCCTCACTGCTGACCACGGTTGTGATCCGACCTGGACCGGTACTGACCACACGCGTGAACACATTCCGGTACTGGTTTACGGCCCGAAAGTAAAACCGGGCTCACTGGGTCACCGTGAAACCTTCGCGggtgatgctgccaactt > 1:261859‑M2/1‑233 (MQ=255) ccACCGTCGCGACGTCGCCGGTTATGCTGCGGGGCTGGAGCTGTTCGACCGCCGTCTGCCGGAGCTGATGTCTCTGCTGCGCGATGACGACATCCTGATCCTCACTGCTGACCACGGTTGTGATCCGACCTGGACCGGTACTGACCACACGCGTGAACACATTCCGGTACTGGTTTACGGCCCGAAAGTAAAACCGGGCTCACTGGGTCACCGTGAAACCTTCGCGggtgatgctgccaacttactgattt > 2:194916‑M2/1‑226 (MQ=255) ccGGATATGCTGCGGGTCTGGAGCTGTTCGACCGCCGTCTGCCGGAGCTGATGTCTCTGCTGCGCGATGACGACATCCTGATCCTCACTGCTGACCACGGTTGTGATCCGACCTGGACCGGTACTGACCACACGCGTGAACACATTCCGGTACTGGTTTACGGCCCGAAAGTAAAACCGGGCTCACTGGGTCACCGTGAAACCTTCGCGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgttt < 1:244858‑M2/251‑43 (MQ=255) cGGTTATGCTGCGGGTCTGGAGCTGTTCGACCGCCGTCTGCCGGAGCTGATGTCTCTGCTGCGCGATGACGACATCCTGATCCTCACTGCTGACCACGGTTGTGATCCGACCTGGACCGGTACTGACCACACGCGTGAACACATTCCGGTACTGGTTTACGGCCCGAAAGTAAAACCGGGCTCACTGGGTCACCGTGAAACCTTCGCGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttt < 1:115088‑M2/251‑44 (MQ=255) gTTATGCTGCGGGTCTGGAGCTGTTCGACCGCCGTCTGCCGGAGCTGATGTCTCTGCTGCGCGATGACGACATCCTGATCCTCACTGCTGACCACGGTTGTGATCCGACCTGGACCGGTACTGACCACACGCGTGAACACATTCCGGTACTGGTTTACGGCCCGAAAGTAAAACCGGGCTCACTGGGTCACCGTGAAACCTTCGCGggtgatgctgccaacttacggatttagtgtatgatggtgtttttg > 2:251146‑M2/1‑206 (MQ=255) aTGCTGCGGGTCTGGAGCTGTTCGACCGCCGTCTGCCGGAGCTGATGTCTCTGCTGCGCGATGACGACATCCTGATCCTCACTGCTGACCACGGTTGTGATCCGACCTGGACCGGTACTGACCACACGCGTGAACACATTCCGGTACTGGTTTACGGCCCGAAAGTAAAACCGGGCTCACTGGGTCACCGTGAAACCTTCGCGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgagg > 1:5093‑M2/1‑203 (MQ=255) 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cGACCGCCGTCTGCCGGAGCTGATGTCTCTGCTGCGCGATGACGACATCCTGATCCTCACTGCTGACCACGGTTGTGATCCGACCTGGACCGGTACTGACCACACGCGTGAACACATTCCGGTACTGGTTTACGGCCCGACAGTAAAACCGGGCTCACTGGGTCACCGTGAACCCTTCGCGggtgatgctgccaacttgctgatttcgtgtatgatggtgtttttgaggtgctcccgtggcttctgtttct < 1:64533‑M2/251‑71 (MQ=255) tCTGCCGGAGCTGATGTCTCTGCTGCGCGATGACGACATCCTGATCCTCACTGCTGACCACGGTTGTGATCCGACCTGGACCGGTACTGACCACACGCGTGAACACATTCCGGTACTGGTTTACGGCCCGAAAGTAAAACCGGGCTCACTGGGTCACCGTGAAACCTTCGCGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgt < 1:4862‑M2/251‑80 (MQ=255) gTCTCTGCTGCGCGATGACGACATCCTGATCCTCACTGCTGACCACGGTTGTGATCCGACCTGGACCGGTACTGACCACACGCGTGAACACATTCCGGTACTGGTTTACGGCCCGAAAGTAAAACCGGGCTCACTGGGTCACCGTGAAACCTTCGCGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagc > 1:268417‑M2/1‑157 (MQ=255) gcgcGATGACGACATCCTGATCCTCACTGCTGACCACGGTTGTGATCCGACCTGGACCGGTACTGACCACACGCGTGAACACATTCCGGTACTGGTTTACGGCCCGAAAGTAAAACCGGGCTCACTGGGTCACCGTGAAACCTTCGCGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggg > 1:81605‑M2/1‑148 (MQ=255) gacgacATCCTGATCCTCACTGCTGACCACGGTTGTGATCCGACCTGGACCGGTACTGACCACCCGCGTGAACACCTTCCGGTACTGGTTTACGGCCCGAAAGTAAAACCGGGCTCACTGGGTCACCGTGAAACCTTCGCGggagatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgag < 2:37648‑M2/188‑48 (MQ=255) gacgacATCCTGATCCTCACTGCTGACCACGGTTGTGATCCGACCTGGACCGGTACGGACCACACGCGTGAACACATTCCGGTACTGGTTTACGGCCCGAAAGTAAAACCGGGCTCACTGGGTCACCGTGAAACCTTCGCGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgag > 1:37648‑M2/1‑141 (MQ=255) acgacAGCCTGATCCTCACTGCTGACCACGGTTGTGATCCGACCTGGACCGGTACTGACCACACGCGTGAACACATTCCGGTACTGGTTTACGGCCCGAAAGTAAAACCGGGCTCACTGGGTCACCGTGAAACCTTCGCGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctccggttcagctactgacggggtggtgcg > 1:97809‑M2/1‑140 (MQ=255) cgacATCCTGATCCTCACTGCTGACCACGGTTGTGATCCGACCTGGACCGGTACTGACCACACGCGTGAACACATTCCGGTACTGGTTTACGGCCCGAAAGTAAAACCGGGCTCACTGGGTCACCGTGAAACCTTCGCGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgt > 1:250661‑M2/1‑139 (MQ=255) gCTGACCACGGTTGTGATCCGGCCTGGACCGGTACTGACCACACGCGTGAACACATTCCGGTACTGGTTTACGGCCCGAAAGTAAAACCGGGCTCACTGGGTCACCGTGAAACCTTCGCGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcgtctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgcc > 1:162745‑M2/1‑120 (MQ=255) gCTGACCACGGTTGTGAGCCGACCTGGACCGGTACTGACCACACGCGTGAACACATCCCGGTACGGGTTTACGGCCCGAAAGAAAAACCGGGCTCACTGGGTCACCGTGAAACCTTCGCGggtgaggctgccaacttactgatttattgtatgatggtttttttgaggtgctccagtggcttttgtttcaattagctgtccctcctgttcagctactgacgggggggtgcgtaacggcaaaagcaccgccg > 2:125134‑M2/1‑120 (MQ=255) gACCACGGTTGTGATCCGACCTGGACCGGTCCTGACCACACGCGTGAACACATTCCGGTACTGGTTAACGGCCCGAAAGTAAAACCGGGCTCACTGGGTCACCGTTAAACCTTCGCGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctccggttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccgga > 2:226929‑M2/1‑117 (MQ=255) aTCCGACCTGGACCGGTACGGACCACACGCGTGAACACATTCCGGTACTGGTTTACGGCCCGAAAGTAAAACCGGGCTCACTGGGTCACCGTGAAACCTTCGCGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatct > 1:37201‑M2/1‑104 (MQ=255) gACCTGGACCGGTACTGACCACACGCGTGAACACATTCCGGTACTGGTTTACGGCCCGAAAGTAAAACCGGGCTCACTGGGTCACCGTGAAACCTTCGCGggtgatgctgccaccttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggggcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgc < 2:40405‑M2/251‑152 (MQ=255) ggACCGGTACTGACCACACGCGTGAACCCATTCCGGTACTGGTTTACGGCCCGAAAGTAAAACCGGGCTCACTGGGTCACCGTGAAACCTTCGCGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacgtggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctca > 2:101656‑M2/1‑95 (MQ=255) ggACCGGTACTGACCACACGCGTGAACACATTCCGGTACTGGTTTACGGCCCGAAAGTAAAACCGGGCTCACTGGGTCACCGTGAAACCTTCGCGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctc < 1:42641‑M2/250‑156 (MQ=255) tGAACACATTCCGGTACTGGTTTACGGCCCGAAAGTAAAACCGGGCTCACTGGGTCACCGTGAAACATTCGCGggtgatgctgccaacttactggtttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctaatgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactg < 1:241091‑M2/251‑179 (MQ=255) gAACACATTCCGGTACTGGTTTACGGCCCGAAAGTAAAACCGGGCTCACTGGGTCACCGTGAAACCTTCGCGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgtgcagctacggacggggtggtgggtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactgc > 1:41970‑M2/1‑72 (MQ=255) tCCGGTACTGGTTTACGGCCCGAAAGTAAAACCGGGCTCACTGGGTCACCGTGAAACCTTCGCGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactgcagttcac > 1:169248‑M2/1‑64 (MQ=255) ggtttacggcccgaaaGTAAAACCGGGCTCACTGGGTCACCGTGAAACCTTCGCGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacaccagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactgcagttcacttacaccg > 2:168883‑M2/8‑55 (MQ=255) ttacggcccgAAAGTAAAACCGGGCTCACTGGGTCACCGTGAAACCTTCGCGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgagggtgttttggaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgcgggacatcagcgctatctcggctctcactgccggaaaacatggcaactgcagttcacttacaccgcttc > 2:262986‑M2/5‑52 (MQ=255) aaGTAAAACCGGGCTCACTGGGTCTACGTGAAACCTTCGCGggtgaggctgccaacttactgacttagtgtatgctggtgtttttgaggcgctccagtggcttctgtttctatcagctctccttcctgttcagctactgtcggggtggtgcgtaacggcaaaatcaccgccggacatcagcgttatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactgcagttcacttacaccgcttctcaacccggtac > 2:64533‑M2/1‑41 (MQ=255) cACTGGGTCACCGTGAAACCTTCGCGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactgcagttcacttacaccgcttctcaacccggtacgcaccagaaaatcat > 1:263221‑M2/1‑26 (MQ=255) ccgTGAAACCTTCGCGgttgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggccatcagcgctatctctgctctcacggccgtaaaacatggcaactgcagttcacttacaccgctgctcaacccggtacgcaccagaaaatcattgatatggcc > 2:241091‑M2/2‑16 (MQ=255) aaCCTTCGCGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatctcggctctctctgccgtaaaacatggcaactgcagttcacttacaccgcgtctcaacccggtacgcaccagaaaatcattgatatggccatgaat > 1:258515‑M2/1‑10 (MQ=255) cgggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactgcagttcacttacaccgcttctcaacccggtacgcaccagaaaatcattgatatggccatgaatggcgttgg < 1:203827‑M2/251‑250 (MQ=255) | CTTCGACTCTTCCTGGGGCCACCGTCGCGACGTCGCCGGTTATGCCGCGGGTCTGGAACTGTTCGACCGCCGTCTGCCGGAGCTGATGTCTCTGCTGCGCGATGACGACATCCTGATCCTCACCGCTGACCACGGTTGCGATCCGACCTGGACCGGTACTGACCACACGCGTGAACACATTCCGGTACTGGTATATGGCCCGAAAGTAAAACCGGGCTCACTGGGTCATCGTGAAACCTTCGCGGATATCGGCCAGACTCTGGCAAAATATTTTGGTACTTCTGATATGGAATATGGCAAAGCCATGTTCTGATGGATTTGGGCGGAGCGTTGACTCCGCCTTTGTTATGTCACAAAAAGGATAAAACAATGGCTACCCCACACATTAATGCAGAAATGGGCGATTTCGCTGACGTAGTTTTGATGCCAGGCGACCCGCTGCGTGCGAAGTATATTGCTGAAACTTTCCTTGAAGATGCCCGTGAAGTGAACA > NC_000913/4620514‑4621006 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |