| New junction evidence | |||||||||||
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tgatCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTTGATGATTGCATAGATAACCACGCCAACTACGCCCAGCAGGAACAGCCAGACGGACGTTTTTGCACCGGATTTGATTTCAATCTGCTTTTCACCGCGCAGTTCAACCAGGCCCTCTTCCAGACGCTTGCGATAAATCGGATCGTCAGAGAGTTTGGAGTTGAACAGCATAGTGACCAGGAAGGACacc > 2:113129/1‑249 (MQ=255) cAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTTGATGATTGCATAGATAACCACGCCAACTACGCCCAGCAGGAACAGCCAGACGGACGTTTTTGCACCGGATTTGATTTCAATCTGCTTTTCACCGCGCAGTTCAACCAGGCCCTCTTCCAGACGCTTGCGATAAATCGGATCGTCAGAGAGTTTGGAGTTGAACAGCATAGTGACCAGGAAGGACATCAcc > 1:233920/1‑250 (MQ=255) tGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGGTTGGGCTGTTGATGATTGCATAGTTAAACACGCCAACTACGCCCAGCAGGAAAAGCCAGACGGAAGTTTTTGCACCGGATTTGATTTCAATATGCTTTTCACCGCGCAGGTAAACCAGGCACTCTTCCAGACGCTTGCGATAAATCGGATCGTAAGAGAGTTTGGAGTGGACAAGCAAAGTGACCAGGAAGGACATCACCAGAACCg > 2:343161/1‑251 (MQ=255) gggataagtgctaacagatgtctggaaatataggggcaaatccaGGCTGTTGATGATTGCATAGATAACCACGCCAAATACGCCCAGCAGGAACAGCCAGACGGACGTTTTTTCACCGGATTTGATTTCAATCTGCTTTTCACCGCGCAGTTCAACCAGGCACTCTTCCAGACGCTTGCGGTAAATCGGAGCTTCATAGAGTTTGGAGTTGAAAATCATAGTGACCAGGAAGGACATCGTCAGAACCGcc < 2:230917‑M1/206‑1 (MQ=255) ggtgTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtaccacacaggaaaagatcgcaattgttcagcagagctttgaaccggggatgacggtctccctcgttgcccggcaacat < 1:304244‑M2/251‑209 (MQ=255) catcaGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGtcgactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtaccacacaggaaaagatcgcaattgttcagcagagctttgaaccggggatgacggtctccctcgttgcccggcaacatggtgt < 1:130563‑M2/250‑214 (MQ=255) 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ccAGACACATGCTTGGGCTGTTGATGATTGCATCGATAACCACGCCAAATACGCCCAGCAGGAACAGCCAGACGGACGTTTTTGCACCGGATTTGATTTCAATCTGCTTTTCACCGCGCAGTTCAACCAGGCCCTCTTCCAGACGCTTGCGATAAATCGGATCGCCAGAGAGTTTGGAGTTGAACAGCATAGTGACAAGCAAGGACATCACCAGAACCGCCAGCAGGGTGGACGGGAAGACCACGGAGAGc > 2:380945/1‑251 (MQ=255) ataggggcaaatccaGGCTGTTGATGATTGCATAGATAACCACGCCAACTACGCCCAGCAGGAACAGCCAGACGGACGTTTTTGCACCGGATTTGATTTCAATCTGCTTTTCACCGCGCAGTTCAACCAGGCCCTCTTCCAGACGCTTGCGATAAATCGGATCGTCAGAGAGTTTGGAGTTGAACAGCATAGTGACCAGGAAGGACATCACCAGAACCGCCAGCAGGGTGGACGGGATGACCACGGAGAGc < 1:386438‑M1/236‑1 (MQ=255) cAGACCCATGCTTGGGCTGtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtaccacacaggaaaagatcgcaattgttcagcagagctttgaaccggggatgacggtctccctcgttgcccggcaacatggtgtagcagccagccagttattt < 1:210812‑M2/251‑233 (MQ=255) 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CCTGAATCACTTCACCAGCGGTATCTTTGATCCAGTCGATGTTGTTGGAAACGAAAGTATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTTGATGATTGCATAGATAACCACGCCAACTACGCCCAGCAGGAACAGCCAGACGGACGTTTTTGCACCGGATTTGATTTCAATCTGCTTTTCACCGCGCAGTTCAACCAGGCCCTCTTCCAGACGCTTGCGATAAATCGGATCGTCAGAGAGTTTGGAGTTGAACAGCATAGTGACCAGGAAGGACATCACCAGAACCGCCAGCAGGGTGGACGGGATGACCACGGAGAGCAGATGGAGGTAGCT > NC_000913/4365792‑4366287 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |