| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,313,936 | IS2 (+) +5 bp | intergenic (‑273/‑80) | yciC ← / → ompW | putative inner membrane protein/outer membrane protein W |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1313936 = | 0 (0.000) | 22 (0.500) | 20/482 | 0.9 | 100% | intergenic (‑273/‑84) | yciC/ompW | putative inner membrane protein/outer membrane protein W |
| ? | NC_000913 | 1467910 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1313940 | 0 (0.000) | 14 (0.320) | 13/482 | 1.5 | 100% | intergenic (‑277/‑80) | yciC/ompW | putative inner membrane protein/outer membrane protein W |
| ? | NC_000913 | = 1469240 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
GGTGTTAATTAGCGGGCAATTGTACCCTGGTTAAGCCTCGGGTGGCAGCATCAGGTCTTGTATGGAAAAGCATATCTTTGTAAAGCGGAGGTAATTGCTGGCCTTCAGGCATGGGCAAATCGCGGCAAGTGGCGACCGAGTTAATATTTGCGTAGCGAAAATATTTAAAAATTGATTTAAATCACATTAACCAGGATTCTCAATGCAACTTCTAAATTAATCCAGATCAATAAAGGGTGAATTATCATATGTAATGTGATCTATGTAGGATCATTTGTTACTCCAATGTAGGTATATTCGTCACGTTTTTATAACCATAACGACGGAGCGGATATGAAAAAGTTAACAGTGGCGGCTTTGGCAGTAACAACTCTTCTCTCTGGCAGTGCCTTTGCGCATGAAGCAGGCGAATTTTTTATGCGTGCAGGTTCTGCAACCGTACGTCCAACAGAAGGTGCTGGTGGTACGTTAGGAAGTCTGGGTGGATTC > NC_000913/1313687‑1314175 | ggTGTTAATTAGCGGGCAATTGTACCCTGGTTAAGCCTCGGGTGGCAGCATCAGGTCTTGTATGGAAAAGCATATCTTTGTAAAGCGGAGGTAATTGCTGGCCTTCAGGCATGGGCAAATCGCGGCAAGTGGCGACCGAGTTAATATTTGCGTAGCGAAAATATTTAAAAATTGATTTAAATCACATTAACCAGGATTCTCAATGCAACTTCTAAATTAATCCAGATCAATAAAGGGTGAATTATCATATg > 1:97500/1‑251 (MQ=255) gtgtTAATTAGCGGGCAATTGTACCCTGGTTAAGCCTCGGGTGGCAGCATCAGGTCTTGTATGGAAAAGCATATCTTTGTAAAGCGGAGGTAATTGCTGGCCTTCAGGCATGGGCAAATCGCGGCAAGTGGCGACCGAGTTAATATTTGCGTAGCGAAAATATTTAAAAATTGATTTAAATCACATTAACCAGGATTCTCAATGCAACTTCTAAATTAATCCAGATCAATAAAGGGTGAATTATCATATGt > 1:162265/1‑251 (MQ=255) gtgtTAATTAGCGGGCAATTGTACCCTGGTTAAGCCTCGGGTGGCAGCATCAGGTCTTGTATGGAAAAGCATATCTTTGTAAAGCGGAGGTAATTGCTGGCCTTCAGGCATGGGCAAATCGCGGCAAGTGGCGACCGAGTTAATATTTGCGTAGCGAAAATATTTAAAAATTGATTTAAATCACATTAACCAGGATTCTCAATGCAACTTCTAAATTAATCCAGATCAATAAAGGGTGAATTATCATATGt > 1:191058/1‑251 (MQ=255) ggagtccggagagtaacggaatagcagagagcttcgtgaaaacgataaagcgtgactacatcagtatcatgcccaaaccagacgggttaacggcagcaaagaaccttgcagaggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaTGTAAtg < 2:416141‑M1/7‑1 (MQ=255) 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atggaaatataggggcaaatccaTGTAATGTGATCTATGTAGGATCATTTGTTACTCCACTGTAGGTATATTCGTCACGTTTTTATAACCATAACGACGGAGCGGATATGAAAAAGTTAACAGTGGCGGCTTTGGCAGTAACAACTCTTCTCTCTGGCAGTTCCTTTGCGCATGAAGCAGGCGCATTTTTTATGCGTGCAGGTTCTGCAACCGTACGTCCCACAGAAGGCGCTGGTGGTGCGTTGGGAAGt < 2:2969‑M1/228‑1 (MQ=255) gAATTATCATATGTAAtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtaccacacaggaaaagatcgcaattgttcagcagagctttgaaccggggatgacggtctccctcgttgcccggcaacatggtgtagcagccagccagttatttctc > 1:332750‑M1/1‑16 (MQ=255) | GGTGTTAATTAGCGGGCAATTGTACCCTGGTTAAGCCTCGGGTGGCAGCATCAGGTCTTGTATGGAAAAGCATATCTTTGTAAAGCGGAGGTAATTGCTGGCCTTCAGGCATGGGCAAATCGCGGCAAGTGGCGACCGAGTTAATATTTGCGTAGCGAAAATATTTAAAAATTGATTTAAATCACATTAACCAGGATTCTCAATGCAACTTCTAAATTAATCCAGATCAATAAAGGGTGAATTATCATATGTAATGTGATCTATGTAGGATCATTTGTTACTCCAATGTAGGTATATTCGTCACGTTTTTATAACCATAACGACGGAGCGGATATGAAAAAGTTAACAGTGGCGGCTTTGGCAGTAACAACTCTTCTCTCTGGCAGTGCCTTTGCGCATGAAGCAGGCGAATTTTTTATGCGTGCAGGTTCTGCAACCGTACGTCCAACAGAAGGTGCTGGTGGTACGTTAGGAAGTCTGGGTGGATTC > NC_000913/1313687‑1314175 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |