| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 293,207 | IS2 (–) +5 bp | intergenic (‑259/+9) | yagK ← / ← yagL | uncharacterized protein YagK/resolvase‑like catalytic domain‑containing protein YagL |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 293207 = | 1 (0.020) | 51 (0.820) | 48/488 | 0.3 | 98.0% | intergenic (‑259/+13) | yagK/yagL | uncharacterized protein YagK/resolvase‑like catalytic domain‑containing protein YagL |
| ? | NC_000913 | 381260 = | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 293211 | 0 (0.000) | 45 (0.720) | 42/488 | 0.4 | 100% | intergenic (‑263/+9) | yagK/yagL | uncharacterized protein YagK/resolvase‑like catalytic domain‑containing protein YagL |
| ? | NC_000913 | = 382590 | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
ATTTGGTCCTACGGTCTATAGCAGACCGTACAGGGATGCCATACAGGCAGGGCTATTCCTGGTCACTGTTGTCGGTATATACTGGTATCAGATTTTAGTACGGACATACTGATCTGATTACTACTCTTACTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAATTTGAGACGAAGGTAGCCCCAGCCTGTGATGGCTGTTAAAAAGTTACTCTGCAATTAGCTTCTGGAATTAACCGATGATTCCGTTATTCCAGTGCCGCTTCACAGTCGATAAACTGATACTCAATTTCTTTGCAATCTCAGCCTGAGTAAATCCACCTTTCTTAAGTATTGTGATATCACGTCGGTATTTGCTTCCCTCCTTTCGTCCTAATTTTTTCTTAACATGTCGATATCGGCTTTTAGTTGATTTCAGATTGTGAATGTCAATCGTATCCTGACGAGCAATCAAAAAAGACA > NC_000913/292962‑293449 | gcttacgccagagaaataactggctggcttctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTTAGc > 2:286357‑M1/246‑250 (MQ=255)aTTTGGTCCTACGGTCTATAGCAGACCGTACAGGGATGCCATACAGGCAGGGCTATTCCTGGTCACTGTTGTCGGTATATACTGGTATCAGATTTTAGTACGGACATACTGATCTGATTACTACTCTTACTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAATTTGAGACGAAGGTAGCCCCAGCCTGTGATGGCTGTTAAAAAGTTACTCTGCAATTAGCt > 2:102213/1‑251 (MQ=255) tttGGTCATACGGTCTATAGCAGACCGTACAGGGATGCCATACAGGCAGGGCTATTCCTGGTCACTGTTGTCGGTATATACTGGTATCAGATTTTAGTACGGACATACTGATCTGATTACTACTCTTACTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAATTTGAGACGAAGGTAGCACCAGCCTGTGATGGCTGTTAAAAAGTTACTCTGCAATTAGCtg > 1:159443‑M1/1‑249 (MQ=255) ttGGTCCTACGGTCTATAGCAGACCGTACAGGGATGCCATACAGGCAGGGCTATTCCTGGTCACTGTTGTCGGTATATACTGGTATCAGATTTTAGTACGGACATACTGATCTGATTACTACTCTTACTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACATATCCAACATCTAAATTTGAGACGAAGGTAGCCCCAGCCTGTGATGGCTGTTAAAAAGTTACTCTGCAATTAGCtgg > 2:91552‑M1/1‑248 (MQ=255) 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gTACAGGGATGCCATACAGGCAGGGCTATTCCTGGTCACTGTTGTCGGTATATACTGGTATCAGATTTTAGTACGGACATACTGATCTGATTACTACTCTTACTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAATTTGAGACGAAGGTAGCCCCAGCCTGTGATGGCTGTTAAAAAGTTACTCTGCAATTAGCtggatttgcccctatatttccagacatc > 1:549873‑M1/1‑223 (MQ=255) acaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTTAGCTTCTGGAATTAACCGATGATTCCGTTATTcc > 1:57633‑M1/214‑249 (MQ=255) gCCATACAGGCAGGGCTATTCCTGGTCACTGTTGTCGGTATATACTGGTATCAGATTTTAGTACGGACATACTGATCTGATTACTACTCTTACTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAATTTGAGACGAAGGTAGCCCCAGCCTGTGATGGCTGTTAAAAAGTTACTCTGCAATTAGCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcact > 1:396428‑M1/1‑213 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |