| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 3,888,720 | Δ6 bp | intergenic (+211/‑5) | tnaC → / → tnaA | tnaAB operon leader peptide/tryptophanase |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 3888720 | 3888725 | 6 | 41 [0] | [0] 41 | tnaC/tnaA | tnaAB operon leader peptide/tryptophanase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3888719 | 0 (0.000) | 41 (1.010) | 40/494 | 0.2 | 100% | intergenic (+210/‑11) | tnaC/tnaA | tnaAB operon leader peptide/tryptophanase |
| ? | NC_000913 | 3888726 = | 0 (0.000) | intergenic (+217/‑4) | tnaC/tnaA | tnaAB operon leader peptide/tryptophanase | |||||
GATCACCGCCCTTGATTTGCCCTTCTGTAGCCATCACCAGAGCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCATTCGTGTTATTGAGCCAGTAAAACGTACCACTCGCGCTTATCGTGAAGAGGCAATTATTAAATCCGGTATGAACCCGTTCCTGCTGGATAGCGAAGATGTTTTTATCGATTTACTGACCGACAGCGGCACCGGGGCGGTGACGCAGAGCATGCAGGCTGCGATGATGCGCGGCGACGAAGCCTACAGCG > NC_000913/3888495‑3888955 | gATCACCGCCCTTGATTTGCCCTTCTGTAGCCATCACCAGAGCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAtgtaatggaaaactttaaacatctcc < 1:442328‑M1/251‑27 (MQ=255) tGATTTGCCCTTCTGTAGCCATCACCAGAGCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAtgtaatggaaaactttaaacatctccctgaaccgtt < 1:437160‑M1/249‑37 (MQ=255) gATTTGCCCTTCTGTAGCCATCACCAGAGCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAtgtaatggaaaactttaaacatctccctgaaccgttccg > 1:26752‑M1/1‑212 (MQ=255) aCCAGAGCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAtgtaatggaaaactttaaacatctccctgaaccgttccgcattcgtgttattgagccagta < 2:149873‑M1/251‑62 (MQ=255) cAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAtgtaatggaaaactttaaacatctccctgaaccgttccgcattcgtgttattgagccagtaaaacgtac < 2:307564‑M1/251‑70 (MQ=255) ccGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATCTCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGCAtgtaatggaaaactttaaacatctccctgaaccgttctgcattcgtgttattgagccagtaaaacgtaccact > 1:23704‑M1/1‑178 (MQ=255) cGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAtgtaatggaaaactttaaacatctccctgaaccgttccgcattcgtgttattgagccagtaaaacgtaccactc > 2:86042‑M1/1‑177 (MQ=255) cGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAtgtaatggaaaactttaaacatctccctgaaccgttccgcattcgtgttattgagccagtaaaacgtaccactc < 2:82170‑M1/251‑75 (MQ=255) aTTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAACGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAtgtaatggaaaactttaaacatctccctgaaccgttccgcattcgtgttattgagccagtaaaacgtaccactcgc > 2:192934‑M1/1‑175 (MQ=255) ttCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAtgtaatggaaaactttaaacatctccctgaaccgttccgcattcgtgttattgagccagtaaaacgtaccactcgcgcttat > 2:53422‑M1/1‑169 (MQ=255) gtgATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAtgtaatggaaaactttaaacatctccctgaaccgttccgcattcgtgttattgagccagtaaaacgtaccactcgcgcttatcgtgaa < 1:192934‑M1/251‑89 (MQ=255) tgtttcCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCACCGGACCTCTCTAGTTTATTTACTTGATTTAGTAAATGATGGCGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTCTAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCAATGTAATTAAAATAAATGAAtgaaatggaaaactttaaacatctccatgaaacgaaccgcattcgtgttattgagccagtaaaacgtaccactcgcgcttatcgtgaagaggcaatt > 2:32573‑M1/1‑153 (MQ=255) tttgCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGTTGGTGCTTGCATATATATATGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAtgtaatggaaaactttaaacatctccctgaaccgttccgcattcgtgttattgagccagtaaaacgtaccactcgcgcttatcgtgaagaggcaattatt > 1:271378‑M1/1‑151 (MQ=255) atatCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAtgtaatggaaaactttaaacatctccctgaaccgttccgcattcgtgttattgagccagtaaaacgtaccactcgcgcttatcgtgaagaggcaattattaaatcc > 1:13542‑M1/1‑145 (MQ=255) atatCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAtgtaatggaaaactttaaacatctccctgaaccgttccgcattcgtgttattgagccagtaaaacgtaccactcgcgcttatcgtgaagaggcaattattaaatc < 1:17633‑M1/250‑106 (MQ=255) aTTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAtgtaatggaaaactttaaacatctccctgaaccgttccgcattcgtgttattgagccagtaaaacgtaccactcgcgcttatcgtgaagaggcaattattaaatccggtatgaa < 1:287329‑M1/251‑115 (MQ=255) ccTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTAATTGTTTTAGTAAATGATGCTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCAAAGGGATCACTGTAATTAAAATACATGAAtgtaatggaaaactttaaacatctccctgaaccgttccgcattcgtgttattgagccagtaaaacgtaccactcgcgcttatcgtgaagaggcaattattaaatcaggtatgaacccgtt > 1:193960‑M1/1‑131 (MQ=255) cTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAtgtaatggaaaactttaaacatctccctgaaccgttccgcattcgtgttattgagccagtaaaacgtacaactcgcgcttatcgtgaagaggcaattattaaatccggtatgaacccgttc > 1:68879‑M1/1‑130 (MQ=255) cAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAtgtaatggaaaactttaaacatctccctgaaccgttccgcattcgtgttattgagccagtaaaacgtaccactcgcgcttatcgtgaagaggcaattattaaatccggtatgaacccgttcctgctg > 1:184049‑M1/1‑124 (MQ=255) gTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAtgtaatggaaacctttaaacatctccctgaaccgttccgcattcgtgttattgagccagtaaaacgtaccactcgcgcttatcgtgaagaggcaattattaaatccggtatgaacccgttcctgctggatag < 1:56440‑M1/251‑133 (MQ=255) cATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAtgtaatggaaaactttaaacatctccctgaaccgttccgcattcgtgttattgagccagtaaaacgtaccactcgcgcttatcgtgaagaggcaattattaaatccggtatgaacccgttcctgctggatagc < 1:53422‑M1/250‑134 (MQ=255) ctctcGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAtgtaatggaaaactttaaacatctccctgaaccgttccgcattcgtgttattgagccagtaaaacgtaccactcgcgcttatcgtgaagaggcaattattaaatccggtatgaacccgttcctgctggatagcga > 1:163431‑M1/1‑114 (MQ=255) tttaCTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAtgtaatggaaaactttaaacatctccctgaaccgttccgcattcgtgttattgagccagtaaaacgtaccactcgcgcttatcgtgaagaggcaattattaaatccggtatgaacccgttcctgctggatagcgaagatgtttttat > 1:318773‑M1/1‑104 (MQ=255) taCTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAtgtaatggaaaactttaaacatctccctgaaccgttccgcattcgtgttattgagccagtaaaacgtaccactcgcgcttatcgtgaagaggcaattattaaatccggtatgaacccgttcctgctggatagcgaagatgtttttatc < 1:86042‑M1/250‑149 (MQ=255) tGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAtgtaatggaaaactttaaacatctccctgaaccgttccgcattcgtgttattgagccagtaaaacgtaccactcgcgcttatcgtgaagaggcaattattaaatccggtatgaacccgttcctgctggatagcgaagatgtttttatcgat < 1:136342‑M1/249‑152 (MQ=255) tGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAtgtaatggaaaactttaaacatctccatgaaccgttccgcattcgtgttattgagccagtaaaacgtaccactcgcgcttatcgtgaagaggcaattattaaatccggtatgaacccgttcctgctggatagcgaagatgtttttatcgattt > 1:27979‑M1/1‑98 (MQ=255) tttAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCAAAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAtgtaatggaaaactttaaacatctccctgaaccgttccgcattcgtgttattgagccagtaaaacgtaccactcgcgcttatcgtgaagaggcaattattaaatccggtatgaacccgttcatgctggatagcgaagatgtttttatcgatttact > 2:83460‑M1/1‑95 (MQ=255) tttAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAAGCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAtgtaatggaaaactttaaacatctccctgaaccgttccgcattcgtgttattgagccagtaaaacgtaccactcgcgcttatcgtgaagaggcaattattaaatccggtatgaacccgttcctgctggatagcgaagatgtttttatcgatttac < 2:13542‑M1/250‑156 (MQ=255) aGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAtgtaatggaaaactttaaacatctccctgaaccgttccgcattcgtgttattgagccagtaaaacgtaccactcgcgcttatcgtgaagaggcaattattaaatccggtatgaacccgttcctgctggatagcgaagatgtttttatcgatttactgac < 1:209792‑M1/251‑160 (MQ=255) atatatatCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAtgtaatggaaaactttaaacatctccctgaaccgttccgcattcgtgttattgagccagtaaaacgtaccactcgcgcttatcgtgaagaggcaattattaaatccggtatgaacccgttcctgctggatagcgaagatgtttttatcgatttactgaccgacagcggcaccggggcg < 2:55555‑M1/251‑179 (MQ=255) atatatCTGGCGAATTAATCGGTCTAGCAGATGTAATATTAACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAtgtaatggaaaactttaaacatctccctgaaccgttccgcattcgtgttattgagccagtaaaacgtaccactcgcgcttatcgtgaagaggcaattattaaatccggtatgaacccgttcctgctggatagcgaagatgtttttatcgatttactgaccgacagcggcaccggggcggg > 1:167396‑M1/1‑71 (MQ=255) cTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAtgtaatggaaaactttaaacatctccctgaaccgttccgcattcgtgttattgagccagtaaaacgtaccactcgcgcttatcgtgaagaggcaattattaaatccggtatgaacccgttcctgctggatagcgaagatgtttttatcgatttactgaccgacagcggcaccggggcggtgacgc > 1:85266‑M1/1‑65 (MQ=255) tGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAtgtaatggaaaactttaaacatctccctgaaccgttccgcattcgtgttattgagccagtaaaacgtaccactcgcgcttatcgtgaagaggcaattattaaatccggtatgaacccgttcctgctggatagcgaagatgtttttatcgatttactgaccgacagcggcaccggggcggtgacgc > 1:241775‑M1/1‑64 (MQ=255) aaTTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAtgtaatggaaaactttaaacatctccctgaaccgttccgcattcgtgttattgagccagtaaaacgtaccactcgcgcttatcgtgaagaggcaattattaaatccggtatgaacccgttcctgctggatagcgaagatgtttttatcgatttactgaccgacagcggcaccggggcggtgacgcagagcat > 1:395018‑M1/1‑59 (MQ=255) aTCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAtgtaatggaaaactttaaacatctccctgaaccgttccgcattcgtgttattgagccagtaaaacgtaccactcgcgcttatcgtgaagaggcaattattaaatccggtatgaacccgttcctgctggatagcgaagatgtttttatcgatttactgaccgacagcggcaccggggcggtgacgcagagcatgcagg > 1:437557‑M1/1‑54 (MQ=255) aTGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAtgtaatggaaaactgtaaacatctccctgaaccgttccgcattcgtgttattgagccagtaaaacgtaccactcgcgcttatcgtgaagaggcaattattaaatccggtatgaacccgttcctgctggatagcgaagatgtttttatcgatttactgaccgacagcggcaccggggcggtgacgcagagcatgcaggctgcgatgatgcg < 2:30670‑M1/251‑211 (MQ=255) aaTATTCACAGGGATCACTGTAATTACAATAAATGAAtgtaatggaaaactttaaacatctccctgaaccgttccgcattcgtgttattgagccagtaaaacgtaccactcgcgcttatcgtgaagaggcaattattaaatccggtatgaacccgttcctgctggatagcgaagatgtttttatcgatttactgaccgacagcggcaccggggcggggacgcagagcatgcaggctgcgatgatgcgcggc > 2:4914‑M1/1‑37 (MQ=255) aTCACTGTAATTAAAATAAATGAAtgtaatggaaaactttaaacatctccctgaaccgttccgcattcgtgttattgagccagtaaaacgtaccactcgcgcttatcgtgaagaggcaattattaaatccggtatgaacccgttcctgctggatagcgaagatgtttttatcgatttactgaccgacagcggcaccggggcggtgacgcagagcatgcaggctgcgatgatgcgcggcgacgaagcctac > 1:77793‑M1/1‑24 (MQ=255) aTCACTGAAATTAAAATAAATGAAtgtaatggaaaactttaaacatctacctgaaccgttccgcattcgtgttattgagccagtaaaacgtaccactcgcgcttatcgtgaagaggcaattattaaatccggtatgaacccgttcctgctggatagcgaagatgtttttatcgatttactgaccgacagcggcaccggggcggtgacgcagagcatgcaggctgcgctgatgcgcggcgacgaagcctac > 1:280852‑M1/1‑24 (MQ=255) tCACTGTAATTAAAATAAATGAAtgtaatggaaaactttaaacatctccctgaaccgttccgcattcgtgttattgagccagtaaaacgtaccactcgcgcttatcgtgaagaggcaattattaaatccggtatgaacccgttcctgctggatagcgaagatgtttttatcgatttactgaccgacagcggcaccggggcggggacgcagagcatgcaggcggcgatgatgcgcggcgacgaagcctac > 2:306896‑M1/1‑23 (MQ=255) aTTAAAATAAATGAAtgtaatggaaaactttaaacatctccctgaaccgttccgcattcgtgttattgagccagtaaaacgtaccactcgcgcttatcgtgaagaggcaattattaaatccggtatgaacccgttcctgctggatagcgaagatgtttttatcgatttactgaccgacagcggcaccggggcggtgacgcagagcatgcaggctgcgatgatgcgcggcgacgaagcctacagcggcagtc < 2:184049‑M1/251‑237 (MQ=255) | GATCACCGCCCTTGATTTGCCCTTCTGTAGCCATCACCAGAGCCAAACCGATTAGATTCAATGTGATCTATTTGTTTGCTATATCTTAATTTTGCCTTTTGCAAAGGTCATCTCTCGTTTATTTACTTGTTTTAGTAAATGATGGTGCTTGCATATATATCTGGCGAATTAATCGGTATAGCAGATGTAATATTCACAGGGATCACTGTAATTAAAATAAATGAAGGATTATGTAATGGAAAACTTTAAACATCTCCCTGAACCGTTCCGCATTCGTGTTATTGAGCCAGTAAAACGTACCACTCGCGCTTATCGTGAAGAGGCAATTATTAAATCCGGTATGAACCCGTTCCTGCTGGATAGCGAAGATGTTTTTATCGATTTACTGACCGACAGCGGCACCGGGGCGGTGACGCAGAGCATGCAGGCTGCGATGATGCGCGGCGACGAAGCCTACAGCG > NC_000913/3888495‑3888955 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |