Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 4,629,896 | T→C | E209E (GAA→GAG) | ettA ← | energy‑dependent translational throttle protein EttA |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,629,896 | 0 | T | C | 99.0% | 338.1 / NA | 104 | E209E (GAA→GAG) | ettA | energy‑dependent translational throttle protein EttA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (49/54); minor base A (1/0); total (50/54) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.81e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.69e-01 |
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
GACGTGCTTTACCTTTCGACTGACGGCCTTTAGTACCTTGACGT‑ACCCATTCCAGCTCTTTCTCAATCGACTTACGACGCGCCGCTTCTTGTGAAGCTTCCTGCGCCAGGCGCTGATCTTTCTGCTCCAGCCAGGAGGAGTAGTTACCTTCCCACGGAATACCTTCACCGCGGTCAAGTTCGAGGATCCAGCCTGCAACGTTATCGAGGAAGTAACGGTCGTGGGTAATCGCCACAACGGTGCCTTCGAAGTCGTGCAGGAAGCGTTCCAGCCAGGCCACGGATTCGGCATCCAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCATGTCTGGTTTTTCCAGCAGCAGGCGGCACAACGCTACGCGACGACGTTCACCACCGGAGAGGTTAGCGATTTTCGCGTCCCAGTCCGGCAGACGTAGCGCATCCGCCGCACGCTCCAGCTGTACGTTCAGATTATGACCGTCGTGAGCCTGAATGATCTCTT > NC_000913/4629652‑4630137 | gACGTGCTTTACCTTTCGACTGGCGGCCTTTAGTTCCCTGACGT‑ACCCACTCCAGCTCTTTCTCGATCGACTTACGACGCGCCGCTTCTTGTGAAGCTTCCTGCGCCAGGCGCTGATCTTTCTGCTCCAGCCAGGAGGAGTAGTTGCCTTCCCACGGAATACCTTCACCGCGGTCAAGTTCGAGGATCCAGCCTGCAACGTTATCGAGGAAGTAACGGTCGTGGGTAATCGCCACCACGGTGCCCTCGa > 2:457603/1‑249 (MQ=255) cTTTCGACTGCCGGACTTTAGTTCCCAGCCGTTACCCAT‑CCAGCTATTTCCCGCTCGCCTTACGACCCGACGCTTCCTGTGAAGCTTCCTGCGCCAGGCGATGATCTTTCTGCTCCAGCCAGGAGGAGTAGTTGCCTTCCCACGGAATACCTTCACCGCGGTCACGTTCGAGGATCCAGCCTGCAACGTTATCGAGGAAGTAACGGTCGTGGGATATCGCCACCACGGTGCCCTCgcagccgagcggga > 2:283600/1‑236 (MQ=255) tttCGACTGGCGGCCTTTAGTTCCCTGACGT‑ACCCACTCCAGCTCTTTCTCGATCGACTTACGACGCGCCGCTTCTTGTGAAGCTTCCTGCGCCAGGCGCTGATCTTTCTGCTCCAGCCAGGAGGAGTAGTTGCCTTCCCACGGAATACCTTCACCGCGGTCAAGTTCGAGGATCCAGCCTGCAACGTTATCGCGGAAGTAACGGTCGTGGGTAATCGCCACCACGGTGCCCTCGAAGTCGTGCAGGAAGc > 2:617601/1‑251 (MQ=255) ttCGACTGGCGGCCTTTAGTTCCCTGACGT‑ACCCACTCCAGCTCTTTCTCGATCGACTTACGACGCGCCGCTTCTTGTGAAGCTTCCTGCGCCAGGCGCTGATCTTTCTGCTCCAGCCAGGAGGAGTAGTTGCCTTCCCACGGAATACCTTCACCGCGGTCACGTTCGAGGTTCCAGCCTGCAACGTTATCGAGGAAGTAACGGTCGTGGGTAATCGCCACCACGGTGCCCTCGAAGTCGTGCAGGAAGCg > 1:92909/1‑251 (MQ=255) aCTGGCGGCCTTTAGTTCCCTGACGT‑ACCCACTCCAGCTCTTTCTCGATCGACTTACGACGCGCCGCTTCTTGTGAAGCTTCCTGCGCCAGGCGCTGATCTTTCTGCTCCAGCCAGGAGGAGTAGTTGCCTTCCCACGGAATACCTTCACCGCGGTCAAGTTCGAGGATCCAGCCTGCAACGTTATCGAGGAAGTAACGGTCGTGGGTAATCGCCACCACGGTGCCCTCGAAGTCGTGCAGGAAGCGTTcc < 2:503315/251‑1 (MQ=255) ggcGGCCTTTAGTTCCCTGACGT‑TCCCACTCCAGCCCTTTCTCGATCGACTTACGTCGCGCCGCTTCTTGTGAAGTTTCCTGCGCCAGGCGCTGATCTTTCTGCTCCAGCCAGGAGGAGTAGTTGCCGTCCCACGGAATACCTTCACCGCGGTCAAGTTCGAGGATCCAGCCTGCAACGTTATCGAGGAAGTAACGGTCGTGGGTAATCGCCACCACGGTGCCCTCGAAGTCGTGCAGGAAGCGTTcca < 2:344944/247‑1 (MQ=255) gcGGCCTTTAGTTCCCGGACGT‑ACCCACCCCAGCTCTTTCTCGATCGACTTACGACGCGCCGCTTCTTGTGAAGCTTCCTGCGCCAGGCGCTGATCTTTCTGCTCCAGCCAGGAGGAGTAGTTGCCTTCCCACGGAATACCTTCACCGCGGTCAAGTTCGAGGATCCAGCCTGCAACGTTATCGATGAAGTAACGGTCGTGGGTAAGCGCCACCACGGTGCCCTCGAAGTCGTGCAGGAAGCGTTccagcc < 1:226507/250‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |