| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 4,354,764 | IS2 (–) +5 bp | intergenic (‑47/+186) | lysU ← / ← dtpC | lysine‑‑tRNA ligase/Ap4A synthetase/Ap3A synthetase/dipeptide/tripeptide:H(+) symporter DtpC |
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| * | ? | NC_000913 | = 4354768 | 0 (0.000) | 46 (1.130) | 42/490 | 0.1 | 100% | intergenic (‑51/+186) | lysU/dtpC | lysine‑‑tRNA ligase/Ap4A synthetase/Ap3A synthetase/dipeptide/tripeptide:H(+) symporter DtpC |
| ? | NC_000913 | = 4499511 | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
AATGTTTAAGGATTCCAGTTCCTGGTTATCCTTCGCATCAAAC‑TCTTCGTGCAACTGGTCAGAGGTATGGTCGCGGCGAAAATCATTGGGAAACGCCACACCTTGCTGACGTAGTGCCGCCAGTTTTTCGCGGCGATTTCTCAGTTCATCGTTAAAATCAATAGCCTCATTGGCTCCCCGTGTTTCTTGTTCAGACATTTTGGTTCCTCTAAATCCAGCTTTCAATTTAGCGTAGATAAAGAGACAGATCGGTACACTGTATTATCTGCCTCGACTATTAGTAACTCAGTTTATCTTATCGAAACTAACGCTTACCTCAAGTTG‑ATATCACTAATAAATAACCATCAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTGCTAAACAGAAAACGGGTAGCAAAG > NC_000913/4354520‑4355014 | gcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCAGATc < 2:120777‑M2/6‑1 (MQ=255) tttAAGGATTCCAGTTCCTGGTTATCCTTCGCATCAAAC‑TCTTCGTGCAACTGGTCAGAGGTATGGTCGCGGCGAAAATCATTGGGAAACGCCACACCTTGCTGACGTAGTGCCGCCAGTTTTTCGCGGCGATTTCTCAGTTCATCGTTAAAATCAATAGCCTCATTTGCTCCCCGTGTTTCTTGTTCAGACATTTTGTTTCCTCTAAATCCAGCTGTCAATTTAGCGTAGATAAAGAGACAGATtggat < 2:181294‑M1/250‑6 (MQ=255) ttCCAGTTCCTGGTTATCCTTCGCATCAAAC‑TCTTCGTGCAACTGGTCAGAGGTATGGTCGCGGCGAAAATCATTGGGAAACGCCACACCTTGCTGAAGTAGTGCCGCCAGTTTTTCGCGGCGATTTCTCAGTTCATCGTTAAAATCAATAGCCTCATTGGCTCCCCGTGTTTCTTGTTCAGACATTTTGGTTCCTCTAAATACAGCTTTCAATTTAGCGTAGATAAAGAGACAGATtggatttgcccct > 1:332355‑M1/1‑237 (MQ=255) tccagtgccgtgTTATCCTTCGCATCAAACGTCA‑CATGCAAATGGTCAGAGGTATGGTCGCGGCGAAAATCATTGGGAAACGCCACACCTTGCTGACTTAGTGCCGGTATTTTTTCGTGGCGATTTCTCAGTTCATCGTTAAAATCAATAGCCTTATTGGCTCCCCGTGTTTCTTGTTCAGTCATTTTGGTTCCTCTAAGTCCAGCAATCAATTTAGCGTAGACAAAGAGACAGAttttatgagccccta < 2:163501/239‑15 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |