| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 11,481 | G→A | S102S (AGC→AGT) | yaaI ← | DUF2541 domain‑containing protein YaaI |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 11,481 | 0 | G | A | 98.2% | 176.9 / ‑5.7 | 58 | S102S (AGC→AGT) | yaaI | DUF2541 domain‑containing protein YaaI |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (32/24); minor base C (0/1); total (32/26) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.39e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.78e-01 | |||||||||||
GGAGAGGCGAGTTTTGCCTTTTTCATTATGGGTGAGCAATCGGGCGAAATTTGCCAACTGTTCCTCACTACAATGCTGAAGAAAATCCAGATCTGAATCATTCAGGTAATTAACATTCATTTTTTGTGGCTTCTATATTCTGGCGTTAGTCGTCGCCGATAATTTTCAGCGTGGCCATATCCGATGAGTTCACCGTATGACCCGAAAAGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCGCTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTCAGGCTCTGACTGGCGCTACGGGCGGCTTTGAAATAAACCGATGCACCGCTTAACTGTAAATCGCCATGGTCGGCAGAGAGTTGTATGCGTTTCACAATGCGACAAACAGGAAGTTTCAGCGCCAGATCGTTGGTTTCGTTACGCGGCATTGCAATGGCGCCGAGGAGTTTATGGTCGTTTGCC > NC_000913/11237‑11721 | ggAGAGGCGAGTTTTGCCTTTTTCATTATGGGTGAGCAATCGGGCGAAATTTGCCAACTGTTCCTCACTACAATGCTGAAGAAAATCCAGATCTGAATCATTCAGGTAATTAACATTCATTTTTTGTGGTTTCTATATTCTGGCGTTAGTCGTCGCCGATAATTTTCAGCGTGGCCATATCCGATGAGTTCACCGTATGACCGGAAAAGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGtt < 1:421910/250‑1 (MQ=255) cGAGTTTTGCCTTTTTCATTATGGGTGAGCAATCGGGCGAAATTTGCCAACTGTTCCTCACTACAATGCTGAAGAAAATCCAGATCTGAATCATTCAGGTAATTAACATTCATTTTTTGTGGTTTCTATATTCTGGCGTTAGTCGTCGCCGATAATTTTCAGCGTGGCCATATCCGATGAGTTCACCGTATGACCGGAAAAGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTg > 1:19042/1‑250 (MQ=255) ttttGCTTTTTTAATTATCGGAGAGCAATCGGGCGAAATTTGTCAACTGTTCATCACTACAATGCTGAAGAACATCCAGATCTGCATCATTCAGGTAATTAACATTCATTTTTTGTGGTTTCTATATTCTGGCGTTAGTCGTCGCCGATCATTTTCAGCGTGGCCATATCCGATGAGTTCACCGTATGAACGGAAAAGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATcc > 2:441657/1‑250 (MQ=255) gCCTTTTTCATTATGGGTGAGCAATCGGGCGAAATTTGCCAACTGTTCCTCACTACAATGCTGAAGAAAATCCAGATCTGAATCATTCAGGTAATTAACATTCATTTTTTGTGGTTTCTATATTCTGGCGTTAGTCGTCGCCGATAATTTTCAGCGTGGCCATATCCGATGAGTTCACCGTATGACCGGAAAAGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCcagtc > 2:582369/1‑250 (MQ=255) caatATGGGAGAGAAATCGGGCGAAATTTGCCACCTGTTCCTCAATACAATGCTGAAGAAAATAAAGATCTGAATCATTCTGGAAATTAACATTCATTTTTTGTGGTTTCTATATTCTGGCGTTAGTCGTCGCAGATAATTTTCAGCGTGGACATATCCGATGAGTTCACCGTATGACCGGAAAAGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTACTGTTGATCCAGTCAGTGGTTTg > 2:326101/4‑251 (MQ=255) cATTATGGGTGAGCAATCGGGCGAAATTTGCCAACTGTTCCTCACTACAATGCTGAAGAAAATCCAGATCTGAATCATTCAGGTAATTAACATTCATTTTTTGTGGTTTCTATATTCTGGCGTTAGTCGTCGCCGATAATTTTCAGCGTGGCCATATCCGATGAGTTCACCGTATGACCGGAAAAGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGttt < 1:314608/250‑1 (MQ=255) cATTATGGGTGAGCAATCGGGCGAAATTTGCCAACTGTTCCTCACTACAATGCTGAAGAAAATCCAGATCTGAATCATTCAGGTAATTAACATTCATTTTTTGTGGTTTCTATATTCTGGCGTTAGTCGTCGCCGATAATTTTCAGCGTGGCCATATCCGATGAGTTCACCGTATGACCGGAAAAGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTg < 2:345284/251‑1 (MQ=255) gTGAGCAATCGGGCGAAATTTGCCAACTGTTCCTCACTACAATGCTGAAGAAAATCCAGATCTGAATCAGTCAGGTAATTAACATTCATTTTTTGTGGTTTCTATATTCGGGCGTTAGTCGTCGCCGATAATTTTCAGCGGGGCCATAGCCGATGATTTCACCGTATGACCGGAAAAGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTTTCGTTATCACTGTTAATGTGGATCCAGGGAGTGGTTTGCTcttctt < 2:282720/251‑1 (MQ=255) caagcGGGCGAAATTTGCCAACTGTTCCTCACTACAATGCTGAAGAAAATCCAGATCTGAATCATTCAGGTAATTAACATTCATTTTTTGTGGTTTCTATATTCTGGCGTTAGTCGTCGCCGATAATTTTCAGCGTGGCCATATCCGATGAGTTCACCGTATGACCGGAAAAGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCATTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCcttcgtgtatt < 2:466417/247‑8 (MQ=255) aaTCGGGCGAAATTTGCCAACTGTTCCTCACTACAATGCTGAAGAAAATCCAGATCTGAATCATTCAGGTAATTAACATTCATTTTTTGTGGTTTCTATATTCTGGCGTTAGTCGTCGCCGATAATTTTCAGCGTGGCCATATCCGATGAGTTCACCGTATGACCGGAAAAGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTAttt < 1:551284/251‑1 (MQ=255) cGAAATTTGCCAACTGTTCCTCACTACAATGCTGAAGAAAATCCAGATCTGAATCATTCAGGTAATTAACATTCATTTTTTGTGGTTTCTATATTCTGGCGTTAGTCGTCGCCGATAATTTTCAGCGTGGCCATATCCGATGAGTTCACCGTATGACCGGAAAAGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAgg < 2:172936/251‑1 (MQ=255) aTTTGCCAACTGTTCCTCACTACAATGCTGAAGAAAATCCAGATCTGAATCATTCAGGTAATTAACATTCATTTTTTGTGGTTTCTATATTCTGGCGTTAGTCGTCGCCGATAAGTTTCAGCGTGGCCATATCCGATGAGTTCACCGTATGACCGGAAAAGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAata < 2:504746/251‑1 (MQ=255) cTGTTCCTCACTACAATGCTGAAGAAAATCCAGATCTGAATCATTCAGGTAATTAACATTCATTTTTTGTGGTTTCTATATTCTGGCGTTAGTCGTCGCCGATAATTTTCAGCGTGGCCATATCCGATGAGTTCACCGTATGACCGGAACAGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTCatactc > 1:340306/1‑246 (MQ=255) gTTCCTCACTACAATGCTGAAGAAAATCCAGATCTGAATCATTCAGGTAATTAACATTCATTTTTTGTGGTTTCTATATTCTGGCGTTAGTCGTCGCCGATAATTTTCAGCGTGGCCATATCCGATGAGTTCACCGTATGACCGGAAAAGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTCAGACTCTg < 2:162719/251‑1 (MQ=255) aTGCTGAAGAAAATCCAGATCTGAATCATTCAGGTAATTAACATTCATTTTTTGTGGTTTCTATATTCTGGCGTTAGTCGTCGCCGATAATTTTCAGCGTGGCCATATCCGATGAGTTCACCGTATGACCGGAAAAGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTCAGACTCTGACTGGCGCTACgg > 1:130614/1‑251 (MQ=255) cAGATCTGAATCATTCAGGTAATTAACATTCATTTTTTGTGGTTTCTATATTCTGGCGTTAGTCGTCGCCGATAATGTACAGCGTGGCCATATCCGATGAGTTCACCGTATGACCGGAAAAGGTGATTGTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTCAGACTCTGACTGGCGCTACGGGCGGCTTTGAAATaa < 1:560887/251‑1 (MQ=255) tGAATCATTCAGGTAATTAACATTCATTTTTTGTGGTTTCTATATTCTGGCGTTAGTCGTCGCCGATAATTTTCAGCGTGGCCATATCCGATGAGTTCACCGTATGACCGGAAAAGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTCAGACTCTGACTGGCGCTACGGGCGGCTTTGAAATAAACCGAt > 1:224829/1‑251 (MQ=255) gAATCATTCAGGTAATTAACATTCATTTTTTGTGGTTTCTATATTCTGGCGTTAGTCGTCGCCGATAATTTTCAGCGTGGCCATATCCGATGAGTTCACCGTATGACCGGAAAAGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTGAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTCAGACTCTGACTGGCGCTACGGGCGGCTTTGAAATAAACCg < 1:401251/248‑1 (MQ=255) ttCAGGTAATTAACATTCATTTTTTGTGGTTTCTATATTCTGGCGTTAGTCGTCGCCGATAATTTTCAGCGTGGCCATATCCGATGAGTTCACCGTATGACCGGAAAAGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTATGAAGGAATATTCAGACTCTGACTGGCGCTACGTGCTGCTTTGAAATAAACCGATGCACCGc > 2:44105/1‑251 (MQ=255) aTTAACATTCATTTTTTGTCGTTTCTATCTTCTGGCGTTAGTCGTCGCCGATAATTTTCAGCGTGGCCATATCCGATGAGTTCACCGTATGACCGGAAACGGTGATTTTTGAGACGCAGTGTTTATTGTCGTTCTCACTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTCATACTCTGACTGGCGCTACGTGCGGCTTTGAAATAAACCGATCCCCCGCTTAACTGt > 2:305290/1‑251 (MQ=255) aaCATTCATTTTTTGTGGTTTCTATATTCTGGCGTTAGTCGTCGCCGATAATTTTCAGCGTGGCCATATCCGATGAGTTCACCGTATGACCGGAAAAGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTCAGACTCTGACTGGCGCTACGGGCGGCTTTGAAATAAACCGATGCACCGCTTAACTGTaa < 2:219601/250‑1 (MQ=255) cattTTTTGTGGTTTCTATATTCTGGCGTTAGTCGTCGCCGATAATTTTCAGCGTGGCCATATCCGATGAGTTCACCGTATGACCGGAAAAGGTTATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCTCTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATACTCAGACTCTGACTGGCGCTACGGTCGGCTTTGAAATAAGCCGATGCACCGCTTAACTGGAAATCGcc < 2:359470/250‑1 (MQ=255) attTTTTGTGGTTTCTATATTCTGGCGTTAGTCGTCGCCGATAATTTTCAGCGTGGCCATATCCGATGAGTTCACCGTATGACCGGAAAAGGTGATTGTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTCAGACTCTGACTGGCGCTACGGGCGGCTTTGAAATAAACCGATGCACCGCTTAACTGTAAATCGCCAt < 1:107997/251‑1 (MQ=255) ttttGTGGTTTCTATATTCTGGCGTTAGTCGTCGCCGATAATTTTCAGCGTGGCCATATCCGATGAGTTCACCGTATGACCGGACAAGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTCAGACTCTGACTGGCGCTACGGGCGGCTTTGAAATAAACCGATGCACCGCTTAACTGTAAATCGCCCTGGt > 2:69254/1‑251 (MQ=255) ttttGTGGTTTCTATATTCTGGCGTTAGTCGTCGCCGATAATTTTCAGCGTGGCCATATCCGATGAGTTCACCGTATGACCGGAAAAGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTCAGACTCTGACTGGCGCTACGGGCGGCTTTGAAATAAACCGATGCACCGCTTAACTGTAAATCGCCATGGt > 1:132169/1‑251 (MQ=255) cTATATTCTGGCGTTAGTCGTCGCCGATAATTTTCAGCGTGGCCATATCCGATGAGTTCACCGTATGACCGGAAAAGGTGATTTTTGAGCCGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTCAGACTCTGACTGGCGCTACGGGCGGCTTTGAAATAAACCGATGCACCGCTTAACTGTAAATCGCCATGGTCGGCAGAGAGt > 1:83925/1‑251 (MQ=255) cTGGCGTTAGTCGTCGCCGATAATTTTCAGCGTGGCCATATCCGATGAGTTCACCGTATGACCGGAAAAGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTCAGACTCTGACTGGCGCTACGGGCGGCTTTGAAATAAACCGATGCACCGCTTAACTGTAAATCGCCATGGTCGGCAGAGAGTTGTATGc > 1:177710/1‑251 (MQ=255) tGGCGTTAGTCGTCGCCGATAATTTTCAGCGTGGCCATATCCGATGAGTTCACCGTATGACCGGAAAAGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTCAGACTCTGACTGGCGCTACGGGCGGCTTTGAAATAAACCGATGCACCGCTTAACTGTAAATCGCCATGGTCGGCAGAGAGTTGTATGCg > 1:333320/1‑251 (MQ=255) ggCGTTAGTCGTCGCCGATAATTTTCAGCGTGGCCATATCCGATGAGTTCACCGTATGACCGGAAAAGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTCAGACTCTGACTGGCGCTACGGGCGGCTTTGAAATAAACCGATGCACCGCTTAACTGTAAATCGCCATGGTCGGCAGAGAGTTGTATGCGt < 1:274130/251‑1 (MQ=255) gCGTTAGTCGTCGCCGATCATTTTCAGCGTGGCCATATCCGATGAGTTCACCGTATGACCGGAAAAGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTCAGACTCTGACTGGCGCTACGGTCGTCTTTGAAATAAACCGATGCACCGCTTAACTGTAAATCGCCCTGTTCGGCAGAGAGTTGTATGCGtt > 2:480836/1‑251 (MQ=255) gCGTTAGTCGTCGCCGATAATTTTCAGCGTGGCCATATCCGATGAGTTCACCGTATGACCGGAAAAGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTCAGACTCTGACTGGCGCTACGGGCGGCTTTGAAATAAACCGATGCACCGCTTAACTGTAAATCGCCATGGTCGGCAGAGAGTTGTATGCGtt > 1:82085/1‑251 (MQ=255) tcgtcgCCGATAATTTTCAGCGTGGCCATATCCGATGAGTTCACCGTATGACCGGAAAAGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTCAGACTCTGACTGGCGCTACGGGCGGCTTTGAAATAAACCGATGCACCGCTTAACTGTAAATCGCCATGGTCGGCAGAGAGTTGTATGCGTTTCACAAt > 2:29547/1‑251 (MQ=255) cgtcgCCGATAATTTTCAGCGTGGCCATATCCGATGAGTTCACCGTATGACCGGAAAAGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTCAGACTCTGACTGGCGCTACGGGCGGCTTTGAAATAAACCGATGCACCGCTTAACTGTAAATCGCCATGGTCGGCAGAGAGTTGTATGCGTTTcacactg > 2:204308/1‑248 (MQ=255) gtcgCCGATAATTTTCAGCGTGGCCATATCCGCTGAGTTCACCGTATGACAGGAAAAGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTATCGTTATCACTGTTAATGTTGCTCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGCATATTCAGACTCTGACTGGCGCTACGGGCGGCTTTGAAATAAACCGATGCACCGCTTAACTGTAAATCGCCATGGTCGGCAGAGAGTTGTATGCGTTTCACAATGc > 1:390326/1‑251 (MQ=255) aTAATTTTCAGCGTGGCCATATCCGATGAGTTCACCGTATGACCGGAAAAGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTCAGACTCTGACTGGCGCTACGGGCGGCTTTGAAATAAACCGATGCACCGCTTAACTGTAAATCGCCATGGTCGGCAGAGAGTTGTATGCGTTTCACAATGCGACAAAc > 1:159421/1‑251 (MQ=255) tgtCAGCGTTGCCAGATTCGATGATGTCTCCGTATGTCCCGAAAAGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGTGCTAGTCAGTTGTTTGACGTTCTTTTATTGCTGAATGAATATTCAGACTCTGACTGTGGCTACGGGCGGCTTTGAAATAAACCGATGCATCGCTTAACTGTAAATCGCCATGGTCGGCAGAAACTTGTATGCGTTTcgcagtgctccagtcagga < 2:445177/248‑19 (MQ=255) tCAGCGTGGCCATATCCGATGAGTTCACCGTATGACCGGAAAAGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTCAGACTCTGACTGGCGCTACGGGCGGCTTTGAAATAAACCGATGCACCGCTTAACTGTAAATCGCCATGGTCGGCAGAGAGTTGTATGCGTTTCACAATGCGACAAACAGGAAGt > 1:332354/1‑251 (MQ=255) cAGCGTGGCCATATACGATGAGTTCACCGTATGACCGGAAAAGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTGCTGAAGGAATATTCAGACTCTGACTGGCGCTACGGGCGGCTTTGAAATAAACCGATGCACCGCTTAACTGTAAATCGCCATGGTCGGCAGAGAGTTGTATGCGTTTCACAATGCGACAAACAGGAAGt < 1:459488/250‑1 (MQ=255) ccATATCCGATGAGTTCACCGTATGACCGGAAAAGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTCAGACTCTGACTGGCGCTACGGGCGGCTTTGAAATAAACCGATGCACCGCTTAACTGTAAATCGCCATGGTCGGCAGAGAGTTGTATGCGTTTCACAATGCGACAAACAGGAAGTTTCAGCGcc > 2:269426/1‑251 (MQ=255) ccATATCCGATGAGTTCACCGTATGACCGGAAAAGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTCAGACTCTGACTGGCGCTACGGGCGGCTTTGAAATAAACCGATGCACCGCTTAACTGTAAATCGCCATGGTCGGCAGAGAGTTGTATGCGTTTCACAATGCGACAAACAGGAAGTTTCAGCGcc < 2:333320/251‑1 (MQ=255) ccGATGAGTTCACCGTATGACCGGAAAAGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTCAGACTCTGACTGGCGCTACGGGCGGCTTTGAAATAAACCGATGCACCGCTTAACTGTAAATCGCCATGGTCGGCAGAGAGTTGTATGCGTTTCACAATGCGACAAACAGGAAGTTTCAGCGCCAGATc < 1:116969/250‑1 (MQ=255) gAGTTCACCGTATGACCGGAAAAGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTCAGACTCTGACTGGCGCTACGGGCGGCTTTGAAATAAACCGATGCACCGCTTAACTGTAAATCGCCATGGTCGGCAGAGAGTTGTATGCGTTTCACAATGCGACAAACAGGAAGTTTCAGCGCCAGATCGTTGGt > 1:213372/1‑251 (MQ=255) aGTTCACCGTATGACCGGAAAAGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTCAGACTCTGACTGGCGCTACGGGCGGCTTTGAAATAAACCGATGCACCGCTTAACTGTAAATCGCCATGGTCGGCAGAGAGTTGTATGCGTTTCACAATGCGACAAACAGGAAGTTTCAGCGCCAGATCGTTGGtt > 2:478068/1‑251 (MQ=255) aCCGTATGACCGGAAAAGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTCAGACTCTGACTGGCGCTACGGGCGGCTTTGAAATAAACCGATGCACCGCTTAACTGTAAATCGCCATGGTCGGCAGAGAGTTGTATGCGTTTCACAATGCGACAAACAGGCAGTTTCAGCGCCAGATCGTTGGTTTCGtt > 2:430755/1‑251 (MQ=255) cGTATGACCGGAAAAGGTGATTGTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTCAGACTCTGACTGGCGCTACGGGCGGCTTTGAAATAAACCGATGCACCGCTTAACTGTAAATCGCCATGGTCGGCAGAGAGTTGTATGCGTTTCACAATGCGACAAACAGGAAGTTTCAGCGCCAGATCGTTGGTTTCGTTAc < 1:204308/251‑1 (MQ=255) gACCGGAAAAGGTGATTTCTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTCAGACTCTGACTGGCGCTACGGGCGGCTTTGAAATAAACCGATGCACCGCTTAACTGTAAATCGCCATGGTCGGCAGAGAGTTGTATGCGTTTCACAATGCGACAAACAGGAAGTTTCAGCGCCAGATCGTTGGTTTCGTTACGCGGc < 1:20359/251‑1 (MQ=255) accggAAAAGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTCAGACTCTGACTGGCGCTACGGGCGGCTTTGAAATAAACCGATGCACCGCTTAACTGTAAATCGCCATGGTCGGCAGAGAGTTGTATGCGTTTCACAATGCGACAAACAGGAAGTTGCAGCGCCAGATCGTTGGTTTCGTTACGCGGCa < 1:441657/247‑1 (MQ=255) aaaGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTCAGActct < 1:156760/104‑1 (MQ=255) ggTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGCATATTCAGACTCTGACTGGCGCTACGGGCGGCTTTGAAATAAACCGATGCACCGCTTAACTGTAAATCGCCATGGTCGGCAGAGAGTTGTATGCGTTTCACAATGCGACAAACAGGAAGTTTCAGCGCCAGATCGTTGGTTTCGTTACGCGGCATTGCAATg > 1:63843/1‑250 (MQ=255) gcgATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTCAGACTCTGCCTGGCGCTACGGGCGGCTTTGAAATAAACCGATGCACCGCTTAACTGTAAATCGCCATGGTCGGCAGAGAGTTGTATGCGTTTCACAATGCGACAAACAGGCAGTTTCAGCGCCAGATCGTTGGTTTCGTTACGCGGCATTGCAATgac > 2:22100/3‑249 (MQ=255) tGATTTTTGATCCGCAGCGCTTATTGTCGATCTCACTGTTCATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTAAGACTCTGACTGGCGCTACGGGCGGCTTTGAAATAAACCGATGCACCGCTTAACTGTAAATCGCCATGGTAGGCAGAGAGTTGTATGCGTTTCACAATGCTACAACCAGGAAGTTTCAGCGCCAGATCGTTGGTTTCGTTACGCGGCCTTGCAATgc > 2:235687/1‑248 (MQ=255) gagaCGCAGCGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTCAGACTCTGACTGGCGCTACGGGCGGCTTTGAAATAAACCGATGCACCGCTTAACTGTAAATCGCCATGGTCGGCAGAGAGTTGTATGCGTTTCACAATGCGACAAACAGGCAGTTTCAGCGCCAGATCGTTGGTTTCGTTACGCGGCATTGCAATGACGCCgagg > 1:250128/1‑249 (MQ=255) agaCGCAGCGTTTATTGTCGTTAACACGGTTAATGATGATCCAGTCAGTGGTTTGCACTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTCAGACGATGACTGGCGATACGGGCGGAATTGAAATAAACCGATGCACAGCTTAACTGAAAATCGCCATGGTCGGCAGAGAGTTGTATGCGTTTCACAATGCGACAAACAGGAAGTGTCAGCGCCAGAGCGTTGGTTTCGTAACGCGGCATTGTAATGACGCCGagtagt < 2:157769/251‑1 (MQ=255) atcGTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCCATGCAGTTGTTTGGTCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTCAGACTCTGACTGGCGCTACGTGCGGCTTTGAAATAAACCGATGCACCGCTTAACTGTAAAGCGCCATGTTCGTCAGTTAGTTGTATGCGTTTCACAATGCGACAAACAGGAAGTTTCAGCGCTAGATCGTTGTTATCGGTACGCGGCATTGCAATGACGCCGAGGATTATATgg < 2:628826/249‑1 (MQ=255) gTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTCAGACTCTGACTGGCGCTACGGGCGGCTTTGAAATAAACCGATGCACCGCTTAACTGTAAATCGCCATGGTCGGCAGAGAGTTGTATGCGTTTCACAATGCGACAAACAGGAAGTTTCAGCGCCAGATCGTTGGTTTCGTTACGCGGCATTGCAATGACGCCGAGGAGTTTATGGTCg > 1:418975/1‑251 (MQ=255) gTTTATTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTCAGACTCTGACTGGCGCTACGGGCGGCTTTGAAATAAACCGATGCACCGCTTAACTGTAAATCGCCATGGTCGGCAGAGAGTTGTATGCGTTTCACAATGCGACAAACAGGAAGTTTCAGCGCCAGATCGTTGGTTTCGTTACGCGGCATTGCAATGACGCCGAGGAGTTTATGGTCg > 1:431747/1‑251 (MQ=255) aTTGTCGTTATCACTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTCAGACTCTGACTGGCGCTACGGGCGGCTTTGAAATAAACCGATGCACCGCTTAACTGTAAATCGCCATGGTCGGCAGAGAGTTGTATGCGTTTCACAATGCGACAAACAGGAAGTTTCAGCGCCAGATCGTTGGTTTCGTTACGCGGCATTGCAATGACGCCGAGGAGTTTATGGTCGTTTg > 1:110387/1‑251 (MQ=255) ggTCGTTATCCCTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTCAGACTCTGACTGGCGCTACGGGCGGCTTTGAAATAAACCGATGCACCGCTTAACTGTAAATCGCCATGGTCGGCAGAGAGTTGTATGCGTTTCACAATGCGACAAACAGGAAGTTTCAGCGCCAGATCGTTGGTTTCGTTACGCGGCATTGCAATGACGCCGAGGAGTTTATGGTCGTTTGcc < 2:340306/250‑1 (MQ=255) | GGAGAGGCGAGTTTTGCCTTTTTCATTATGGGTGAGCAATCGGGCGAAATTTGCCAACTGTTCCTCACTACAATGCTGAAGAAAATCCAGATCTGAATCATTCAGGTAATTAACATTCATTTTTTGTGGCTTCTATATTCTGGCGTTAGTCGTCGCCGATAATTTTCAGCGTGGCCATATCCGATGAGTTCACCGTATGACCCGAAAAGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCGCTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTCAGGCTCTGACTGGCGCTACGGGCGGCTTTGAAATAAACCGATGCACCGCTTAACTGTAAATCGCCATGGTCGGCAGAGAGTTGTATGCGTTTCACAATGCGACAAACAGGAAGTTTCAGCGCCAGATCGTTGGTTTCGTTACGCGGCATTGCAATGGCGCCGAGGAGTTTATGGTCGTTTGCC > NC_000913/11237‑11721 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |