| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 4,518,681 | A→C | K52T (AAG→ACG) | insA7 → | IS1 family repressor protein InsA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,518,681 | 0 | A | C | 99.1% | 312.0 / NA | 105 | K52T (AAG→ACG) | insA7 | IS1 family repressor protein InsA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base C (62/42); total (63/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |