| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,344,501 | G→A | G378D (GGC→GAC) | melB → | melibiose:H(+)/Na(+)/Li(+) symporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,344,501 | 0 | G | A | 98.2% | 179.2 / NA | 57 | G378D (GGC→GAC) | melB | melibiose:H(+)/Na(+)/Li(+) symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (23/33); minor base C (0/1); total (23/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.90e-01 | |||||||||||
CATTTTATGGGCCGGAGCATCTATTCTTCCGGTGTTAAGCTGTGGTGTTCTCCTGTTAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAACTCTGTTTTTCATGGTAACGCTGATTCTCTACTTCCGTTTCTATCGCCTCAATGGTGACACGCTGCGCAGGATCCAGATCCATCTGCTGGATAAATATCGCAAAGTACCGCCCGAGCCT > NC_000913/4344256‑4344742 | cATTTTATGGGCCGGAGCATCTATTCTTCCGGTGTTAAGCTGTGGTGTTCTCCTGTTAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGtt > 1:363145/1‑251 (MQ=255) gCCGGAGCATCTATTCTTCCGGTGTTAAGCTGTGGTGTTCTCCTGTTAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGTGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGc < 1:87081/251‑1 (MQ=255) gCCGGAGCATCTATTCTTCCGGTGTTAAGCTGTGGTGTTCTCCTGTTAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGc < 1:78003/251‑1 (MQ=255) tCTATTCTTCCGGAGTTAAGCTGTGGTGTTCTCCTGTTAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCtttttt > 1:624819/1‑251 (MQ=255) aTTCTTCCGGTGTTAAGCTGGGGTGTTCTCCTGTTAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGGCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCCTTTCTGGGTATTACATGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAATTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGCCGGTTCAGCTTTTGCGGCttttt < 2:524190/247‑1 (MQ=255) ttcCGGTGTTAAGCTGTGGTGTTCTCCTGTTAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCg > 2:485757/1‑251 (MQ=255) ccGGTGTTAAGCTGGGGTGTTCTCCTGTTAATGGCATTCATGAGCTATCACAAAGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGCACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGt > 2:586801/1‑251 (MQ=255) tgtTAAGCTGTGGTGTTCTCCTGTTAATGGCATTAATGAGCTCTCACAACGTCGTCCTAATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCCTGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTtg > 2:569296/1‑249 (MQ=255) gtTAAGCTGTGGTGTTCTCCTGTTAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTgtgt < 1:199259/251‑1 (MQ=255) aaGCGGTGGTGTTCGCCTGTTAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTa < 2:152299/250‑1 (MQ=255) gcTGTTAATGTCATTAATGAGCTATCGCAACGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAAGGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCAACATGGTGGCATATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGAAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTTTGTTAAGGATGATTGGCTAt < 2:340116/249‑1 (MQ=255) ccTGTGAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCGGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATTGTGGCAGATATCGTTGACTACGGTGAATATGAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACGCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTGCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGCTGTGTTAGGGATGATTGGatat < 2:225728/250‑1 (MQ=255) gTTAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTAc < 1:221926/251‑1 (MQ=255) tAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTAcc < 1:583605/250‑1 (MQ=255) tAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATGTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGttcc < 2:515395/250‑4 (MQ=255) tATCACAACGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTAc > 1:555027/1‑251 (MQ=255) aCGTCGTTCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGcc < 1:276132/251‑1 (MQ=255) ccgcATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGTTGAAGGACGGTTCAGCCTTTTCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGATCAGGCTACGCAAGCCCTATTAg < 2:406329/248‑1 (MQ=255) cTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAgg > 2:11840/1‑251 (MQ=255) cATTGTGATTGCGGGTATGTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACATTCTGCGCAAGCCCTATTAGGTa < 1:155150/251‑1 (MQ=255) aTTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTAt < 2:235985/251‑1 (MQ=255) ttGTGATTGCGTGTATTTTACTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGCGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAACGTATCGCTTACTCCGTGCCGACTATGGTGGAGAAGGACGGTTCAGCCTTTTCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGGGTTAGGGGTGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGtttt > 2:231203/1‑248 (MQ=255) gtgATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATGGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGc < 1:231203/250‑1 (MQ=255) gATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAg < 2:491823/250‑1 (MQ=255) gCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTttat > 2:21599/1‑251 (MQ=255) tATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGAGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATg > 2:531568/1‑250 (MQ=255) tttGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTCGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTAAGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTg > 1:250514/1‑251 (MQ=255) gAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTAc < 1:367686/251‑1 (MQ=255) gAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAACTCTg < 2:156301/251‑1 (MQ=255) tttCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAACTCTGTTTTTCATg < 1:18771/250‑1 (MQ=255) tCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATAGCGTTGATTACGGTGAGTATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGATGGACGGGTCAGCCTTTGCGGCTGTGTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGGCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTAGGATTGCTCTATCAACTCTGTTGTTCATGGt < 2:70449/250‑1 (MQ=255) aCAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAACTCTGTTTTTCATGGTAACGCTGATtc > 1:215950/1‑251 (MQ=255) aGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGGTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAACTCTGTTTTTCATGGTAACGCTGATtctc < 1:458589/251‑1 (MQ=255) atcatGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAACTCTGTTTTTCATGGTAACGCTGATTCTCTACtt < 2:363145/251‑1 (MQ=255) cAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGCTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTTCCAACTCTGTTTTTCATGGTAACGCTGATTCTCTACTTCCGTTTCTAt < 1:598299/251‑1 (MQ=255) tatCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATg < 1:27631/190‑1 (MQ=255) tatCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAACTCTGTTTTTCATGGTAACGCTGATTCTCTACTTCCGTTTCTATCGcc > 2:264923/1‑251 (MQ=255) gATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAACTCTGTTTTTCATGGTAACGCTGATTCTCTACTTCCGTTTCTATCGCCTCAATgg > 2:334215/1‑251 (MQ=255) aCGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAACTCTGTTTTTCATGGTAACGCTGATTCTCTACTTCCGTTTCTATCGCCTCAATGGTGa < 1:344939/250‑1 (MQ=255) ggTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAACTCTGTTTTTCATGGTAACGCTGATTCTCTACTTCCGTTTCTATCGCCTCAATGGTGacac < 1:264923/251‑1 (MQ=255) aaTATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAACTCTGTTTTTCATGGTAACGCTGATTCTCTACTTCCGTTTCTATCGCCTCAATGGTGACACGCTg < 1:485757/251‑1 (MQ=255) aaaCTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAACTCTGTTTTTCATGGTAACGGTGATTCTCTACTTCCGTTTCTATCGCCTCAATGGTGACACGCTGCGCAg < 1:321099/251‑1 (MQ=255) cTGCACGTACGCTGTGACAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGAGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACAAACTCTGTTTTTCATGGTAACGCTGATTCTCTACTTCCGTTTCTATCGCCTCAATGGTGACACGCTGCGCAGgat > 2:561944/1‑251 (MQ=255) gCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAACTCTGTTTTTCATGGTAACGCTGATTCTCTACTTCCGTTTCTATCGCCTCAATGGTGACACGCTGCGCAGgat < 1:509055/249‑1 (MQ=255) cACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAACTCTGTTTTTCATGGTAACGCTGATTCTCTACTTCCGTTTCTATCGCCTCAATGGTGACACGCTGCGCAGgatccc > 2:337680/1‑250 (MQ=255) aCGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAACTCTGTTTTTCATGGTAACGCTGATTCTCTACTTCCGTTTCTATCGCCTCAATGGTGACACGCTGCGCAGgatccagatcc < 1:548026/251‑1 (MQ=255) tgAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGACTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGGGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCGAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAACTCTGTTTTTCATGGTAACGCTGATTCTCTACTTCCGTTTCTATCGCCTCAATGGTGACACGCTGCTCAGGCTCCAGATCCTTctgc > 2:570216/1‑251 (MQ=255) aaGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAACTCTGTTTTTCATGGTAACGCTGATTCTCTACTTCCGTTTCTCTCGCCTCAATGGTGACACGCTGCGCAGGATCCAGCTCCATCTGCTgg > 2:194860/1‑251 (MQ=255) aGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAACTCTGTTTTTCATGGTAACGCTGATTCTCTACTTCCGTTTCTATCGCCTCAATGGTGACACGCTGCTCAGGATCCAGATCCATCTGCTgg > 1:300874/1‑250 (MQ=255) gTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAACTCTGTTTTTCATGGTAACGCTGATTCTCTACTTCCGTTTCTATCGCCTCAATGGTGACACGCTGCGCAGGATCCAGATCCATCTGCTGGAt < 1:378263/251‑1 (MQ=255) gCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAACTCTGTTTTTCATGGTAACGCTGATTCTCTACTTCCGTTTCTATCGCCTCAATGGTGACACGCTGCGCAGGATCCAGATCCATCTGCTGGATAAata < 1:240374/251‑1 (MQ=255) cTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACCGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAACTCTGTTTTTCATGGTAACGCTGATTCTCTACTTCCGTTTCTATCGCCTCAATGGTGACACGCTGCGCAGGATCCAGATCCATCTGCTGGATAAATATCGc > 1:537955/1‑250 (MQ=255) cGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAACTCTGTTTTTCATGGTAACGCTGATTCTCTACTTCCGTTTCTATCGCCTCAATGGTGACACGCTGCGCCGGATCCAGATCCATCTGCTGGATAAATATCGCaa > 1:499646/1‑249 (MQ=255) gTGCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAACTCTGTTTTTCATGGTAACGCTGATTCTCTACTTCCGTTTCTATCGCCTCAATGGTGACACGCTGCGCAGGATCCAGATCCATCTGCTGGATAAATATCGCAAAGt > 1:395094/1‑251 (MQ=255) gccgACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAACTCTGTTTTTCATGGTAACGCTGATTCTCTACTTCCGTTTCTATCGCCTCAATGGTGACACGCTGCGCAGGATCCAGATCCATCTGCTGGATAAATATCGCAAAGTa < 1:174133/247‑1 (MQ=255) gCAGACTATGGTGGTGAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAACTCTGTTTTTCATGGTAACGCTGATTCTCTACTTCCGTTTCTATCGCCTCAATGGTGACACGCTGCGCAGGATCCAGATCCATCTGCTGGATAAATATCGCAAAGTAc < 1:597238/251‑1 (MQ=255) tggtgAAGGACGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAACTCTGTTTTTCATGGTAACGCTGATTCTCTACTTCCGTTTCTATCGCCTCAATGGTGACACGCTGCGCAGGATCCAGATCCATCTGCTGGATAAATATCGCAAAGTACCGCCCGAGCCt > 1:273421/1‑251 (MQ=255) | CATTTTATGGGCCGGAGCATCTATTCTTCCGGTGTTAAGCTGTGGTGTTCTCCTGTTAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGGTTCAGCCTTTGCGGCTTTTTTCATTGCGGTTGTGTTAGGGATGATTGGCTATGTACCGAATGTTGAACAGTCTACGCAAGCCCTATTAGGTATGCAGTTTATTATGATTGCTCTACCAACTCTGTTTTTCATGGTAACGCTGATTCTCTACTTCCGTTTCTATCGCCTCAATGGTGACACGCTGCGCAGGATCCAGATCCATCTGCTGGATAAATATCGCAAAGTACCGCCCGAGCCT > NC_000913/4344256‑4344742 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |