| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 3,729,449 | IS1 (+) +9 bp | noncoding (89‑97/160 nt) coding (1309‑1317/1323 nt) |
xylZ ← xylA ← |
small RNA XylZ xylose isomerase |
| New junction evidence | |||||||||||
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xylZ xylA |
small RNA XylZ xylose isomerase |
|||||
| * | ? | NC_000913 | 3583428 = | NA (NA) | 82 (1.460) | 73/492 | 0.0 | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3729457 | 0 (0.000) | noncoding (89/160 nt) coding (1309/1323 nt) |
xylZ xylA |
small RNA XylZ xylose isomerase |
|||||
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
GCGCGATCAGTTGCCTGCCACCACTGTTCCGGGTCTTGTTCCGACCAGAGTGGATGCGGGCGCGAAACGGTCAGCTTTTCCGTTTGCGCAGCAACCACCTCACCCTGCTCGTTGAGCAAAATAACTTTTACGCCCGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGGTATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTCCAGTTGTTCCTGGCGACCACTCTGATGCACCGGAGACAAATGATGTTCCTGAGCATATTTGGCTAAATCTGCCAGTGACATTTGGCCTTTCAGGATTTGCTGGCCCAATTCGCTATTCCAGCCGGAATAACGCTGCGCGATGCGTTTATCCAGCTCGCCATCTTCAATCATGCGCGCTGCAATTTTCAGCGCCAGTGCCATCGTATCCATCGCGCCGATATGAC > NC_000913/3729208‑3729702 | gacgtggtgatatggatgacggatgcctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacagagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaagaagttggagtcattgccGTCGAACAGAt < 2:169676‑M2/11‑1 (MQ=255) cgcgATCAGTTGCCTGCCACCACTGTTCCGGGTCTTGTTCCGACCAGAGTGGATGCGGGCGCGAAACGGTCAGCTTTTCCGTTTGCGCAGCAACCACCTCACCCTGCTCGTTGAGCAAAATAACTTTTACGCCCGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGGTATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGgg > 1:71745‑M2/1‑249 (MQ=255) cgATCAGTTGCCTGCCACCACTGTTCCGGGTCTTGTTCCGACCAGAGTGGATGCGGGCGCGAAACGGTCAGCTTTTCCGTTTGCGCAGCAACCACCTCACCCTGCTCGTTGAGCAAAATAACTTTTACGCCCGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGGTATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGggtg > 1:155803‑M2/1‑247 (MQ=255) ggtgatatggatgacggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGTCGAACAGATAATg < 1:374742‑M2/15‑1 (MQ=255) 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ggTCTTGTTCCGACCAGAGTGGATGCGGGCGCGAAACGGTCAGCTTTTCCGTTTGCGCAGCAACCACCTCACCCTGCTCGTTGAGCAAAATAACTTTTACGCCCGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGGTATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCACAGTTAGCCGTTATTTGTCGAACAGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtat > 1:119136‑M2/1‑219 (MQ=255) ccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTCCAGTTGTTCCt < 1:99259‑M2/41‑1 (MQ=255) ccgcagtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgctgcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTCCAGTTTTTCCt < 2:565197‑M2/41‑1 (MQ=255) gtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGTCGAACAGATAATGGTTTACCAGATTTTCCAGTTGTTCCTGGCg > 1:444624‑M2/206‑250 (MQ=255) atgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGTCGACCAGATATTGGTTTACCAGATTTTCCAGTTGTTCCTGGCGAcc > 1:455458‑M2/204‑251 (MQ=255) gaatcacgcctgaagggaaagctgctcgttatcagcaagcgttacacgcagcgcattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcggtctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacgctatcaataagttggagtcattaccGTCGAACAGAGAATGGTTTACCAGATTTTCGAGTTGTTCGTGGCGACCAc < 2:379783‑M2/50‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |