Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 197,402 | C→T | T286I (ACA→ATA) | rseP → | intramembrane zinc metalloprotease RseP |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 197,402 | 0 | C | T | 90.6% | 161.2 / 4.8 | 64 | T286I (ACA→ATA) | rseP | intramembrane zinc metalloprotease RseP |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/4); new base T (30/28); total (32/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.72e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.40e-01 |
CCTGATAAAGAAGATCCGGTATCTTCGCTGGGGATTCGTCCTCGTGGGCCGCAAATTGAACCTGTACTGGAAAATGTGCAGCCAAACTCGGCGGCAAGCAAGGCAGGTTTGCAAGCAGGCGACAGGATCGTTAAAGTCGATGGTCAGCCCTTAACGCAGTGGGTGACCTTTGTGATGCTTGTCCGGGATAACCCGGGTAAATCCTTAGCGTTAGAAATCGAAAGGCAGGGGAGTCCCTTGTCTTTGACATTAATCCCGGAGAGTAAACCGGGTAATGGTAAAGCGATTGGTTTTGTCGGTATTGAGCCGAAAGTCATTCCTTTGCCAGATGAGTATAAAGTTGTACGCCAGTATGGGCCGTTCAACGCCATCGTCGAAGCCACGGACAAAACGTGGCAGCTGATGAAGCTGACGGTCAGTATGCTGGGAAAATTGATCACCGGTGATGTGAAACTGAACAACCTCAGTGGGCCGATCTCTATCGCCA > NC_000913/197155‑197641 | ccTGATAAAGATCATCCGGAATCATCGCTGGGGATTCGTCCTCTTGGGCCACAAATTGAACCTGTAATGGAAAATGTGCAGCCACACTCGGCGGCATGCAAGGCCGGTTTGCAAGCAGGCGACAGGCTCGTTAAAGTCGAGGGTCAGCCCTTAACGCAGTGGGTGACCTTTGTGATGCTTGTCCGGGATAACCCGGGTAAATCCTTAGCGTTAGAAATCGCAGTGCCGGGGAGACCCTTGTCTTTGATAtt > 2:539532/1‑251 (MQ=255) cTGATAAAGAAGATCCGGTATCTTCGCTGGGGATTCGTCCTCGTGGGCCGCAAATTGAACCTGTACTGGAAAATGTGCAGCCAAACTCGGCGGCAAGCAAGGCAGGTTTGCAAGCAGGCGACAGGATCGTTAAAGTCGATGGTCAGCCCTTAACGCAGTGGGTGACCTTTGTGATGCTTGTCCGGGATAACCCGGGTAAATCCTTAGCGTTAGAAATCGAAAGGCAGGGGAGTCCCTTGTCTTTGATAtt > 2:349075/1‑250 (MQ=255) aaaaGAAGATCCGGTATCTTCGCTGGGGATTCGTCCTCGTGGGCCGCAAATTGAACCTGTACTGGAAAATGTGCAGCCAAACTCGGCGGCAAGCAAGGCAGGTTTGCAAGCAGGCGACAGGATCGTTAAAGTCGATGGTCAGCCCTTAACGCAGTGGGTGACCTTTGTGATGCTTGTCCGGGATAACCCGGGTAAATCCTTAGCGTTAGAAATCGAAAGGCAGGGGAGTCCCTTGTCTTTGATATTAATcc < 2:148674/250‑1 (MQ=255) aagaagATCCGGTATCTTCGCTGGGGATTCGTCCTCGTGGGCCGCAAATTGAACCTGTACTGGAAAATGTGCAGCCAAACTCGGCGGCAAGCAAGGCAGGTTTGCAAGCAGGCGACAGGATCGTTAAAGTCGATGGTCAGCCCTTAACGCAGTGGGTGACCTTTGTGATGCTTGTCCGGGATAACCCGGGTAAATCCTTAGCGTTAGAAATCGAAAGGCAGGGGAGTCCCTTGTCTTTGATATTAATcc > 2:550935/1‑249 (MQ=255) aagaagATCCGGTATCTTCGCTGGGGATTCGTCCTCGTGGGCCGCAAATTGAACCTGTACTGGAAAATGTGCAGCCAAACTCGGCGGCAAGCAAGGCAGGTTTGCAAGCAGGCGACAGGATCGTTAAAGTCGATGGTCAGCCCTTAACGCAGTGGGTGACCTTTGTGATGCTTGTCCGGGATAACCCGGGTAAATCCTTAGCGTTAGAAATCGAAAGGCAGGGGAGTCCCTTGTCTTTGATATTAATcc < 1:550935/249‑1 (MQ=255) aataTCCGGTATCTCCGCGTGGGATTCGTCCTCGTGGGTCGCTAAGTGAATCTGTACTGGAAAATGTGCAGCCAAACTCGGCGGCATGCAAGGCAGGTTTGCAAGCAGGCGACAGGATCGTTAAAGTCGATGGTCAGCCCTTAACGCAGTGGGTGACCTTTGTGTTGCTTGGCCTGGATATCCCTGGTAAACCCTTAGCGTTAGAAATCGAAAGGCAGTGTAGTCCCTTGTCTTGGATCTTAGTCCCGgag < 2:74079/248‑1 (MQ=255) tCCGGTATCTTCGCTGGGGATTCGTCCTCGTGGGCCGCAAATTGAACCTGTACTGGAAAATGTGCAGCCAAACTCGGCGGCAAGCAAGGCAGGTTTGCAAGCAGGCGACAGGATCGTTAAAGTCGATGGTCAGCCCTTAACGCAGTGGGTGACCTTTGTGATGCTTGTCCGGGATAACCCGGGTAAATCCTTAGCGTTAGAAATCGAAAGGCAGGGGAGTCCCTTGTCTTTGATATTAATCCCGGAGAGt > 1:391227/1‑250 (MQ=255) 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aaaGGCAGGGGAGTACCTTGTCTTTGATATTAATCCCGGAGAGTAAACAGGGTAATGGTAAAGCGATTGGTTTTGTCGGTATTGAGCCGAAAGTCATTCCTTTGCCAGATGAGTATAAAGTTGTACGCCAGTATGGGCCGTTCAACGCCATCGTCGAAGCCACGGACAAAACGTGGCAGCTGATGAAGCTGACGGTAAGTATGCTGGGAAAATTGATCACAGGTGATGTGAAACTGAACAACCTCAGTggg > 1:480923/1‑251 (MQ=255) ggggAGTCCCTTGTCTTTGATATTAATCCCGGAGAGTAAACCGGGTAATGGTAAAGCGATTGGTTTTGTCGGTATTGAGCCGAAAGTCATTCCTTTGCCAGATGAGTATAAAGTTGTACGCCAGTATGGGCCGTTCAACGCCATCGTCGAAGCCACGGACAAAACGTGGCAGCTGATGAAGCTGACGGTCAGTATGCTGGGAAAATTGATCACCGGTGATGTGAAACTGAACAACCTCAGTGGGCCGAtct > 1:627029/1‑251 (MQ=255) gggAGTCCCTTGTCTTTGATATTAATCCCGGAGAGTAAACCGGGTAATGGTAAAGCGATTGGTTTTGTCGGTATTGAGCCGAAAGTCATTCCTTTGCCAGATGAGTATAAAGTTGTACGCCAGTATGGGCCGTTCAACGCCATCGTCGAAGCCACGGACAAAACGTGGCAGCTGATGAAGCTGACGGTCAGTATGCTGGGAAAATTGATCACCGGTGATGTGAAACTGAACAACCTCAGTGGGCCGAtctc > 2:117962/1‑251 (MQ=255) 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CCTGATAAAGAAGATCCGGTATCTTCGCTGGGGATTCGTCCTCGTGGGCCGCAAATTGAACCTGTACTGGAAAATGTGCAGCCAAACTCGGCGGCAAGCAAGGCAGGTTTGCAAGCAGGCGACAGGATCGTTAAAGTCGATGGTCAGCCCTTAACGCAGTGGGTGACCTTTGTGATGCTTGTCCGGGATAACCCGGGTAAATCCTTAGCGTTAGAAATCGAAAGGCAGGGGAGTCCCTTGTCTTTGACATTAATCCCGGAGAGTAAACCGGGTAATGGTAAAGCGATTGGTTTTGTCGGTATTGAGCCGAAAGTCATTCCTTTGCCAGATGAGTATAAAGTTGTACGCCAGTATGGGCCGTTCAACGCCATCGTCGAAGCCACGGACAAAACGTGGCAGCTGATGAAGCTGACGGTCAGTATGCTGGGAAAATTGATCACCGGTGATGTGAAACTGAACAACCTCAGTGGGCCGATCTCTATCGCCA > NC_000913/197155‑197641 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |