Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,676 | C→T | F780F (TTC→TTT) | thrA → | fused aspartate kinase/homoserine dehydrogenase 1 |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,676 | 0 | C | T | 97.4% | 239.7 / NA | 76 | F780F (TTC→TTT) | thrA | fused aspartate kinase/homoserine dehydrogenase 1 |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (38/36); minor base G (0/2); total (38/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.93e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
ATATTGAAATTGAACCTGTGCTGCCCGCAGAGTTTAACGCCGAGGGTGATGTTGCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAACTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGCGTCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTCTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTACTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGC > NC_000913/2429‑2919 | atatTGAAATTGAACCTGTGCTGCCCGCAGAGTTTAACGCTGAGGGTGATGTTGCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTtat > 2:494236/1‑251 (MQ=255) attgaaattgaaCCTGTGCTGCCCGCAGAGTTTAACGCTGAGGGTGATGTTGCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTtata < 1:289231/250‑1 (MQ=255) aaattgaaCCTGTGCTGCCCGCAGAGTTTAACGCTGAGGGTGATGTTGCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCAc < 1:284120/251‑1 (MQ=255) aaattgaaCCTGTGCTGCCCGCAGAGTTTAACGCTGAGGGTGATGTTGCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACACCCTGGCCTTTTATAGCCAc > 2:574117/1‑251 (MQ=255) tgaaCCTGTGCTGCCCGCAGAGTTTAACGCTGAGGGTGATGTTGCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACtatt > 1:175768/1‑251 (MQ=255) cTGTGCTGCCCGCAGAGTTGAACGCTGAGGGTGATGTTGCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAg < 2:499196/238‑1 (MQ=255) cTGTGATGCCCGCAGAGTTTAACGCTGAGGGTGATGTTGCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAg > 1:499196/1‑238 (MQ=255) tgtgCTGCCCGCAGAGTTTAACGCTGAGGGTGATGTTGCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGc > 1:511183/1‑251 (MQ=255) gctgcCCGCAGAGTTTAACGCTGAGGGTGATGTTGCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGc > 1:349653/1‑251 (MQ=255) tgcCCGCAGAGTTTAACGCTGAGGGTGATGTTGCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTg > 2:506026/1‑251 (MQ=255) ccGCAGAGTTTAACGCTGAGGGTGATGTTTCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGGTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCg < 1:349463/251‑1 (MQ=255) agagTTTAACGCTGAGGGCGATGTTGCCGATTTTATGGCGAATCTGTCACATCGCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGGGAAGGCCCGGGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGAGGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTAGCTGCCGCTGCCGTTgg < 2:531451/251‑1 (MQ=255) tttAACGCTGAGGGTGATGATGCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAGCACGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGCAAAGTTTTGCGCTATGTCGGCCATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGACAACGCCATGGCCTTTTATAGACACTATTATCAGCCGCTGCCGTTggcgct > 2:218248/1‑247 (MQ=255) aaCGCTGAGGGTGATGTTGCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAAGGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTgcg < 1:67944/251‑1 (MQ=255) aGGGTGATGTTGCCGATTTTATGGCGAATCTGTCAAAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGTCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGatat > 2:246568/1‑251 (MQ=255) aGGGTGATGTTCCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAGCTCGCCGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGTAGGCCCGTGATGAAGGACACGTTTTGCGCTACGTTGGCCATATTGATGCCGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAGGGGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAAAGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCCGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCggcgtt > 2:231539/1‑247 (MQ=255) ggTGATGTTGCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATgg < 1:134612/251‑1 (MQ=255) aTGTTGCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGCTGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGACGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCCCTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCCGCGCGGATATGGAGCg > 2:204407/1‑251 (MQ=255) cGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATg < 1:107150/251‑1 (MQ=255) gCTTTTATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGCAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGCAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATg > 1:29563/1‑250 (MQ=255) ttttATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGCTGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTCTTATCAGCCGCTGCCGTTGGGGCTGCGCGGATATGGTGCTGGCAATGACg > 2:168367/1‑251 (MQ=255) tttATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACTATCTCTTTGCCGTGCGCGGGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTACCGGAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAATAATTGCGAAAACGCCCTGGCCGTTTATAGCGACTAGTAGAAGCCGCTGCTGGTGGTGCTGCGCGGGGATAGTGCTGGCAATGAc < 2:118569/249‑1 (MQ=255) tttATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGAGCTCTGTTGGCAATATTGTTGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGGGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATAGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCCACCGATGCCGTGGTTGCTGAGCGGCTATGGGGCgggacatgaagg > 2:502024/1‑242 (MQ=255) tATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGCAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGTCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGtt < 2:29563/250‑1 (MQ=255) gggAATCTGTCACAGCTCGACGACCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGTAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAAGAGTGATGAAGATGGGGCCTGCCGCGTGAAGAGTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAGCGCCCTGGGATTGTGTAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGc < 2:305033/249‑1 (MQ=255) gAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTg < 2:519942/251‑1 (MQ=255) tCACAGCTCGACGATATCTTAGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGCGATGAAGGACAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATTTTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAACCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTCCAGCTGCCGgtgt > 2:62021/1‑251 (MQ=255) agcTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCttt > 1:288070/3‑251 (MQ=255) cgacgaTCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGccg < 1:132251/251‑3 (MQ=255) gacgaTCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATg < 2:468092/223‑1 (MQ=255) gacgaTCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATg > 1:468092/1‑223 (MQ=255) ctgtGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCGGTGATGAAGGAAAAGGTTTGCGCTATGTTGGCAATATGGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTAAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCTCTATTAGCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACATCTGCCGGTGTCTTTGCCGAtt < 2:358085/242‑2 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTAc < 1:12261/249‑1 (MQ=255) gTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATg < 1:506026/251‑1 (MQ=255) gagAAGGCCCGTGATGTAGGAAAAGTTGTGCGCTATGGTGGCAATAGTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCTTGAAGATTGCCGAAGGGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTGTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCTCGGATATGGTGCGGGCAAGGACGTTACAGCCGCCGTTGTCTTTGCCGATCTTCTACGTTCCCTCTCATGGaa < 2:327438/249‑1 (MQ=255) ggCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGATATGTTGGCACTATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTAAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTCTTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAGTGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTAAGTACCCTCTAATGGAAGtt > 2:534801/1‑249 (MQ=255) ccGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGCAGTTAgg > 2:461513/1‑249 (MQ=255) gatgcAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCACTCTTGCTGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGGGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTCTTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCACTGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGCAGTTAGGAGTCTg > 2:374618/1‑251 (MQ=255) atgaAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTg > 1:601147/1‑250 (MQ=255) gcaGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGAGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGCCGTTACAGCTGCCGGTGACTTTGCCGCTCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGCGTCTGAc > 2:407127/3‑250 (MQ=255) aGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGTTTaaa < 2:601147/251‑1 (MQ=255) ttgtctatATGTTGGAAATATTGATGAAGAGGGGGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGGGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGTTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGt < 2:498391/243‑1 (MQ=255) tGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATTATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCTGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGttt < 2:370500/250‑1 (MQ=255) gCAATATTGATGAAGAGGGTGCCTGCCGAGTGAAGATTGTCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTGCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGTTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCGCATTGAAGGTAGGAGGCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTc < 2:367858/251‑1 (MQ=255) atgaAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCa > 1:305643/1‑250 (MQ=255) gatggtgccTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGa < 2:35346/243‑1 (MQ=255) gatggtgccTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCGTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGa < 2:406037/243‑1 (MQ=255) cTGCCGCGTGACGCTTGACGAAGTGGATGGTAATGATACGCTGTTCAAAGTGACACATGGCGAAAAGGACCTGGCCTTTTATAGCCCCTATTATCAGACGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTCCACTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACTTGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGGCggg > 2:274040/1‑251 (MQ=255) cgcgTGAAGATTGCCTAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTGTATAGCCACGATTAGCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTg < 2:191307/251‑1 (MQ=255) cgTGAAGATTGCCGGAGTGGCTGGTAATGATTCGCTGTTCAAAGGGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACTTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTGTATGCCCCGGCTTCCATTGCCAATATGAGCGTTGGGTTTGAt < 2:88181/251‑1 (MQ=255) aGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAg > 1:600672/1‑183 (MQ=255) aGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAg < 2:600672/183‑1 (MQ=255) aGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCt > 2:116043/1‑251 (MQ=255) gagtGCCGAAGTGGCTGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAGTGGCGAAAACGGCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTTCCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTTACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATTTGCGTCGGGTTTGAtgtgttc < 2:461446/248‑4 (MQ=255) gATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAAGATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTc < 2:64017/251‑1 (MQ=255) aaTTGCCGAAGTTGAGTGTAATGATCCGCTGTACAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCTGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTATGAGTCTGACATGGTTAAAGTGTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGGCGCGTTTGACGTGCtt < 2:89774/250‑2 (MQ=255) aTTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGACAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCAGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCg > 2:294424/1‑251 (MQ=255) gCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCgggg > 1:560155/1‑251 (MQ=255) cGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGggcg > 1:471402/1‑251 (MQ=255) cGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGggcg > 1:267491/1‑251 (MQ=255) gAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGggcgg > 1:374446/1‑251 (MQ=255) gATGGTAATGATCAGCTGTTCAACGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTg > 2:404839/1‑250 (MQ=255) aTGGTAATGATCCGTTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGGCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCTGCGGTGac < 1:136296/251‑1 (MQ=255) aTGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCCTGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGac > 1:10388/1‑251 (MQ=255) aaTGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTg < 1:494236/251‑1 (MQ=255) aTGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGt < 2:164705/251‑1 (MQ=255) tGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAATTGGCGAAAACGCCCTGGAATTTTATAGCCCCTATTCTCAGCCGCTGACGTTGGTGCTGCGCGGCTATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGACGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTCGGCGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGAGGCGGTGACACCTGtt > 2:559482/1‑251 (MQ=255) gCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGAGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGt > 1:590493/1‑251 (MQ=255) gTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCGTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGGTATGAGTCTGACATGTTTAAAGGTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCa < 1:413118/251‑1 (MQ=255) tGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCgg > 1:159456/1‑251 (MQ=255) gCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGCAACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGTTGTAGt > 1:442899/1‑251 (MQ=255) cGAAAACGCCCTGTCATTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTc < 2:288070/251‑1 (MQ=255) aaaaCGCCCTGGGCTGTGATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGAGCGGATATGGTGTGGGCAATGACGCTACAGCTGCCGGTGTCTTTGGCGATCTGCTACGTCCCCTCACATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGGCGCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCACGGGGCGGCGTTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTTGGTGTTGTAGTCAc < 2:520194/251‑1 (MQ=255) cGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGGGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGtt < 1:243420/251‑1 (MQ=255) gCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTg < 2:159456/251‑1 (MQ=255) tGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAggc > 1:156756/1‑251 (MQ=255) | ATATTGAAATTGAACCTGTGCTGCCCGCAGAGTTTAACGCCGAGGGTGATGTTGCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAACTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGCGTCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTCTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTACTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGC > NC_000913/2429‑2919 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |