| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 1,769,474 | G→A | G134E (GGG→GAG) | ydiK → | putative transporter YdiK |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,769,474 | 0 | G | A | 93.8% | 162.2 / 0.2 | 64 | G134E (GGG→GAG) | ydiK | putative transporter YdiK |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/2); new base A (34/26); total (36/28) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.49e-01 | |||||||||||
ATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCATCCCTATTGCTTTGCTGGTTAACAGTATCGTCGACGGCAGCGGCCCGCTAATTAAAGCCATTTCCAGCGGTGACATGACGTTACCCGATCTGGCGTGGCTTAATACCATTCCGGTGATTGGCGCGAAGCTGTATGCAGGCTGGCACAACTTGCTGGATATGGGGGGGACGGCGATCATGGCGAAAGTCCGCCCTTATATTGGCACCACCACCACCTGGTTCGTTGGGCAGGCGGCGCATATCGGGCGCTTTATGGTGCATTGTGCGCTGATGCTTCTCTTCAGTGCCCTGCTGTACTGGCGCGGTGAACAGGTGGCACAAGGCATTCGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAGATGCCGCCGTGCTGCTGGCGGCACAGGCTATCCGCGCGGTGGC > NC_000913/1769226‑1769717 | aTTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGGCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCATCCCTATTGCTTTGCTGGTTAACAGTATCGTCGACGGCAGCGGCCCGCTAATTAAAGCCATTTCCAGCGGTGACATGACGTTACCCGATCTGGCGTGGCTTAATACCATTCCGGTGATTGGCGCGAAGCTGTATGCAGGCTGGCACAACTTGCTGGATATggggg > 1:56378/1‑251 (MQ=255) cGTTTACAACAGATCAAGTTTGGCCGCCGCTATCTCGCCGTTCTGGTGAAGACGCTGTTTCTAGAGAAGGGATTTATCATCACTCGTGCTTTGCTGGTTAACAGTATCGTCGAAGACCGCGGCCCGCTCATTAAAGACATTTCCAGCGGTGACATGACGTTACCCGATCTGGCGTGGCTTAATACCATTCCGGTGATTGGCGCGAAGCTGTATGCCGGCTGGCACAACTTGCTGGATATGGAGGGGACGGc > 2:615992/1‑251 (MQ=255) aaGATCATGTTCGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCCTCCCTATTGCTTTGCTGGTTAACAGTATCGTCGACGGCAGCGGCCCGCTAATTAAAGCCATTTCCAGCGGTGACATGACGTTACCCGATCTGGCGTGGCTTAATACCATTCCGGTGATTGGCGCGAAGCTGTATGCAGGCTGGCCCAACTTGCTGGATATGGAGGGGACGGCGATCATggg > 2:98007/1‑250 (MQ=255) aTCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCATCCCTATTGCTTTGCTGGTTAACAGTATCGTCGACGGCAGCGGCCCGCTAATTAAAGCCATTTCCAGCGGTGACATGACGTTACCCGATCTGGCGTGGCTTAATACCATTCCGGTGATTGGCGCGAAGCTGTATGCAGGCTGGCACAACTTGCTGGATATGGAGGGGACGGCGATCATGGCGaa < 1:167690/251‑1 (MQ=255) aTGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCATCCCTATTGCTTTGCTGGTTAACAGTATCGTCGACGGCAGCGGCCCGCTAATTAAAGCCATTTCCAGCGGTGACATGACGTTACCCGATCTGGCGTGGCTTAATACCATTCCGGTGATTGGCGCGAAGCTGTATGCAGGCTGGCACAACTTGCTGGATATGGAGGGGACGGCGATCATg < 1:391030/243‑1 (MQ=255) aTGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCATCCCTATTGCTTTGCTGGTTAACAGTATCGTCGACGGCAGCGGCCCGCTAATTAAAGCCATTTCCAGCGGTGACATGACGTTACCCGATCTGGCGTGGCTTAATACCATTCCGGTGATTGGCGCGAAGCTGTATGCAGGCTGGCACAACTTGCTGGATATGGAGGGGACGGCGATCATg > 2:391030/1‑243 (MQ=255) gTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCATCCCTATTGCTTTGCTGGTTAACAGTATCGTCGACGGCAGCGGCCCGCTAATTAAAGCCATTTCCAGCGGTGACATGACGTTACCCGATCTGGCGTGGCTTAATACCATTCCGGTGATTGGCGCGAAGCTGTATGCAGGCTGGCACAACTTGCTGGATATGGAGGGGACGGCGATCATGGCGAAAGTcc < 1:196762/251‑1 (MQ=255) 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ccGGTGATTGGCGCGAAGCTGTATGCAGGCTGGCACAACTTGCTGGATATGGAGGGGACGGCGATCATGGCGAAAGGCCGCCCTTATATTGGCACCACCACCACCTGGTTCGTTGGGCAGGCGGCGCATATCGGGCGCTTTATGGTGCATTGTGCGCTGATGCTTCTCTTCAGTGCCCTGCTGGACTGGCGCGGTGAACAGGAGGCCAAAGGCATTCGCCATTTTGCACACCGTCCGGCGGGCGTTCGCgg > 2:14943/1‑251 (MQ=255) ggTGATTGGCGCGAAGCTGTATGCAGGCTGGCACAACTTGCTGGATATGGAGGGGACGGCGATCATGGCGAAAGTCCGCCCTTATATTGGCACCACCACCACCTGGTTCGTTGGGCAGGCGGCGCATATCGGGCGCTTTATGGTGCATTGTGCGCTGATGCTTCTCTTCAGTGCCCTGCTGTACTGGCGCGGTGAACAGGTGGCACAAGGCATTCGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCgggg > 2:422288/1‑249 (MQ=255) gATTGGCGCGAAGCTGTATGCAGGCTGGCACAACTTGCTGGATATGGAGGGGACGGCGATCATGGCGAAAGTCCGCCCTTATATTGGCACCACCACCACCTGGTTCGTTGGGCAGGCGGCGCATATCGGGCGCTTTATGGTGCATTGTGCGCTGATGCTTCTCTTCAGTGCCATGCTGTACTGGCGCGGTGAACAGGTGGCACAAGGCATTCGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAGATg < 1:255506/251‑1 (MQ=255) aTTGGCGCGAAGCTGTATGCAGGCTGGCACAACGTGCTGGATATGGGGGGGACGGCGATCATGGCGAAAGTCCGCCCTTATATTGGCACCACCTCCACCTGGTTCGTTGGGCAGGCGGCGCATATCGGGCGCTTTATGGTGCATTGTGCGCTGAGGCTTCGCTTCAGTGCCCTGCTGTACTGGCGCGGTGAACAGGTGGCACAAGGCAATCGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAGATgc < 1:445211/251‑1 (MQ=255) tGGCGCGAAGCTTTATGCAGGCTGGCACAACTTTCTGGATATGGAGGGGACGGCGATCATGGCGAAAGTTCGCCCTGATATTGGCACCACCACCACCTGGTGCGTTGGGCAGGCGGCGCATATCGGGCGCTTTATGGTGCATTGTGCGCGGATGCGTCTCTTCAGTGCCCTGCTGTACTGGCGCGTTGAACAGGTGGCACAAGGCATTCGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTACGCGGAGATgcc < 2:281492/250‑1 (MQ=255) ggCGCGAAGCTGTATGCAGGCTGGCACAACTTGCTGGATATGGAGGGGACGGCGATCATGGCGAAAGTCCGCCCTTATATTGGCACCACCACCACCTGGTTCGTTGGGCAGGCGGCGCATATCGGGCGCTTTATGGTGCATTGTGCGCTGATGCTTCTCTTCAGTGCCCTGCTGTACTGGCTCGGTGAACAGGTGGCACTAGGCATTCGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAGATgccg < 1:585566/250‑1 (MQ=255) gCTGTATGCAGGCTGGCACAACTTGCTGGATATGGAGGGGACGGCGATAAAGGCGAAAGTCCGCCCTTATATTGGCACCCCCACCACCTGGATCGTTGGGCGGGCGGCGCATATCGGGCGCTTTATGGTGCATTGTGCGCTGATGCTTCTCTTCAGTGACCTACTGTACTGGCGCGGTGAACAGGTGGCACAAGGAATCCGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCACGGAGATGCCGCCGtgctgc > 1:395719/1‑251 (MQ=255) aTGCAGGCTGGCACAACTTGCTGGATATGGAGGGGACGGCGATCATGGCGAAAGTCCGCCCTTATATTGGCACCACCACCACCTGGTTCGTTGGGCAGGCGGCGCATATCGGGCGCTTTATGGTGCATTGTGCGCTGATGCTTCTCTTCAGTGCCCTGCTGTACTGGCGCGGTGAACAGGTGGCACAAGGCATTCGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAGATGCCGCCGTGCTGCTggcg > 1:473154/1‑251 (MQ=255) tGGCACAACTTGCTGGATATGGAGGGGACGGCGATCATGGCGCAAGCCCGCCCTTATATTGGCACCACCACCACCTGGTTCGTTGGGCAGGCGGCGCATATCGGGCGCTTTATGGTGCATTGTGCGCTGATGCTTCTCTTCAGTGCCCTGCTGTACTGGCGCGGTGAACAGGTGGCACAAGGCATTCGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAGATGCCGCCGTGCTGCTGGCGGCACAGGc > 2:431952/1‑251 (MQ=255) ggCACAACTTGCTGGATATGGAGGGGACGGCGATCATGGCGAAAGTCCGCCCTTATATTGGCACCACCACCACCTGGTTCGTTGGGCAGGCGGCGCATATCGGGCGCTTTATGGTGCATTGTGCGCTGATGCTTCTCTTCAGTGCCCTGCTGTACTGGCGCGGTGAACAGGTGGCACAAGGCATTCGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAGATGCCGCCGTGCTGCTGGCGGCACAGGc < 1:166783/250‑1 (MQ=255) tGCTGGATATGGAGGGGACGGCGATCATGGCGAAAGTCCGCCCTTATATTGGCACCACCACCACCTGGTTCGTTGGGCAGGCGGCGCATATCGGGCGCTTTATGGTGCATTGTGCGCTGATGCTTCTCTTCAGTGCCCTGCTGTACTGGCGCGGTGAACAGGTGGCACAAGGCATTCGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAGATGCCGCCGTGCTGCTGGCGGCACAGGCTATCcgcg < 1:94560/249‑1 (MQ=255) tGCTGGATATGGAGGGGACCGAGATCATGGCGAAAGTCCTCCCTTAGATTGGTACCCCCACCACCTGGTTCGTTGGGCAGTTGGCGCATATCGGGCGCTTTATGGTGCATTGTGCGCTGATGCGGCTCGTCAGTGCCCTGCTGTACTGGCGCGGTGAACAGGTGGCACATGTCATTCGCCATTTTGCGACCCGTCGGGCAGGCGTTCGCGGAGATGCCGCCGTGCTGTTGGCGGCACAGGCTAGCcgcg < 2:606407/249‑1 (MQ=255) gATATGGAGGGGACGGCGATCATGGCGAAAGTCCGCCCTTATATTGGCACCACCACCACCTGGTTCGTTGGGCAGGCGGCGCATATCGGGCGCTTTATGGTGCATTGTGCGCTGATGCTTCTCTTCAGTGCCCTGCTGTACTGGCGCGGTGAACAGGTGGCACAAGGCATTCGCCATTTTGCAACCCGGCTGGCAGGCGTTCGCGGAGATGCCGCCGTGCTGCTGGCGGCACAGGCTATCCGGGCGGTGgc > 2:433880/1‑251 (MQ=255) | ATTGTTACGTTTGCAAAAGATCATGTTTGGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCATCCCTATTGCTTTGCTGGTTAACAGTATCGTCGACGGCAGCGGCCCGCTAATTAAAGCCATTTCCAGCGGTGACATGACGTTACCCGATCTGGCGTGGCTTAATACCATTCCGGTGATTGGCGCGAAGCTGTATGCAGGCTGGCACAACTTGCTGGATATGGGGGGGACGGCGATCATGGCGAAAGTCCGCCCTTATATTGGCACCACCACCACCTGGTTCGTTGGGCAGGCGGCGCATATCGGGCGCTTTATGGTGCATTGTGCGCTGATGCTTCTCTTCAGTGCCCTGCTGTACTGGCGCGGTGAACAGGTGGCACAAGGCATTCGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAGATGCCGCCGTGCTGCTGGCGGCACAGGCTATCCGCGCGGTGGC > NC_000913/1769226‑1769717 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |