| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,903,727 | G→A | intergenic (+353/+1020) | ygcE → / ← queE | putative sugar kinase YgcE/putative 7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase QueE |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,903,727 | 0 | G | A | 100.0% | 32.9 / NA | 12 | intergenic (+353/+1020) | ygcE/queE | putative sugar kinase YgcE/putative 7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase QueE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (3/9); total (3/9) | |||||||||||
CCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGA‑TTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTGGCATGGAGAACTATTTTGAACATGAGGTGTTACGTGGATATGTTGCTTATTACAAGTACTG > NC_000913/2903489‑2903972 | ccccGCTGGTGCAGGGAACAGAATAAAAACTTTAACTAGTTCGGGTGATACATGTATGTACAAGGAATATTAGCTTCACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCGTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGTCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGATAAACTTCCAAA‑TTTAATACTTa < 2:8839/251‑1 (MQ=255) aGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTTGAAAAACAATCATTATACTCCAAACAAAAACAAAATTCAAAAATTTATTATTTAACCaaaaaaa > 2:382416/1‑245 (MQ=255) gAACATAATAAAAACTTTAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAAA‑TTTATTACTTAACCAATGAATAACaa < 1:348369/251‑1 (MQ=255) tATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTGTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAATTGGATATCTTTAGTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAAA‑TTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCAAAAGaa < 2:103353/250‑1 (MQ=255) aTCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAAA‑TTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACa < 1:382416/250‑1 (MQ=255) cAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAAA‑TTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAAGAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAAt < 1:180164/251‑1 (MQ=255) aCTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAAA‑TTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACttt < 1:197271/251‑1 (MQ=255) aCAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTACCAAA‑TTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTGGCAt < 2:319558/251‑1 (MQ=255) aGACAAACTTCCAAA‑TTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGATATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTATGAACCTCTCTGGCATGGAGAACTATTTTGAACATGAGATGTTACGTGGATATGTTGCttattcc > 2:84945/1‑249 (MQ=255) gACAAAATTCCAAA‑TTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTACCAGGCATTAATACAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAATTATCATACACATAACACGCTGATTAAAGTAAATTGTTTGTATCGATAATTGTGAACCGCTCTTGCATGGAAAACGATTTTGAACAAGAGGTGTTACGTGGAGATGTTGCTTATTACa < 2:11152/251‑1 (MQ=255) cAAACTTCCAAA‑TTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTGGCATGGAGAACTATTTTGAACATGAGGTGTTACGTGGATATGTTGCTTATTACa > 1:138219/1‑249 (MQ=255) tCCAAA‑TTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTGGCATGGAGAACTATTTTGAACATGAGGTGTTACGTGGATATGTTGCTTATTACAAGTACTg < 1:229218/250‑1 (MQ=255) | CCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGA‑TTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTGGCATGGAGAACTATTTTGAACATGAGGTGTTACGTGGATATGTTGCTTATTACAAGTACTG > NC_000913/2903489‑2903972 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |