| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,636,139 | A→C | K45Q (AAG→CAG) | creB → | DNA‑binding transcriptional regulator CreB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,636,139 | 0 | A | C | 98.3% | 195.7 / ‑3.9 | 61 | K45Q (AAG→CAG) | creB | DNA‑binding transcriptional regulator CreB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base C (30/29); total (31/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.42e-01 | |||||||||||
AAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAGCGCGGTTCCTGTCATGCCGTGGCGGCAATAACAGAGGCGATTTATGCAACGGGAAACGGTCTGGTTAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCAAGCAGG‑TACCCGACGTCATGATT‑CTCGATGTTGGTCTGCCGGATATTAGCGGCTTTGAATTGTGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGA > NC_000913/4635893‑4636373 | aaaCGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAGCGCGGTTCCTGTCATGCCGTGGCGGCAATAACAGAGGCGATTTATGCAACGGGAAACGGTCTGGTTAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCCAGc > 1:465254/1‑250 (MQ=255) tcgctTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAGCGCGGTTCCTGTCATGCCGTGGCGGCAATAACAGAGGCGATTTATGCAACGGGAAACGGTCTGGTTAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCCAGCAGG‑CTCCCGACGTc > 1:441699/1‑251 (MQ=255) ggcgtACTCCGGCAAAGTTGTAGAAGGGTCGCCGAAAAACGCGATTAGCGCGGTTCCTGTCATGCCGTGGCGGCAATAACAGAGGCGATTTGTGCAACGGGAAACGGTCTGGGTAGTGGAAGATGTGCAAGGGATAGGCGGCACGCTGGTCGACATGTTTCAGCATGAAGCTTTTGCCGTCGAGCCCGTGTAGCGAGCCTTGCCGGTACTGGATATACCTCACTAGCAGG‑CACCCGACGTCGTGATt‑ctc < 2:277831/246‑1 (MQ=255) ggCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAGCGCGGTTCCTGTCATGCCGTGGCGGCAATAACAGAGGCGATTTATGCAACGGGAAACGGTCTGGTTAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCCAGCAGG‑CTCCCGACGTCATGATt‑ctc < 2:522916/250‑1 (MQ=255) 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gAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCCAGCAGG‑CTCCCGACGTCATGATT‑CTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATTATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCAc < 2:122534/251‑1 (MQ=255) cGAGGCTTGCCGGTGCAGGATAAAGCTCGCCAGCAGG‑CGCCCGACGTCATGATT‑ATCGATGTTTGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATTATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCAACtt < 2:547477/251‑1 (MQ=255) gAGGCTTGCCGGTGCTGGCTAACGCTCGCCAGCAGG‑CTCCCGCCGTCATGATT‑CTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATTATGCCCCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGCAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGCGCGCACCtt > 2:117809/1‑250 (MQ=255) cTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCAAGCAGG‑TACCCGACGTCATGATT‑CTCGATGTTGGTCTGCCGGATATTAGCGGCTTTGAATTGTGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGTTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGGTTTCAACCAGCGAAGTGTGGGCAAGGGAGAGCACCTTACTGc > 1:385512/1‑251 (MQ=255) ttGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCCAGCAGG‑CTCCCGACGTCATGATT‑CTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATTATGCCGCCCGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCATGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTATGTGGCTACACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAg > 2:227076/1‑233 (MQ=255) ttGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCCAGCAGG‑CTCCCGACGTCATGATT‑CTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATTATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAg < 1:227076/233‑1 (MQ=255) cGGTGCTGGATAAAGCTCGCCAGCAGG‑CTCCCGACGTCATGATT‑CTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATTACACCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGCCTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCAGCGAAGTCGGCGCCAGGGGGCGCACCTTACTGCGTCgg > 1:537035/1‑251 (MQ=255) cTGGATAAAGCTCGCCAGCAGG‑CTCCCGACGTCATGATT‑CTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATTATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTga > 1:37283/1‑250 (MQ=255) cTGGATAAAGCTCGCCAGCAGG‑CTCCCGACGTAATGATT‑CTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATTATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTga > 1:508178/1‑250 (MQ=255) | AAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAGCGCGGTTCCTGTCATGCCGTGGCGGCAATAACAGAGGCGATTTATGCAACGGGAAACGGTCTGGTTAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCAAGCAGG‑TACCCGACGTCATGATT‑CTCGATGTTGGTCTGCCGGATATTAGCGGCTTTGAATTGTGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGA > NC_000913/4635893‑4636373 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |