Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,287,464 | T→A | intergenic (‑93/‑147) | acs ← / → ytcB | acetyl‑CoA synthetase (AMP‑forming)/protein YtcB |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,287,464 | 0 | T | A | 100.0% | 132.2 / NA | 38 | intergenic (‑93/‑147) | acs/ytcB | acetyl‑CoA synthetase (AMP‑forming)/protein YtcB |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (16/22); total (16/22) |
AGGTTTGATCCAGTCAAGAATTTTTCCCTGTTCGCCCCAGAAGGTATCAGGTACGTTAATAGATTGTTGATACATCGCCTCGTACTGCTGAGGGTTTATCAGGCAACGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAATTTTTGAAGGTCAGCAACAAAAGTTGATTAATTCTTTGAGGAACATGCAGTTATGCATGCTGTTGAAAAAGAGGAAGATACTGACTAACTCTAAAGTGGTATTTTACATGCACTTACAATTGATTAAAGACAACATTCACAGTGTGGTTATTTGTTACACATAGGGGCGAGCAATGTCATGACAGTGTAGGTGCGGTTACTGTC > NC_000913/4287219‑4287707 | aGGTTTGATCCAGTCAAGAATTTTTCCCTGTTCGCCCCAGAAGGTATCAGGTACGTTAATAGATTGTTGATACATCGCCTCGTACTGCTGATTGTTTATCAGGCAACGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCGCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGAACACGc < 1:42751/251‑1 (MQ=255) 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2:362096/1‑251 (MQ=255) cGTTAAATGTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGAACACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAATTTTTGAAGGTCAGCAACAAAAGTTGATTAATTCTTTGAGGAACATGCAGTTATGCATGCTGTTGAAAAAGAGGAAGATACTGACTAACTCTAAAGTGGTATTTTACATGCACTTACAATTGATTAAAGACAACATTCACAGTGTGGTGATTTGTTACACAt < 2:216944/251‑1 (MQ=255) tGTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGAACACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAATTTTTGAAGGTCAGCAACAAAAGTTGATTAATTCTTTGAGGAACATGCAGTTATGCATGCTGTTGAAAAAGAGGAAGATACTGACTAACTCTAAAGTGGTATTTTACATGCACTTACAATTGATTAAAGACAACATTCACAGTGTGGTTATTTGTTACACATAGGGGCg > 1:96578/1‑251 (MQ=255) tGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGAACACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAATTTTTGAAg > 2:421682/1‑80 (MQ=255) tGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGAACACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAATTTTTGAAg < 1:421682/80‑1 (MQ=255) tATTTGGGCGACAGAACACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAATTTTTGAAGGTCAGCAACAAAAGTTGATTAATTCTTTGAGGAACATGCAGTTATGCATGCTGTTGAAAAAGAGGAAGATACTGACTAACTCTAAAGTGGTATTTTACATGCACTTACAATTGATTAAAGACAACATTCACAGTGTGGTTATTTGTTACACATAGGGGCGAGCAATGTCATGACAGTGTAGGTGCgg > 2:178475/1‑251 (MQ=255) tATTTGGGCGACAGAACACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAATTTTTGAAGGTCAGCAACAAAAGTTGATTAATTCTTTGAGGAACATGCAGTTATGCATGCTGTTGAAAAAGAGGAAGATACTGACTAACTCTAAAGTGGTATTTTACATGCACTTACAATTGATTAAAGACAACATTCACAGTGTGGTTATTTGTTACACATAGGGGCGAGCAATGTCATGACAGTGTAGGTGCgg > 2:76056/1‑251 (MQ=255) ttGGGCGACAGAACACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAATTTTTGAAGGTCAGCAACAAAAGTTGATTAATTCTTTGAGGAACATGCAGTTATGCATGCTGTTGAAAAAGAGGAAGATACTGACTAACTCTAAAGTGGTATTTTACATGCACTTACAATTGATTAAAGACAACATTCACAGTGTGGTTATTTGTTACACATAGGGGCGAGCAATGTCATGACAGTGTAGGTGCGGtt < 1:4928/250‑1 (MQ=255) cGACAGAACACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAATTTTTGAAGGTCAGCAACAAAAGTTGATTAATTCTTTGAGGAACATGCAGTTATGCATGCTGTTGAAAAAGAGGAAGATACTGACTAACTCTAAAGTGGTATTTTACATGCACTTACAATTGATTAAAGACAACATTCACAGTGTGGTTATTTGTTACACATAGGGGCGAGCAATGTCATGACAGTGTAGGTGCGGTTACTGTc < 1:355783/251‑1 (MQ=255) | AGGTTTGATCCAGTCAAGAATTTTTCCCTGTTCGCCCCAGAAGGTATCAGGTACGTTAATAGATTGTTGATACATCGCCTCGTACTGCTGAGGGTTTATCAGGCAACGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAAGCGTTAAATGTAGGGGTATTGGCAGTTTTGTTTAGTATTTGGGCGACAGATCACGCAAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAATTTTTGAAGGTCAGCAACAAAAGTTGATTAATTCTTTGAGGAACATGCAGTTATGCATGCTGTTGAAAAAGAGGAAGATACTGACTAACTCTAAAGTGGTATTTTACATGCACTTACAATTGATTAAAGACAACATTCACAGTGTGGTTATTTGTTACACATAGGGGCGAGCAATGTCATGACAGTGTAGGTGCGGTTACTGTC > NC_000913/4287219‑4287707 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |