| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,636,474 | T→G | T156T (ACT→ACG) | creB → | DNA‑binding transcriptional regulator CreB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,636,474 | 0 | T | G | 98.2% | 184.3 / NA | 58 | T156T (ACT→ACG) | creB | DNA‑binding transcriptional regulator CreB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base G (38/18); total (39/19) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
CCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGG‑TTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACTCAAGTCA‑CCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTGATGGATAGCGTATGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTCGATACCCACATTAAAACGCTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTTTCACCGATTAATACTCATCGCGGCATGGGATATAGCCTGAGGGGCCTGTAATGCGTATCGGCATGCGGTTGT > NC_000913/4636226‑4636717 | ccGGCGTTACCTGTACTGTTACTGACGGCCCGGAGTGAAGAGGTCGCTCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTATGCGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATTGAATGAGCCCGCGGCGCAGATCAGCTGG‑TTTGACACGCCATTAAAGCTGACTCg > 2:56928/1‑251 (MQ=255) ggCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGG‑TTTGACACGCCATTAACGCTGACGCggg > 2:350513/1‑250 (MQ=255) gCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGG‑TTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTa < 1:512392/251‑1 (MQ=255) cggTACTGTTCTTGACGGCCCGAATTGAAGAGGTCGATCTCTTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTAGGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGGGTGCTCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCTTCTCCCTTCATCCTTATTGGTCATTTTGAATTGAATGAACCCGTGGCGCAGATCAACGGG‑TGTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGttt < 2:394870/249‑1 (MQ=255) 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gCTGG‑TTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCG‑CCAGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTAATGGATAGCGTGTGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTTGATACCCACATTAAAACGTTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTTTCACCGATTAAt > 2:43706/1‑212 (MQ=255) gCTGG‑TTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCG‑CCAGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTAATGGATAGCGTGTGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTTGATACCCACATTAAAACGTTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTTTCACCGATTAATACTCATCGCGGCATGGGATATAGCCTGAGGGGCCTGTaa < 1:119306/251‑1 (MQ=255) tGG‑TTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGAGGTTACTCAAGTCG‑CCAGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTAATGGATAGCGTGTGGGAAGATGAGCAGGACACCTACGATCGCACCGTTGATACCCACATTAAAACGTTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTTTCACCGATTAATACTCATAGCGGCATGGGATATAGCCTGAGGGGCCTGTAATg > 1:304237/1‑251 (MQ=255) g‑TTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCG‑CCAGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTAATGGATAGCGTGTGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTTGATACCCACATTAAAACGTTGCGTGCCAAGCTgcgcg > 1:119331/1‑179 (MQ=255) acGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCG‑CCAGGCCGCGTCTGGTCCCGCCCGCAACTCATGGATAGCGTGTGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTTGATACCCACATTAAAACGTTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTTTCACCGATTAATACTCATCGCGGCATGGGATATAGCCTGAGGGGCCTGTACTGCGTATCGGc > 1:560012/1‑251 (MQ=255) gCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCG‑CCAGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTAATGGATAGCGTGTGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTTGATACCCACATTAAAACGTTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTTTCACCGATTAATACTCATCGCGGCATGGGATATAGCCTGAGGGGCCTGTAATGCGTATCGGCAt > 2:502871/1‑251 (MQ=255) aacgcTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCG‑CCAGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTAATGGATAGCGTGTGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTTGATACCCACATTAAAACGTTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTTTCACCGATTAATACTCATCGCGGCATGGGATATAGCCTGAGGGGCCTGTAATGCGTATCGGCATGCGgtt > 1:130886/3‑251 (MQ=255) cgcTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCG‑CCAGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTAATGGATAGCGTGTGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTTGATACCCACATTAAAACGTTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTTTCACCGATTAATACTCATCGCGGCATGGGATATAGCCTGAGGGGCCTGTAATGCGTATCGGCATGCGgttgc > 1:107142/1‑250 (MQ=255) | CCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGG‑TTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACTCAAGTCA‑CCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTGATGGATAGCGTATGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTCGATACCCACATTAAAACGCTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTTTCACCGATTAATACTCATCGCGGCATGGGATATAGCCTGAGGGGCCTGTAATGCGTATCGGCATGCGGTTGT > NC_000913/4636226‑4636717 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |