Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,411,689 | G→T | E13* (GAA→TAA) | yhdJ → | DNA adenine methyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,411,689 | 0 | G | T | 97.6% | 118.9 / ‑6.3 | 42 | E13* (GAA→TAA) | yhdJ | DNA adenine methyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base T (19/22); minor base A (0/1); total (19/23) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
AGAACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGA‑TTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTG‑ACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAGTGTCGATCTGATCTTTGCCGACCCACCATATAACATCGGTAAAAATTTTGATGGTCTGATCGAAGCCTGGAAAGAAGATCTGTTTATCGACTGGCTGTTTGAAGTGATTGCAGAGTGCCACCGCGTTCTGAAAAAGCAGGGCAGCATGTACATCATGAACAGTACGGAAAACATGCCCTTTATC > NC_000913/3411444‑3411934 | aGAACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGA‑TTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTG‑ACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATTAAGCt > 1:483513/1‑251 (MQ=255) aaCAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGA‑TTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTG‑ACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATTAAGCTaa < 2:481798/251‑1 (MQ=255) aCATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGA‑TTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTG‑ACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATTAAGCTAAGACCATTATTCACgg < 1:133872/251‑1 (MQ=255) aaTGGGGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGA‑TTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTG‑ACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAAGTAAGCTAAGACCATTATTCACGGt < 2:319301/250‑1 (MQ=255) gTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCGGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGA‑TTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTG‑ACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATTAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATg < 2:511044/251‑1 (MQ=255) gATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGA‑TTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTG‑ACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATTAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATgcg < 1:24526/251‑1 (MQ=255) acacCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATTAACGAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGA‑TTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTG‑ACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAAGTAAGTTAAGACCATTATTCTCGGTGATgagttttccg < 2:436424/250‑10 (MQ=255) gTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGA‑TTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTG‑ACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATTAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTaa < 1:174209/251‑1 (MQ=255) ggTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGA‑TTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTG‑ACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATTAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTaaa < 2:177467/250‑1 (MQ=255) aCCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGA‑TTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTG‑ACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATTAAGCTAAGACCATTAGTCTCGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGAt < 1:491567/251‑1 (MQ=255) aGACCCGTGCTGCGCTGATGATTGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGA‑TTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTG‑ACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATTAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATccc < 1:434468/251‑1 (MQ=255) gcTGATGCTGGTCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGA‑TTAAAAAGGCGCTACTCGGAATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTTTCACAAAGGGAGTG‑ACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATTAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTTCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGaacgggtc > 2:322132/1‑245 (MQ=255) aTCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGA‑TTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTG‑ACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATTAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAGTGTCGATCTGATCTTTg > 1:146363/1‑251 (MQ=255) aaCCGTGGTACGCTGCGTAAAAAAGTGAAAAAATTCGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGA‑TTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGGG‑ACCATGAGAACAGGATGTTAACCGACCCGGTTTGGTAATTAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAGTGTCGATCTGATCTTTGCCg < 1:409121/251‑1 (MQ=255) cGTAAAAAATTGCAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGA‑TTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACGAAGGGAGTG‑ACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATTAAGCTAAGAACCTTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAGAGTCGATCTGATCTTTGCCGACCCACCATATAAc > 2:185958/1‑250 (MQ=255) aaTTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTAAGGTTAGCTAAATG‑TTGAATTAAAAAGGAGCTACTAGGCAGGGGGAAGGGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTG‑ACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATTAAGCGAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAGTGTCGATCTGATCTTTGCCGACCCACCATATAACATCGGTaa < 2:146363/251‑1 (MQ=255) aCGGAATGAACTAATTCAGGTTAGCAAAATGTTTGA‑TTAAAAAGGCGCAACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTG‑ACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATTAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAGTGTCGATCTGATCTTTGCCGACCCACCATATAACATCGGTAAAAATTTTGATg < 2:201657/250‑1 (MQ=255) aaCTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGA‑TTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTG‑ACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATTAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAGTGTCGATCTGATCTTTGCCGACCCACCATATAACATCGGTAAAAATTTTGATGGTCTGATCg > 2:165931/1‑251 (MQ=255) atttCAGGTTAGCTAAATTATTGA‑TTAAAAAGGCGCTACGCGTCATGGGGACGCCGCTTTTTGATAGGGTTCACAAAGTGA‑TGTACCATGAAAACAGGAGGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATTTAGCTAACACCATTATTCCCGGTGATGCGCTTGCCAAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAATTGTCGATCTGATCTTTGCCGACCCACCATATAACATCGGTAAAAATTTTGATAGTCTGTTCGaa < 2:534518/247‑1 (MQ=255) aagttagtttAGCTAAATGCTGGA‑TTAAAAAGGGGCTACTCGGCAGGGGTAAGTGCCTTTTTTAGAGGTGTCACAAAGGGAGTG‑CCCATGAGAACGGGATGTGACCCGACCGGGTTTGGTAATTAAGCTAAGACCATTATTTACGGTGATGCGCTTGCCGATCTTAAAAAGATCCCCTCCTAAAGTGTCTATCTGATCTTTGCCGACCCACCATATAACAGCGTGAAAAATTGTGATTGTCGGATCGAAGc < 2:253296/243‑1 (MQ=255) tAGCTAAATGCTTGA‑TTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTG‑ACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATTAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAGTGTCGATCTGATCTTTGCCGACCCACCATATAACATCGGTAAAAATTTTGATGGTCTGATCGAAGCCTGGaa > 1:24653/1‑248 (MQ=255) aaTGCTTGA‑TTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTG‑ACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATTAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAGGTTCGATCTGCTCTTTGCCGACCCACCATATAACATCGGTAAAAATTTTGATGGTCTGATCGAAGCCTGGAAAGAAGATCt > 2:240236/1‑251 (MQ=255) ttGA‑TTAAAAAGGCGCTACGCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTG‑ACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATTAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAGTGTCGATCTGATCTTTGCCGACCCACCATATAACATCGGTAAAAATTTTGATGGTCTGATCGAAGCCTGGAAAGAAGATCTGttt < 2:177236/250‑1 (MQ=255) tGA‑TAAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCTTTTTTTATAGGTGTCACAAATGGAGTG‑ACCATGAGAACAGGATGTGCACCGACCCGGTTTGGAAATTAAGCTAAGACAATTATTCACGGGGATGCGCTTGCCTAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAGTGTCGATCTGATCTTTGCCGACCCACCAGATAACATCGGTAAAAATTTTGATGGTCTGATCGAAGCCTGGAAAGAAGATCTGTTTa < 2:516674/250‑1 (MQ=255) tAAAAAGGCGCTACTAGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTG‑ACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATTAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAGTGTCGATCTGATCTTTGCCGACCCACCATATAACATCGGTAAAAATTTTGATGGTCTGATCGAAGCCTGGAAAGAAGATCTGTTTATCGAc > 2:373150/1‑251 (MQ=255) ggCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTG‑ACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATTAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAGTGTCGATCTGATCTTTGCCGACCCACCATATAACATCGGTAAAAATTTTGATGGTCTGATCGAAGCCTGGAAAGAAGATCTGTTTATCGACTGGCTg > 2:225857/1‑251 (MQ=255) cgcTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAACGGGAGTG‑ACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATTAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAGTGTCGATCTGATCTTTGCCGACCCACCATATAACATCGGTAAAAATTTTGATGGTCTGATCGAAGCCTGGAAAGAAGATCTGTTTATCGCCTGGCTGtt > 2:338234/1‑251 (MQ=255) cgcTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAACGGGAGTG‑ACCATGAGAACAGGATCTGAACCGACCCGGTTTGGTAATTAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGTTGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAGTGTCGCTCTGATCTTTGCCGACCCACCATATAACATCGGTAAAAATTTTGATGGTCTGATCGCAGCCTGGAAAGACGATCTGTTTATCGACTGGCTGtt > 2:232862/1‑251 (MQ=255) gcTACGCGGCATGGGGAAGCGGCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTG‑ACCATGAAAACAGTATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATTAAGCTAAGACCATGATTCACGGTGATGCGTTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAGTGTCGATCTGATCTGTGCCGACCCACCATATAACATCGGTAAAAATTTTGATGGTCTGATCGAAGCCTGGAAAGAAGATCTGTTTATCTACTGGCTGttt < 2:52753/251‑1 (MQ=255) gcCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTG‑ACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATTAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAGTGTCGATCTGATCTTTGCCGACCCACCATATAACATCGGTAAAAATTTTGATGGTCTGATCGAAGCCTGGAAAGAAGATCTGTTTATCGACTGGCTGTTTGAAGTGATTGCAGAGTGcc > 2:351418/1‑250 (MQ=255) ttttATAGGTGTCACAAAGGGAGTG‑ACCAGGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGTTAATTAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAGTGTCGATCTGATCTTTGCCGACCCACCATATAACATCGGTAAAAATTTTGATGGTCTGATCGAAGCCTGGAAAGAAGATCTGTTTATCGACTGGCTGTTTGAAGTGATTGCAGAGTGCCACcgc < 1:516157/250‑1 (MQ=255) gtgtCACAAAGGGAGTG‑ACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGCTTGGTAATTAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATACCCGCCGAAAGTGTCGATCTGATCTTTGCCGACCCACCATATAACATCGGTAAAAATTTTGATGGTCTGATCGACGCCTGGAAAGAAGATCTGTTTATCGCCTGGCTGTTTGAAGTGATTGCAGAGTGCCACCGCGTTCTGaa > 1:94292/1‑250 (MQ=255) aaGGGAGTG‑ACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATTAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAGTGTCGATCTGATCTTTGCCGACCCACCATATAACATCGGTAAAAATTTTGATGGTCTGATCGAAGCCTGGAAAGAAGATCTGTTTATCGACTGGCTGTTTGAAGTGATTGCAGAGTGCCACCGCGTTCTGAAAAAGCAggg < 1:501203/251‑1 (MQ=255) ccATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATTAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAGTGTCGATCTGATCTTTGCCGACCCACCATATAACATCGGTAAAAATTTTGATGGTCTGATCGAAGCCTGGAAAGAAGATCTGTTTATCGACTGGCTGTTTGAAGTGATTGCAGAGTGCCACCGCGTTCTGAAAAAGCAGGGCAGCATGTAc > 1:601103/1‑251 (MQ=255) gagaACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATAAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAGTGTCGATCTGATCTTTGCCGACCCACCATATAACATCGGTAAAAATTTTGATGGTCTGATCGAAGCCTGGAAAGAAGATCTGTTTATCGACTGGCTGTTTGAAGTGATTGCAGAGTGCCACCGCGTTCTGAAAAAGCAGGGCAGCATGTAcatca < 1:300576/251‑1 (MQ=255) gaACAGGATGTGAACCGACCCGGGTTGGTAATTAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAGTGTCGATCTGATCTTTGCAGACCCACAATATAACATCGGGAAAAATTTTGATGGTCTGATCGAAGCCTGGAAAGAAGATCTGTTTATCGACTGGCTGTTTGAAGTGATTGCAGAGTGCCACCGCGTTCTGAAAAAGCAGGGCAGCAGGTAcatcagg > 2:147104/1‑249 (MQ=255) aGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATTAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAGTGTCGATCTGATCTTTGCCGACCCACCATATAACATCGGTAAAAATTTTGATGGTCTGATCGAAGCCTGGAAAGAAGATCTGTTTATCGACTGGCTGTTTGAAGTGATTGCAGAGTGCCACCGCGTTCTGAAAAAGCAGGGCAGCATGTACATCATGAAcc > 2:593245/1‑250 (MQ=255) aaCCGACCCGGTTTGGTAATTAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAGTGTCGATCTGATCTTTGCCGACCCACCATATAACATCGGTAAAAATTTTGATGGTCTGATCGAAGCCTGGAAAGAAGATCTGTTTATCGACTGGCTGTTTGAAGTGATTGCAGAGTGCCACCGCGTTCTGAAAAAGCAGGGCAGCATGTACATCATGAACAGTACGGa > 1:366248/1‑250 (MQ=255) aaCCGACCCGGTTTGGTAATTAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAGTGTCGATCTGATCTTTGCCGACCCACCATATAACATCGGTAAAAATTTTGATGGTCTGATCGAAGCCTGGAAAGAAGATCTGTTTATCGACTGGCTGTTTGAAGTGATTGCAGAGTGCCACCGCGTTCTGAAAAAGCAGGGCAGCATGTACATCATGAACAGTACGGa > 1:65131/1‑250 (MQ=255) aCCGACCCGTCTTGGTAATTACGCTAAGAACATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGTACTTCAAAAGAACCCCGCCGAAAGTGTCGATCTGATCTTAGCCGACCCCCCATATAACATCGGTAAAAATTTTGATGGTCTGATCGAAGCCTGGAAAGAAGATCTGTTTATCGACTGGCTGTTTGATGTGCTAGCAGAGAGCCACCGCGTTCTGAAACAGCAGAGCAGCATGTACATCATGAACAGTACGGaa > 2:429755/1‑250 (MQ=255) tGGTAATTAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAGTGTCGATCTGATCTTTGCCGACCCACCATATAACATCGGTAAAAATTTTGATGGTCTGATCGAAGCCTGGAAAGAAGATCTGTTTATCGACTGGCTGTTTGAAGTGATTGCAGAGTGCCACCGCGTTCTGAAAAAGCAGGGCAGCATGTACATCATGAACAGTACGGAAAACATGCCCttt < 1:552590/250‑1 (MQ=255) gTAATTAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAATTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAGTGTCGATCTGATCTTTGCCGACCCACCATATAACATCGGTAAAAATTTTGATGGTCTGATCGAAGCCTGGAAAGAAGATCTGTTTATCGACTGGCTGTTTGAAGTGATTGCAGAGTGCCACCGCGTTCTGAAAAAGCAGGGTAGCATGTACATCATGAACAGTACGGAAAACATGCCCTTTATc < 1:104738/251‑1 (MQ=255) | AGAACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGA‑TTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTG‑ACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAGTGTCGATCTGATCTTTGCCGACCCACCATATAACATCGGTAAAAATTTTGATGGTCTGATCGAAGCCTGGAAAGAAGATCTGTTTATCGACTGGCTGTTTGAAGTGATTGCAGAGTGCCACCGCGTTCTGAAAAAGCAGGGCAGCATGTACATCATGAACAGTACGGAAAACATGCCCTTTATC > NC_000913/3411444‑3411934 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |