| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,760 | T→C | A808A (GCT→GCC) | thrA → | fused aspartate kinase/homoserine dehydrogenase 1 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,760 | 0 | T | C | 98.5% | 217.8 / NA | 67 | A808A (GCT→GCC) | thrA | fused aspartate kinase/homoserine dehydrogenase 1 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (35/31); minor base A (1/0); total (36/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.64e-01 | |||||||||||
CTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGCGTCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTCTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTACTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGACATTCAGTCTCAACAACCTCGGACGCTTTGCCGATAAGCTGCCGTCAGAACCACGGGAAAATATCGTTTATCAGTG > NC_000913/2520‑3003 | ctgtGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCGGTGATGAAGGAAAAGGTTTGCGCTATGTTGGCAATATGGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTAAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCTCTATTAGCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACATCTGCCGGTGTCTTTGCCGAtt < 2:358085/242‑2 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTAc < 1:12261/249‑1 (MQ=255) gTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATg < 1:506026/251‑1 (MQ=255) gagAAGGCCCGTGATGTAGGAAAAGTTGTGCGCTATGGTGGCAATAGTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCTTGAAGATTGCCGAAGGGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTGTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCTCGGATATGGTGCGGGCAAGGACGTTACAGCCGCCGTTGTCTTTGCCGATCTTCTACGTTCCCTCTCATGGaa < 2:327438/249‑1 (MQ=255) ggCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGATATGTTGGCACTATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTAAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTCTTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAGTGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTAAGTACCCTCTAATGGAAGtt > 2:534801/1‑249 (MQ=255) ccGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGCAGTTAgg > 2:461513/1‑249 (MQ=255) gatgcAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCACTCTTGCTGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGGGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTCTTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCACTGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGCAGTTAGGAGTCTg > 2:374618/1‑251 (MQ=255) atgaAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTg > 1:601147/1‑250 (MQ=255) gcaGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGAGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGCCGTTACAGCTGCCGGTGACTTTGCCGCTCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGCGTCTGAc > 2:407127/3‑250 (MQ=255) aGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGTTTaaa < 2:601147/251‑1 (MQ=255) ttgtctatATGTTGGAAATATTGATGAAGAGGGGGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGGGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGTTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGt < 2:498391/243‑1 (MQ=255) tGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATTATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCTGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGttt < 2:370500/250‑1 (MQ=255) gCAATATTGATGAAGAGGGTGCCTGCCGAGTGAAGATTGTCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTGCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGTTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCGCATTGAAGGTAGGAGGCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTc < 2:367858/251‑1 (MQ=255) atgaAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCa > 1:305643/1‑250 (MQ=255) gatggtgccTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGa < 2:35346/243‑1 (MQ=255) gatggtgccTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCGTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGa < 2:406037/243‑1 (MQ=255) cTGCCGCGTGACGCTTGACGAAGTGGATGGTAATGATACGCTGTTCAAAGTGACACATGGCGAAAAGGACCTGGCCTTTTATAGCCCCTATTATCAGACGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTCCACTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACTTGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGGCggg > 2:274040/1‑251 (MQ=255) cgcgTGAAGATTGCCTAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTGTATAGCCACGATTAGCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTg < 2:191307/251‑1 (MQ=255) cgTGAAGATTGCCGGAGTGGCTGGTAATGATTCGCTGTTCAAAGGGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACTTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTGTATGCCCCGGCTTCCATTGCCAATATGAGCGTTGGGTTTGAt < 2:88181/251‑1 (MQ=255) aGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAg > 1:600672/1‑183 (MQ=255) aGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAg < 2:600672/183‑1 (MQ=255) aGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCt > 2:116043/1‑251 (MQ=255) gagtGCCGAAGTGGCTGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAGTGGCGAAAACGGCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTTCCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTTACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATTTGCGTCGGGTTTGAtgtgttc < 2:461446/248‑4 (MQ=255) gATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAAGATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTc < 2:64017/251‑1 (MQ=255) aaTTGCCGAAGTTGAGTGTAATGATCCGCTGTACAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCTGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTATGAGTCTGACATGGTTAAAGTGTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGGCGCGTTTGACGTGCtt < 2:89774/250‑2 (MQ=255) aTTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGACAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCAGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCg > 2:294424/1‑251 (MQ=255) gCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCgggg > 1:560155/1‑251 (MQ=255) cGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGggcg > 1:471402/1‑251 (MQ=255) cGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGggcg > 1:267491/1‑251 (MQ=255) gAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGggcgg > 1:374446/1‑251 (MQ=255) gATGGTAATGATCAGCTGTTCAACGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTg > 2:404839/1‑250 (MQ=255) aTGGTAATGATCCGTTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGGCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCTGCGGTGac < 1:136296/251‑1 (MQ=255) aTGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCCTGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGac > 1:10388/1‑251 (MQ=255) aaTGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTg < 1:494236/251‑1 (MQ=255) aTGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGt < 2:164705/251‑1 (MQ=255) tGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAATTGGCGAAAACGCCCTGGAATTTTATAGCCCCTATTCTCAGCCGCTGACGTTGGTGCTGCGCGGCTATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGACGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTCGGCGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGAGGCGGTGACACCTGtt > 2:559482/1‑251 (MQ=255) gCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGAGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGt > 1:590493/1‑251 (MQ=255) gTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCGTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGGTATGAGTCTGACATGTTTAAAGGTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCa < 1:413118/251‑1 (MQ=255) tGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCgg > 1:159456/1‑251 (MQ=255) gCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGCAACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGTTGTAGt > 1:442899/1‑251 (MQ=255) cGAAAACGCCCTGTCATTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTc < 2:288070/251‑1 (MQ=255) aaaaCGCCCTGGGCTGTGATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGAGCGGATATGGTGTGGGCAATGACGCTACAGCTGCCGGTGTCTTTGGCGATCTGCTACGTCCCCTCACATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGGCGCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCACGGGGCGGCGTTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTTGGTGTTGTAGTCAc < 2:520194/251‑1 (MQ=255) cGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGGGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGtt < 1:243420/251‑1 (MQ=255) gCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTg < 2:159456/251‑1 (MQ=255) tGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAggc > 1:156756/1‑251 (MQ=255) tttataGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCa < 1:461513/247‑1 (MQ=255) tataGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCAGTGTCTTTGCCGATCTGCTACTTACCCTCTCATTGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGAGTCGGCGGTGACACCTGTTGCTGGTACATTGCACGTAGATGTAGTCACGGTTGCGGCGTCag > 1:80565/1‑248 (MQ=255) ataGCCACTATTCTCAGCCGCTGCAGTTGGTGCTGCGCGGATATGGAGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCCTGGACGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACAACTGTTGATGGGGGATTGCTCGGGGTTGGTGTCACGGTTGAGGCGGCagaggc > 2:369610/1‑249 (MQ=255) ttatCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGACATTCAGtctt > 1:405373/1‑250 (MQ=255) atCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACCTGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGCGCCTTGCTCGGCGATGTAGTCACGGTTGAGTCGGCAGAGACCTTCAGACTca > 2:95315/1‑250 (MQ=255) gCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGGTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATTTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGACATTCAGTCTCAACAACCTc < 1:231539/251‑1 (MQ=255) gCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGACATTCAGTCGCAACAACCTCgg < 1:192353/250‑1 (MQ=255) gCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCGTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTGGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGACATTCAGTCTCAACAACCTCg < 1:374618/249‑1 (MQ=255) gatGGTGCTGCGCGGATATGGTACGGGCAATGACGTTACAGCTGCAGGTGTCTTTGCCGATCTGCTCCGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGGGTCTGACATGGTTAAAGATTCTGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTAATGGAGCCTTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGGGACATTCAGTCTCAACACCCTCGGCCGc > 2:499068/3‑251 (MQ=255) gTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGACATTCAGTCTCAACAACCTCGGACGc > 2:208023/1‑251 (MQ=255) gTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGACGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACACTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGATTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACCCCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTAACGGTTGAGGCGGCAGAGACATTCAGTCTCAACAACCTCGGACg > 1:289930/1‑250 (MQ=255) tGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGACATTCAGTCTCAACAAACTCGGACGCtt > 1:626225/1‑251 (MQ=255) tGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGACATTAAGTCTCAACAACCTCGGACGCtt > 1:395792/1‑251 (MQ=255) gcTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGTGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGGTGATGCGGCAGAGACATTCAGGCTCAACAACCTCGGACTCTTTGcc < 2:541092/250‑1 (MQ=255) cTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGACATTGAGTCTCAACAACCTCGGGCGCTTTGCCg > 2:170327/1‑251 (MQ=255) tGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCACTCATGGAAGTTCGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCAAATATGAGCGTCGGGATTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGCGATGTAGTCACGGATGAGGCGGCTGCGACCTTCAGTCTCAACAAACTCGGGCGCTTTGCCGATAAGCTGccctc > 2:285906/1‑247 (MQ=255) gCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGACATTCAGTCTCAACAACCTCGGAAGCTTTGCCGATAAGCTGCCGTCAGAAcc > 1:373858/1‑251 (MQ=255) gACGTTACAGCTGCCGGTGGCTTTGCCGATCGGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAATGTGTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGACATTCAGTCTCAACAACCTCGGACGCTTTGCCGAGAAGCTGCCGTCAGAACCACgg < 1:499068/250‑1 (MQ=255) aCGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCAGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGGGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGATTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGCCACCTGTTGATGGGGCATTGCTCGGAGATGTCGTCACGGTTAAGGCGGCAGAGAAATTCCGTCTTCACAAACTCGGGCGCTTTGCCGATCAGCTGcaggcagcaaaacggg > 2:381365/1‑235 (MQ=255) tGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGACATTCCGTCTCAACAACCTCGGACGCTTTGCCGATAAGCTGCCGTCAGAACCACGGGCAAATATCGtt > 1:310401/1‑251 (MQ=255) gCCGGTGTCGTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATTTGCGCGGGGCGGCGGTGACTCCTGTTGATTGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGACATTCAGTCTCAACAACCTCGGTCGCTTTGCCGATAAGCTGCCGTCAGAACCACGGGAAAATATCGt < 1:372278/249‑1 (MQ=255) tCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCCGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGACATTCAGTCTCAACAACCTCGGACGCTTTGCCGATAAGCTGCCGTCAGAACCACGGGCAAATATCGTTTATCAGTg > 1:288106/1‑251 (MQ=255) | CTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGCGTCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTCTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTACTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGACATTCAGTCTCAACAACCTCGGACGCTTTGCCGATAAGCTGCCGTCAGAACCACGGGAAAATATCGTTTATCAGTG > NC_000913/2520‑3003 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |