| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,639,217 | C→T | T347I (ACC→ATC) | creD → | putative inner membrane protein CreD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,639,217 | 0 | C | T | 98.2% | 170.6 / NA | 57 | T347I (ACC→ATC) | creD | putative inner membrane protein CreD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (30/26); minor base G (0/1); total (30/27) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.74e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CAGGCAATGATACCGGCTGGGAAAACTTCCCGGCGTTTAGCGTCGCAGTAACGACGCCAGCCGATCAATACCAATTAACTGACCGGGCGACTAAGTACGCCATTCTGCTGATTGCACTGACTTTTATGGCGTTCTTTGTTTTTGAAACGCTCACCGCGCAACGTTTACACCCAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGTGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCATGATGTTTGTGACCCGTAATATCGACTGGTATGC > NC_000913/4638974‑4639460 | cAGGCAATGATACCGGCTGGGAAAACTTCCCCGCGTTTAGCGTCGCAGTGACGACGCCAGCCGATCAATACCAATTAACGGACCGGGCGACTAAGTACGCCATTCTGCTGATTGCACTGACTTTTATGGCGTTCTTTGTTTTTGAAACGCTCACCGCGCAACGTTTACACCCAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATATCGGttt < 2:236351/250‑1 (MQ=255) cAATGATACCGGCTGGGAAAACTTCCCCGCGTTTAGCGTCGCAGTGACGACGCCAGCCGATCAATACCAATTAACGGACCGGGCGACTAAGTACGCCATTCTGCTGATTGCACTGACTTTTATGGCGTTCTTTGTTTTTGAAACGCTCACCGCGCAACGTTTACACCCAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATATCGGTTTTACCg < 1:55628/251‑1 (MQ=255) gATACCGGCTGGGAAAACTTCCCCGCGTTTAGCGTCGCAGTGACGCCGCCAGCCGATCAATACCAATTAACGGACCGGGCGACTAAGTACGCCATTCTGCTGATTGCACTGACTTTTATGGCGTTCTTTGTTTTTGAAACGCTCACCGCGCAACGTTTACACCCAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATATCGGTTTTAACGTGGc > 2:336067/1‑251 (MQ=255) aTACCGGCTGGGAAAACTTCCCCGCGTTTAGCGTCGCAGTGACGACGCCCGCCGATCAATACCAATTAACGGACCGGGCGCCTAAGTACGCCATTCTGCTGATTGCACTGACTTTTATGGCGTTCTTTGTTTTTGAAACGCTCACCGCGCAACGTTTACACCCAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATATCGGTTTTACCGTGGc > 1:598626/1‑250 (MQ=255) aCCGGCTGGGAAAACTTCCCCGCGTTTAGCGTCGCAGTGACGACGCCAGCCGATCAATACCAATTAACGGACCGGGCGACTAAGTACGCCATTCTGCTGATTGCACTGACTTTTATGGCGTTCTTTGTTTTTGAAACGCTCACCGCGCAACGTTTACACCCAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATATCGGTTTTACCGTGGCATg > 1:543647/1‑251 (MQ=255) aCCGGCTGGGAAAACTTCCCCGCGTTTAGCGTCGCAGTGACGACGCCAGCCGATCAATACCAATTAACGGACCGGGCGACTAAGTACGCCATTCTGCTGATTGCACTGACTTTTATGGCGTTCTTTGTTTTTGAAACGCTCACCGCGCAACGTTTACACCCAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATATCGGTTTTACCGTGGCATg > 1:410600/1‑251 (MQ=255) aCCGGCTGGGAAAACTTCCCCGCGTTTAGCGTCGCAGTGACGACGCCAGCCGATCAATACCAATTAACGGACCGGGCGACTAAGTACGCCATTCTGCTGATTGCACTGACTTTTATGGCGTTCTTTGTTTTTGAAACGCTCACCGCGCAACGTTTACACCCAATGCAATATTTGCGGGTGGTGCTTTCATTGGTGATGTTTTATGGGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATATCGGTTTTACCGTGGCATg < 1:95029/251‑1 (MQ=255) cGGCTGGGAAAACTTCCCCGCGTTTAGCGTCGCAGTGACGACGCCCGCCGATCAATACCAATTAACGGACCGGGCGACTAAGTACGCCATTCTGCTGATTGCACTGACTTTTATGGCGTTCTTTGTTTTTGAAACGCTCACCGCGCAACGTTTACACCCAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATATCGGTTTTACCGTGGCATgg > 2:379892/1‑250 (MQ=255) ggAAAACTTCCCCGCGTTTAGCGTCGCAGTGACGACGCCAGCCGATCAATACCAATTAACGGACCGGGCGACTAAGTACGCCATTCTGCTGATTGCACTGACTTTTATGGCGTTCGTTTTTTTTGAAACGCTCACCGCTCAACGTTTACACCCAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGTGCTTGCTGGCGCTTTCGGAACATATCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCg < 1:390201/251‑1 (MQ=255) gCGTTTAGCGGCGCAGTGACGACGCCAGCAGATCAATACCAATTAACGGACCGGGCGACTAAGTACGCCATTCTGCTGATTGCACTGACTTTTATGGCGTTCTTTGTTTTTGAAACGCTCACCGCGCAACGTTTACACCCAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATATCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTgg < 1:336067/251‑1 (MQ=255) 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tgacgacgcaactcggtCAATACCAGTTAACGGACCGGGCGACTAAGTAAGCCATTCAGCTGATTGCACTGACTTTTATGGCGTTCTTTGTTTTTGAAACGCTCACCGCGCAACGTTTACACCCAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATATCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGTTAATGAACGGt > 2:372487/17‑251 (MQ=255) cgacgCCAGCCGATCAATACCAATTAACGGACCGGGCGACTAAGTACGCCATTCTGCTGATTGCACTGACTTTTATGGCGTTCTTTGTTTTTGAAACGCTCACCGCGCAACGTTTACACCCAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATATCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGTTAATGAACGGtatt < 1:74660/251‑1 (MQ=255) ccGATCAATACCAATTAACGGACCGGGCGACTAAGTACGTCATTCTGCTGATGGCACTGACTGTTATGGCGTTTTTTGTTTTTGAAACGCTCACCGCGCAACGTTTACACCCAATGTAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATATCGGTTTTTCCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGTTAATGAACGGTATTTATTTGCag < 2:350631/251‑2 (MQ=255) aTCAATACCAATTAACGGACCGGGCGACTAAGTACGCCATTCTGCTGATTGCACTGACTTTTATGGCGTTCTTTGTTTTTGAAACGCTCACCGCGCAACGTTTACACCCAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCGCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATATCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGTTAATGAACGGTATTTATTTGCAGGCg < 2:262924/251‑1 (MQ=255) tCAATACCAATTAACGGACCGGGCGACTAAGTACGCCATTCTGCTGATTGCACTGACTTTTATGGCGTTCTTTGTTTTTGAAACGCTCACCGCGCAACGTTTACACCCAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATATCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGTTAATGAACGGTATTTATTTGCAGGCgg > 1:283715/1‑251 (MQ=255) cAATACCAATTAACGGACCGGGCGACTAAGTACGCCATTCTGCTGATTGCACTGACTTTTATGGCGTTCTTTGTTTTTGAAACGCTCACCGCGCAACGTTTACACCCAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATATCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGTTAATGAACGGTATTTATTTGCAGGCGGt > 1:266957/1‑251 (MQ=255) cAATACCAATTAACGGACCGGGCGACTAAGGACGCCATTCTGCTGATTGCACTGACTTTTATGGCGTTCTTTGTTTTTGAAACGCTCACCGCGCAACGTTTACACCCAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATATCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGTTAATGAACGGTATTTATTTGCAGGCgg < 2:410600/250‑1 (MQ=255) tACCAATTAACGGACCGGGCGACTAAGTACGCCATTCTGCTGATTGCACTGACTTTTATGGCGTTCTTTGTTTTTGAAACGCTCACCGCGCAACGTTTACACCCAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATATCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGTTAATGAACGGTATTTATTTGCAGGCGGtttt > 2:12985/1‑248 (MQ=255) cAATTAACGGACCGGGCGACTAAGTACGCCATTCTGCTGATTGCACTGACTTTTATGGCGTTCTTTGTTTTTGAAACGCTCACCGCGCAACGTTTACACCCAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATATCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGTTAATGAACGGTATTTATTTGCAGGCGGTAtttg > 2:233316/1‑248 (MQ=255) gACCGGGCGACTAAGTACGCCATTCTGCTGATTGCACTGACTTTTATGGCGTTCTTTGTTTTTGAAACGCTCACCGCGCAACGTTTACACCCAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATATCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGTTAATGAACGGTATTTATTTGCAGGCGGTATTGAAAGGCTggcg < 1:192898/251‑3 (MQ=255) gggCGACTAAGAACGACATTCTGCTGATTGCACTGACTTTTAAGGCGTTCTTTGTTTTTGAAACGCTAACCGCGCAACGTTTACACCCAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTAATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATATCGGTTTTAACGTGGAATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGTTAATGAACGGTATTTATTTGCAGGCGGAATTGAAAggacggggcca > 1:209217/1‑241 (MQ=255) cGACTAAGTACGCCATTCTGCTGATTGCACTGACTTTTATGGCGTTCTTTGTTTTTGAAACGCTCACCGCGCAACGTTTACACCCAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATATCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGTTAATGAACGGTATTTATTTGCAGGCGGTATTGAAAGGCTGGCGCAACAGc < 1:441824/251‑1 (MQ=255) cGCCATTCTGCTGATTGCACTGACTTTTATGGCGTTCTTTGTTTTTGAAACGCTCACCGCGCAACGTTTACACCCAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATATCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGTTAAt < 2:364037/195‑1 (MQ=255) cGCCATTCTGCTGATTGCACTGACTTTTATGGCGTTCTTTGTTTTTGAAACGCTCACCGCGCAACGTTTACACCCAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATATCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGTTAAt > 1:364037/1‑195 (MQ=255) gctgATTGCACTGACTTTTATGGCGTTCTTTGTTTTTGAAACGCTCACCGCGCAACGTTTACACCCAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATATCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGTTAATGAACGGTATTTATTTGCAGGCGGTATTGAAAGGCTGGCGCAACAGCATGTTGTTTACCCTcgcg < 1:557990/250‑1 (MQ=255) cTGACTTTTATGGCGTTCTTTGTTTTTGAAACGCTCACCGCGCAACGTTTACACCCAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATATCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGTTAATGAACGGTATTTATTTGCAGGCGGTATTGAAAGGCTGGGGCAACAGCATGTTGTTTTACCTCGCGCTGTTGTTGCt > 2:17349/1‑251 (MQ=255) 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accGCTCACCGCGCAACGTTTACACCCAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATATCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGTTAATGAACGGTATTTATTTGCAGGCGGTATTGAAAGGCTTGCGCACCAGCATGTTGTTTACCCCCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGGGTGATGTGGGGACTGATCAAcc > 2:123981/3‑250 (MQ=255) cGCTCACCGCGCAACGTTTACACCCAAAGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATATCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGTTAATGAACGGTATTTATTTGCAGGCGGTATTGAAAGGCTGGCGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGTGGGGACTGCTCAActct < 2:482898/251‑1 (MQ=255) ccccGCGCAACGTTTACACCCAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATATCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGTTAATGAACGGTATTTATTTGCAGGCGGTATTGAAAGGCTGGCGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGTGGGGACTGCTCAACTCTGc < 2:189617/247‑1 (MQ=255) aCCGCGCAACGTTTACACCCAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGCGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATATCGGTTTTACCGTGGCATGGCTAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGTTAATGAACGGTATTTATTTGCAGGCGGTATTGAAAGGCTGGCGCAACCGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGTGGGGACTGCTCAACTCTGCCg > 1:219120/1‑250 (MQ=255) aaCGTTTAAACCAAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTAATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTATGAACATATCGGTTTTACCGTGGCCTGGTTAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGTTAATGAACGGTATTTATTTGCAGGAGGTATTGAAAGGCTGGCGCAAACGAATGTTGTTTACCCTCGCGCCGTTGTTGCTGGATGGGGTGGTGGGGGGACTGCTCAACACTGCCGATAggggg > 2:362985/1‑247 (MQ=255) acacCCAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATATCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGTTAATGAACGGTATTTATTTGCAGGCGGTATTGAAAGGCTGGCGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGTGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCtgttg < 1:293662/250‑1 (MQ=255) ccccAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGGTGTTTTATTTGCTCTTGTTGGCGCTTTCGGAACATATCGGTTTTACCGTGGCAGGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGTTAATGAACGGTATTTATTTGCAGGCGGTATTGAAAGGCTGGCGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGTGGGGACGGCTCAACCCTGCCGATAGCGCGCTGttgttg < 2:62703/250‑1 (MQ=255) cccAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATATCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGTTAATGAACGGTATTTATTTGCAGGCGGTATTGAAAGGCTGGCGCCACCGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTTCTGGGTGGTGTGATGTGGGGGCTGCTCCACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTgg > 2:564946/1‑251 (MQ=255) ccAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATAGCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGTTAATGAACGGTATTTATTTGCAGGCGGTATTGAAAGGCTGGCGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGTGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTggg < 2:460339/251‑1 (MQ=255) aaTGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATATCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGTTAATGAACGGTATTTATTTGCAGGCGGTATTGAAAGGCTGGCGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGTGGGGGCTGCTCAACTCTGCCGAATGCGCGCTGTTGTTGGGa > 1:458393/1‑250 (MQ=255) aTGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATATCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGTTAATGAACGGTATTTATTTGCAGGCGGTATTGAAAGGCTGGCGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGTGGGGACTGCTCCACTCTGCCGTTAGCGCGCTGTTGTTggggac > 2:193914/1‑248 (MQ=255) aTGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATATCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGTTAATGAACGGTATTTATTTGCAGGCGGTATTGAAAGGCTGGCGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGGGTGATGTGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAAc > 1:426933/1‑251 (MQ=255) 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1:316425/249‑4 (MQ=255) ttGCTGGCGCTTTCTGAACATATCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGTTAATGAACGGTATTTATTTGCAGGCGGTATTGAAAGGCTGGCGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGGGTGATGTGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGGGCTGGCCGGCATGATGTTTGTGACTCGTa > 1:391128/1‑250 (MQ=255) gAACATATCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGTTAATGAACGGTATTTATTTGCAGGCGGTATTGAAAGGCTGGCGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGTGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCATGATGTTTGTTACTCGTAATATCGACTGGTATGc < 2:391128/251‑1 (MQ=255) gAACATATCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGTTAATGAACGGTATTTATTTGCAGGCGGTATTGAAAGGCTGGCGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGTGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCATGATGTTTGTGACTCGTAATATCGACTGGTAt < 1:309403/249‑1 (MQ=255) | CAGGCAATGATACCGGCTGGGAAAACTTCCCGGCGTTTAGCGTCGCAGTAACGACGCCAGCCGATCAATACCAATTAACTGACCGGGCGACTAAGTACGCCATTCTGCTGATTGCACTGACTTTTATGGCGTTCTTTGTTTTTGAAACGCTCACCGCGCAACGTTTACACCCAATGCAATATTTGCTGGTGGGGCTTTCATTGGTGATGTTTTATTTGCTCTTGCTGGCGCTTTCTGAACATACCGGTTTTACCGTGGCATGGATAATCGCCAGTCTGATTGGGGCGATAATGAACGGTATTTATTTGCAAGCGGTATTGAAAGGTTGGTGCAACAGCATGTTGTTTACCCTCGCGCTGTTGTTGCTGGATGGTGTGATGTGGGGACTGCTCAACTCTGCCGATAGCGCGCTGTTGTTGGGAACCAGTGTGCTGGTGGTGGCGCTGGCCGGCATGATGTTTGTGACCCGTAATATCGACTGGTATGC > NC_000913/4638974‑4639460 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |