| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 4,630,022 | T→C | E167E (GAA→GAG) | ettA ← | energy‑dependent translational throttle protein EttA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,630,022 | 0 | T | C | 98.2% | 356.2 / NA | 114 | E167E (GAA→GAG) | ettA | energy‑dependent translational throttle protein EttA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/2); new base C (42/69); total (43/71) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.29e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.69e-01 | |||||||||||
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
GCTCCAGCCAGGAGGAGTAGTTACCTTCCCACGGAATACCTTCACCGCGGTCAAGTTCGAGGATCCAGCCTGCAACGTTATCGAGGAAGTAACGGTCGTGGGTAATCGCCACAACGGTGCCTTCGAAGTCGTGCAGGAAGCGTTCCAGCCAGGCCACGGATTCGGCATCCAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCATGTCTGGTTTTTCCAGCAGCAGGCGGCACAACGCTACGCGACGACGTTCACCACCGGAGAGGTTAGCGATTTTCGCGTCCCAGTCCGGCAGACGTAGCGCATCCGCCGCACGCTCCAGCTGTACGTTCAGATTATGACCGTCGTGAGCCTGAATGATCTCTTCCAGACGGCCTTGTTCAGCGGCCAGCTTGTCAAAATCGGCATCCGGATCGGCGTACAGCGCATACACTTCATCCAGGCGTTTCAGGGCGTTAACCACTTCTGAAACCGCTTCTTCAATGGACTCACGCACG > NC_000913/4629775‑4630268 | gCTCCAGCCAGGAGGAGTAGTTGCCTTCCCACGGAATACCTTCACCGCGGTCAAGTTCGAGGATCCAGCCTGCAACGTTATCGAGGAAGTAACGGTCGTGGGTAATCGCCACCACGGTGCCCTCGAAGTCGTGCAGGAAGCGTTCCAGCCAGGCCACGGATTCGGCATCCAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCATGTCTGGTTTTTCCAGCAGCAGGCGGCACAACGCTACGCGACGACGCTca < 1:502635/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |