| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,931,171 | IS4 (–) +12 bp | intergenic (‑78/‑134) | ravA ← / → kup | regulatory ATPase RavA/K(+):H(+) symporter Kup |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 3931171 = | 0 (0.000) | 38 (0.930) | 36/490 | 0.2 | 100% | intergenic (‑78/‑145) | ravA/kup | regulatory ATPase RavA/K(+):H(+) symporter Kup |
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| * | ? | NC_000913 | = 3931182 | 0 (0.000) | 26 (0.640) | 25/488 | 0.5 | 100% | intergenic (‑89/‑134) | ravA/kup | regulatory ATPase RavA/K(+):H(+) symporter Kup |
| ? | NC_000913 | 4502090 = | NA (NA) | noncoding (1426/1426 nt) | IS4 | repeat region | |||||
TGCGTTAATGTTGAGTTCCTCGAACCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATCGCGCATCAGCTCCGGTATACGTCCCGGTGAAGCGCCCTGCAATGTCATCAGCATTCTCATCACCATTCCGCATGATTCTGAGAAACTCAGTTGATTCGGCCAGTAACCTTT > NC_000913/4501852‑4502339 | tGCGTTAATGTTGAGTTCCTCGAACCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCcagtc > 1:112029/1‑249 (MQ=255)tGCGTTAATGTTGAGTTCCTCGAACCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCcagtc > 2:1376/1‑249 (MQ=255) gCGTTAATGTTGAGTTCCTCGAACCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCcagtcagt < 2:130673/251‑1 (MQ=255) gTTAATGTTGAGGTCCTCGAATCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACGGGCTGATGCAATCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCAGGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGGTGGCAACCAGATAATATAACAGGTGATTCTGAAACGAAATAGGCAGCTTGGTGCCGCAATTCCAATCAGTTa < 2:208810/251‑1 (MQ=255) 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aGTTCCTCGAACCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAactgac > 1:398979/1‑251 (MQ=255) gatCCTCGAACACTTAACAATTAAGGGACATAGCAAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGACTGCGGGCATGAAAATGGAAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTAAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACAAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATATTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAactgacg > 2:357148/3‑250 (MQ=255) ccTCGAACCCTTACCAATTAAGGGACATATCCAGATACGCACCTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGTCCTGCGGGCATTACAAGGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCGCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATTCTGAAACGAAATAGGCAGCTGGGGTCTGTAAGTCCAGTCAGTTAAGCAactgacttg < 2:27093/250‑3 (MQ=255) 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aTAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATCGCGCATCAGCTCCGGTATACGTCCCGGTGAAGCGCCCTGCAATGTCATCAGCATTCTCATCACCAt > 1:146068/1‑251 (MQ=255) aTTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTATGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTGCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTGTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGGCCCAGACTTGCAAGATCGCGCATCTGCTCCGGTATACGTCCCGGTGAAGCGCCCTGCAATGTCATCAGCATTCTCATCCCCATTcc < 2:398979/251‑1 (MQ=255) aGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATCGCGCATCAGCTCCGGTATACGTCCCGGTGAAGCGCCCTGCAATGTCATCAGCATTCTCATCGCCATTCCGCATGAt < 1:189491/251‑1 (MQ=255) gTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATCGCGCATCAGCTCCGGTATACGTCCCGGTGAAGCGCCCTGCAATGTCATCAGCATTCTCATCACCATTCCGCATGAtt > 1:406932/1‑251 (MQ=255) gTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGCGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTGCTTGTTGGTAATTTCACAATTTGTCCCATACTTGCAAGATCGCGCATCAGCGCCGGTATACGTCCCGGTGAAGCGCCCTGCAATGTCATCAGCATTCTCATCACCATTCTGCATGAtt < 1:40693/251‑1 (MQ=255) tGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATCGCGCATCAGCTCCGGTATACGTCCCGGTGAAGCGCCCTGCAATGTCATCAGCATTCTCATCACCATTCCGCATGATTCt > 1:30233/1‑251 (MQ=255) tgctggtggctaaaatagtctcaaaggggggTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATCGCGCATCAGCTCCGGTATACGTCCCGGTGAAGCGCCCTGCAATGTCATCAGCATTCTCATCACCATTCCGCATGATTc < 1:210415‑M2/217‑1 (MQ=255) gCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCTCTCTCGGGAAGGCTCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATCGCGCATCAGCTCCGGTATACGTCCCGGTGAAGCGCCCTGCAATGTCATCATCATTCTCATCACCATTCCGCATGATTCTgaga < 1:220469/251‑1 (MQ=255) ctggtggctaaaatagtctcaaaggggggTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTAGCTCTTTTTCGGAGCTGTGGGGTCTTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTAGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATCGCGCATCAGCTCCGGTATACGTCCCGGTGAAGCGCCCTGCAATGTCATCAGCATTCTCATCACCATTCCGCATGATTCTg > 1:221275‑M2/30‑248 (MQ=255) aaaatagtctcaaaggggggTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATCGCGCATCAGCTCCGGTATACGTCCCGGTGAAGCGCCCTGCAATGTCATCAGCATTCTCATCACCATTCCGCATGATTCTGAGAAACTCAGtt < 1:148702‑M2/231‑1 (MQ=255) aaatagtctcaaaggggggTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATCGCGCATCAGCTCCGGTATACGTCCCGGTGAAGCGCCCTGCAATGTCATCAGCATTCTCATCACCATTCCGCATGATTCTGAGAAACTCAGTTg > 1:332402‑M2/20‑251 (MQ=255) tAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATCGCGCATCAGCTCCGGTATACGTCCCGGTGAAGCGCCCTGCAATGTCATCAGCATTCTCATCACCATTCCGCATGATTCTGAGAAACTCAGTTGAt > 1:361385/1‑251 (MQ=255) gtctcaaaggggggTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATCTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGACGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATCGCGCATCAGCTCCGGCATACGTCCCGGTGACGCGCACCGCAATGTCATCAGCATTCTCATCACCATCCCGCGTGATTCTGCGAAACTCAGTTGATTCg > 2:170606‑M2/15‑251 (MQ=255) ataggatCTGTAATGTCAGGTAGATAGGCAACTGACCGGCTCTTTCTCCCAGCTGGGGCGCATTTCCAGGGAATCTACTCTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTTGATAATTTCACAAGTTGTCCCATACTAGAAAGATCGCGAACCAGCTCCGGTTTCGGTCCCGGTGAACCGCCATGCAATGCCATCAGCATTCTCATCACGAGACCGCATGATTCTTAGCAACTAAGtttatcggtcc > 2:264452/7‑241 (MQ=255) gTAATGCCTGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTTGTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTGCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGGCCCATACTTGCAAGATCGCGCATCAGCTCCGGTATACGTCCCGGTGAAGCGCCCTGCAATGTCATCAGCATTCTCATCCCCATTCCGCATGAGTCTGAGAAACGCAGTTGATTCGGCCAGTAACCttt < 1:147135/251‑1 (MQ=255) | TGCGTTAATGTTGAGTTCCTCGAACCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATCGCGCATCAGCTCCGGTATACGTCCCGGTGAAGCGCCCTGCAATGTCATCAGCATTCTCATCACCATTCCGCATGATTCTGAGAAACTCAGTTGATTCGGCCAGTAACCTTT > NC_000913/4501852‑4502339 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |