Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 9,665 | G→T | V120V (GTG→GTT) | mog → | molybdopterin adenylyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 9,665 | 0 | G | T | 97.5% | 252.2 / NA | 81 | V120V (GTG→GTT) | mog | molybdopterin adenylyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/2); new base T (41/38); total (41/40) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.41e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GAACTGGAAACCCGCTTAATCCCCGATGAGCAGGCGATCATCGAGCAAACGTTGTGTGAGCTGGTGGATGAAATGAGTTGCCATCTGGTGCTCACCACGGGCGGAACTGGCCCGGCGCGTCGTGACGTAACGCCCGATGCGACGCTGGCAGTAGCGGACCGCGAGATGCCTGGCTT‑TGGTGAACAGATGCGCCAGATCAGCCTGCATTTTGTACCAACTGCGATCCTTTCGCGTCAGGTGGGCGTGATTCGCAAACAGGCGCTGATCCTTAACTTACCCGGTCAGCCGAAGTCTATTAAAGAGACGCTGGAAGGTGTGAAGGACGCTGAGGGTAACGTTGTGGTACACGGTATTTTTGCCAGCGTACCGTACTGCATTCAGTTGCTGGAAGGGCCATACGTTGAAACGGCACCGGAAGTGGTTGCAGCATTCAGACCGAAGAGTGCAAGACGCGACGTTAGCGAATAAAAAAATCCCCCCG > NC_000913/9426‑9906 | gAACTGGAAACC‑GCTTAATCCCCGATGAGCAGGCGATCATCGAGCAAACGTTGTGTGAGCTAGTGGATGAAATGAGTTGCCATCTGGTGCTCACCACGGGCGGAACTGGCCCGGCGCGTCGTGACGTAACGCCCGATGCGACGCTGGCAGTAGCGGACCGCGAGATGCCTGGCTT‑TGGTGAACAGATGCGCCAGATAAGCCTGCATTTTGTACCAACTGCGATCCTTTCGCGTCAGGTTGGTGTGATTCg < 2:293509/250‑1 (MQ=255) tGGAAACCCGCTTAATCCCCGATGAGCAGGCGATCATCGAGCAAACGTTGTGTGAGCTAGTGGATGAAATGAGTTGCCATCTGGTGCTCACCACGGGCGGAACTGGCCCGGCGCGTCGTGACGTAACGCCCGATGCGACGCTGGCAGTAGCGGACCGCGAGATGCCTGGCTT‑TGGTGAACAGATGCGCCAGATAAGCCTGCATTTTGTACCAACTGCGATCCTTTCGCGTCAGGTTGGTGTGATTCGCaa > 2:339280/1‑250 (MQ=255) aaaCCCGCTTAATCCCCGATGAGCAGGCGATCATCGAGCAAACGTTGTGTGAGCTAGTGGATGAAATGAGTTGCCATCTGGTGCTCACCACGGGCGGAACTGGCCCGGCGCGTCGTGACGTAACGCCCGATGCGACGCTGGCAGTAGCGGACCGCGAGATGCCTGGCTT‑TGGTGAACAGATGCGCCAGATAAGCCTGCATTTTGTACCAACTGCGATCCTTTCGCGTCAGGTTGGTGTGATTCGCAAACAg < 1:241964/251‑1 (MQ=255) aCCCGATTAATCCCCGATGAGCAAGCGATCATCGAGCACAAGTTGTGTGAGCTAGTGGCTGAAATGAGTTGCCATCTGGTGCTCACCACGGGCGGAACTGGCCCGGCGCGTCGTGACGTACCGCCCGGTGCGACGCTGGCAGTAGCGGACAGCGAGATGCCGGGCTT‑TGGTGTACCGATGCGCCAGATAAACCTGCATTTGGTACCAACTGCGATCCTTTCGCGTCAGGTTGGTGTGATTCGCAAACAgac > 2:249565/1‑249 (MQ=255) gCTTAATCCCCGATGAGCAGGCGATCATCGAGCAAACGTTGTGTGAGCTAGTGGATGAAATGAGTTGCCATCTGGTGCTCACCACGGGCGGAACTGGCCCGGCGCGTCGTGACGTAACGCCCGATGCGACGCTGGCAGTAGCGGACCGCGAGATGCCTGGCTT‑TGGTGAACAGATGCGCCAGATAAGCCTGCATTTTGTACCAACTGCGATCCTTTCGCGTCAGGTTGGTGTGATTCGCAAACAGGCGCTg > 2:520273/1‑251 (MQ=255) cTTAATCCCCGATGAGCAGGCGATCATCGAGCAAACGTTGTGTGAGCTAGTGGATGAAATGAGTTGCCATCTGGTGCTCACCACGGGCGGAACTGGCCCGGCGCGTCGTGACGTAACGCCCGATGCGACGCTGGCAGTAGCGGACCGCGAGATGCCTGGCTT‑TGGTGAACAGATGCGCCAGATAAGCCTGCATTTTGTACCAACTGCGATCCTTTCGCGTCAGGTTGGTGTGATTCGCAAACAGGCGCTg > 2:10752/1‑250 (MQ=255) tAATCCCCGATGAGCAGGCGATCATCGAGCAAACGTTGTGTGAGCTAGTGGATGAAATGAGTTGCCATCTGGTGCTCACCACGGGCGGAACTGGCCCGGCGCGTCGTGACGTAACGCCCGATGCGACGCTGGCAGTAGCGGACCGCGAGATGCCTGGCTT‑TGGTGAACAGATGCGCCAGATAAGCCTGCATTTTGTACCAACTGCGATCCTTTCGCGTCAGGTTGGTGTGATTCGCAAACAGGCGCTGAt < 1:452844/250‑1 (MQ=255) 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gtgtgAGCTAGTGGATGAAATGCGTTGCCATCTGGTGCTCACCACGGGCGGAACTGGCCCGGCGCGTCGTGACGTAACGCCCGATGCGACGCTGGCAGTAGCGGACCGCGAGATGCCTGGCTT‑TGGTGAACAGATGCGCCAGATAAGCCTGCATTTTGTACCAACTGCGATCCTTTCGCGTCAGGTTGGTGTGATTCGCAAACAGGCGCTGATCCTTAACTTACCCGGTCAGCCGAAGTCTATTAAag > 2:257675/1‑248 (MQ=255) gagctcgaggATGAAATGAGTTGCCATCTGGCGCTCACCCCGGGCGGAACTGGACCGGAGCGACGTGACGTAACGCCAGATGCGACGATGGCAGTAGCGGACCGCGAGATGCCTGGCCT‑TGGTGAACAGATGCGCCAGATAAGCCTGCATTTTGTACCAACTGCGCTACTTTCGCGTCAGGTTGGTGTGCTTCGCAAACAGGCGCTGATCCTTAACTTCCCCGGTCAGCCGAAGTCTATTAAAGAGACGCt > 2:419196/9‑251 (MQ=255) agtggATGAAATGAGTTGCCATCTGGTGCTCACCACGGGCGGAACTGGCCCGGCGCGTCGTGACGTAACGCCCGATGCGCCGCTGGCAGTAGCGGACCGCGAGATGCCTGGCTT‑TGGTGAACAGATGCGCCAGATAAGCCTGCATTTTGTACCAACTGCGATCCTTTCGCGTCAGGTTGGTGTGATTCGCAAACAGGCGCTGATCCTTAACTTACCCGGTCAGCCGAAGTCTATTAAAGAGACGCTGGa > 1:233099/2‑249 (MQ=255) 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aTCTGGTGCTCACCACGGGCGGAACTGGCCCGGCGCGTCGTGACGTAACGCCCGATGCGACGCTGGCAGTAGCGGACCGCGAGATGCCTGGCTT‑TGGTGAACAGATGCGCCAGATAAGCCTGCATTTTGTACCAACTGCGATCCTTTCGCGTCAGGTTGGTGTGATTCGCAAACAGGCGCTGATCCTTAACTTACCCGGTCCGCCGAAGTCTATTAAAGAGACGCTGGAAGGTGTGAAGGACGATGCGGGt > 2:354974/1‑251 (MQ=255) ggTGCTCACCACGGGCGGAACTGGCCCGGCGCGTCGTGACGTAACGCCCGATGCGACGCTGGCAGTAGCGGACCGCGAGATGCCTGGCTT‑TGGTGAACAGATGCGCCAGATAAGCCTGCATTTTGTACCAACTGCGATCCTTTCGCGTCAGGTTGGTGTGATTCGCAAACAGGCGCTGATCCTTAACTTACCCGGTCAGCCGAAGTCTATTAAAGAGACGCTGGAAGGTGTGAAGGACGCTGCGGGTAAc < 1:192175/250‑1 (MQ=255) ggTGCTCACCACGGGCGGAACTGGCCCGGCGCGTCGTGACGTAACGCCCGATGCGACGCTGGCAGTAGCGGACCGCGAGATGCCTGGCTT‑TGGTGAACAGATGCGCCAGATAAGCCTGCATTTTGTACCAACTGCGATCCTTTCGCGTCAGGTTGGTGTGATTCGCAAACAGGCGCTGATCCTTAACTTACCCGGTCAGCCGAAGTCTATTAAAGAGACGCTGGAAGGTGTGAAGGACGCTGCGGGTAAc < 1:520273/250‑1 (MQ=255) ggTGCTCACCACGGGCGGAACGGGCCCGGCGCGTCGGGACGTAACGCCCGATGCGACGCTGGCAGTAGCGGACCGCGAGATGCCTGGCTT‑TGGTGAACAGATGCGCCAGATAAGCCTGCATTTTGTACCAACTGCGATCCTTTCGCGTCAGGTTGGTGTGATTCGCAAACAGGCGCTGATCCTTAACTTACCCGGTCAGCCGAAGTCTATTAAAGAGACGCGGGAAGGTGTGAAGGACGCTGCGGGTAAc < 2:312779/250‑1 (MQ=255) gTGCTCACCACGGGCGGAACTGGCCCGGCGCGTCGTGACGTAACGCCCGATGCGACGCTGGCAGTAGCGGACCGCGAGATGCCTGGCTT‑TGGTGAACAGATGCGCCAGATAAGCCTGCATTTTGTACCAACTGCGATCCTTTCGCGTCAGGTTGGTGTGATTCGCAAACAGGCGCTGATCCTTAACTTACCCGGTCAGCCGAAGTCTATTAAAGAGACGCTGGAAGGTGTGAAGGACGCTGCGGGTAACGt > 1:41754/1‑251 (MQ=255) tCACCACGGGCGGAACTGGCCCGGCGCGTCGTGACGTAACGCCCGATGCGACGCTGGCAGTAGCGGACCGCGAGATGCCTGGCTT‑TGGTGAACAGATGCGCCAGATAAGCCTGCATTTTGTACCAACTGCGATCCTTTCGCGTCAGGTTGGTGTGATTCGCAAACAGGCGCTGATCCTTAACTTACCCGGTCAGCCGAAGTCTATTAAAGAGACGCTGGAAGGTGTGAAGGACGCTGCGGGTAACGTtgtg > 1:351445/1‑251 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |