New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | 257908 = | NA (NA) | 39 (0.940) | 34/484 | 0.3 | 47.6% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
? | NC_000913 | = 323450 | 43 (1.040) | coding (1113/1428 nt) | ykgF | putative amino acid dehydrogenase with NAD(P)‑binding domain and ferridoxin‑like domain |
GTTTCATCTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGCTCTTTATGCACAGCTTGTGACAACGTGTGTCCGGTGCGTATTCCGCTGTCAAAACTGATTTTGCGTCATCGTCGGGTGATGGCTGAAAAAGGGATCACCGCAAAAGCAGAGCAACGGGCGATAAAAATGTTCGCTTATGCCAATAGTCATCCAGGATTGTGGAAAGTCGGGATGATGGCCGGTGCTCATGCGGCAAGCTGGTTTATCAATGGCGGCAAAACACCACTCAAATTTGGCGCGATTAGCGACTGGATGGAAGCACGCGATCTTC > NC_000913/323201‑323694 | gTTTCATCTGGTTATTGTCGATAACGGGCGTTCTGAGGTGCTGGCCTCTGAATTTCGGGATGTGCTGCGCTGTATTCGCTGCGGGGCTTGTATGAATACTTGTCCGGCATATCGCCATATTGGCGGTCATGGATATGGCTCTATTTATCCAGGGCCAATTGGTGCGGTGATTTCTCCGCTACTTGGCGGCTATAAAGATTTTAAAGATTTACCCTACGCCTGCTCTTTATGCACAGCTTGTGACAACgtgt < 2:199029/251‑1 (MQ=255) 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agattttaaagatttACCCTACGCCTGCTCTTTCTGCACAGCTTGTGACAACGTGggtcatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctacaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgg < 1:183132‑M2/251‑197 (MQ=255) agattttaaagatttACCCTACGCCTGCTCTTTATGCACAGCTTGTGACAACGTGTGTCCGGTGCGTATTCCGCTGTCAAAACTGATTTTGCGTCATCGTCGGGTGATGGCTGAAAAAGGGATCACCGCAAAAGCAGAGCAACGGGCGATAAAAATGTTCGCTTATGCCAATAGTCATCCAGGATTGTGGAACGTCGGGATGATGGCCGGTGCTCATGCGGCCAGCTGGTTTTTCAATGGCGGAaaaaacc > 2:108663/1‑248 (MQ=255) ttttaaagatttACCCTACGCCTGCTCTTTATGCACAGCTTGTGACAACGTGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggat < 2:415152‑M2/251‑200 (MQ=255) 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aCGCCTGCTCTTTATGCACAGCTTGTGACAACGTGTGTCCGGTGCGTATTCCGCTGTCAAAACTGATTTTGCGTCATCGTCGGGTGATGGCTGAAAAAGGGATCACCGCAAAAGCAGAGCAACGGGCGATAAAAATGTTCGCTTATGCCAATAGTCATCCAGGATTGTGGAAAGTCGGGATGATGGCCGGTGCTCATGCGGCAAGCTGGTTTATCAATGGCGGCAAAACACCACTCAAATTTGGCGCGAtt < 1:24727/251‑1 (MQ=255) cGCCTGCTCTTTATGCACAGCTTGTGACAACGTGTGTCCGGTGCGTATTCCGCTGTCAAAACTGATTTTGCGTCATCGTCGGGTGATGGCTGAAAAAGGGATCACCGCAAAAGCAGAGCAACGGGCGATAAAAATGTTCGCTTATGCCAATAGTCATCCAGGATTGTGGAAAGTCGGGATGATGGCCGGTGCTCATGCGGCAAGCTGGTTTATCAATGGCGGCAAAAAACCACTCAAATTTGGCGCGAtt > 2:329442/1‑250 (MQ=255) cGCCTGCACTTTATGCACAGCTTGTGAAAACGTGggtcatgtctgcaacttattgatagtgttttatcttcagataatgccagatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttcagtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattaaggttatgccgcccaattcgctgcgtatatcacttcctgcttacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacaacggccagcc < 1:380614‑M2/250‑217 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |