Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,270,356 | G→A | noncoding (237/377 nt) | rnpB ← | RNase P catalytic RNA component |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,270,356 | 0 | G | A | 100.0% | 131.4 / NA | 40 | noncoding (237/377 nt) | rnpB | RNase P catalytic RNA component |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (21/19); total (21/19) |
CGATAAGCCGCTTTCTTTTGGGTATAGCGTCGTGGACAGTCATTCATCTTTCTGCCCCTCCAAAAGCAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTAAATCAGGTGAAACTGACCGATAAGCCGGGTTCTGTCGTGGACAGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTC‑TGTTGCACTGGTCGTGGG‑TTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAG > NC_000913/3270116‑3270601 | cGATAAGCCGCTTTCTTTTGGGTATAGCGTCGTGGACAGTCATTCATCTTTCTGCCCCTCCAAAAGCAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTAAATCAGGTGAAACTGACCGATAAGCCGGGTTCTGTCGTGGACAGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGAAGTTTACCGt > 1:169744/1‑251 (MQ=255) gATAAGCCGCTTTCTTTTGGGTATAGCGTCGTGGACAGTCATTCATCTTTCTGCCCCTCCAAAAGCAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTAAATCAGGTGAAACTGACCGATAAGCCGGGTTCTGTCGTGGACAGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGAAGTTTACCGTg > 1:538133/1‑251 (MQ=255) ttctttTGGGTATTGCGTCGTGGACAGTCATTCATCTTTCTGCCCCTCCAACAGCACAACCCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTAAATCAGGTGAAACTGACCGATAAGCCGGGTTATGTCGTGGACAGTCATTCATCTAGGACAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGACTACCCGGGATCAGTACGGGCCGTACATTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGACGTTTACCGTGCCACGGACTGt > 2:447171/1‑251 (MQ=37) ttttGGGTATGGCGTCGTGGACAGTCATTCATCTTTCTGCCCCTCCAAAAGAAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTAAATCAGGTGAAACTGACCGATAAGCCGGGTTCTGTCGTGGACAGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGAAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTa < 2:538133/250‑1 (MQ=255) 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ttaCCGATAAGCCGGGTCCTGTCGTGGACAGTCATTCATCTAGGCCAGTAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTCCCCGGTTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATGTGGCCTTGCTCCGGGTGAAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTTCGCTCTTa < 2:97219/176‑1 (MQ=255) tGACCGATAAGCCGGGTTCTGTCGTGGACAGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGAAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTa > 1:97219/1‑178 (MQ=255) ccGGGTTCTGTCGTGGACAGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGAAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGGTTTTTCTC‑TGTTGTACAGGGCGGGGG‑GTTccccc > 1:275243/1‑251 (MQ=255) ggTTCTGACGTGGACAGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGAAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTC‑CTTTGTCCTTGTCGTGGGGTTTccccccc > 1:56403/1‑251 (MQ=255) gACAGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGAAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCATCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCGCTC‑TGTTGCACTGGTCGTGGG‑TTTCCCCCCCAGGCGTTACCTgg < 1:447171/251‑1 (MQ=255) ttcatCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGCACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGAAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGGGCGctct > 1:336454/1‑142 (MQ=255) ttcatCTACGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGTGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGAAGTTTACCGTGCCACGTACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGctct < 2:336454/142‑1 (MQ=255) atCTAGGCCAGCAATTGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTCCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGAAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTC‑TCCTGCTCCCGTCGTGGG‑TTTcccccccccccgttacctcaccccccgcccc > 1:382780/1‑227 (MQ=255) 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aTTTGGCCTTGCTCCGGGTGAAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTC‑TGTTGCACTGGTCGTGGG‑TTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGACTGGTc < 1:141866/251‑1 (MQ=255) tGGCCTTGCTCCGGGTGAAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTC‑TGTTGCACTGGTCg < 2:462524/136‑1 (MQ=255) gtcTTGCTCCGGGTGAAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTC‑TGTTGCACTGGTCGTGGG‑TTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCtt < 2:389529/249‑1 (MQ=255) tGCTCCGGGTGAAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTC‑TTTTGCACTGGTCGTGGG‑GTTCCCCCCCCGGCGGTTCCCGGCACCCCGCCCCATGGGGCCCGGGCTTTCCTCCCCTCCCCCCCGCTCCCCCCACGAGGGCGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCtt > 1:389529/1‑247 (MQ=255) tGCTCCGGGTGAACTTTCACGTGCCCCGGACTGTTACCAGGCGCGCGGTTCGCATGTCCCTCTCCCTTTCCCCCTTACCGGATCCCGCTTGCGTGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTC‑TGTTGCACTGGTCGTGGG‑TTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCAATGGAGCCCGGACTTTCCGACCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCg < 2:382780/249‑1 (MQ=255) ccGGGTGAAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTC‑TGTTGCACTGGTCGTGGG‑TTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGgcgcgc < 1:300593/251‑1 (MQ=255) gggTGAAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTC‑TTTTGCACTGGTCGTGGG‑GTTCCCCCCCCGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCCCTGGAGCCCCGCCTTTCTTCCCCTCCCCCCCCCTCCCCCCAAGAGGACGACGCCGAAACGGCGGCCGTCTGGTCAACTTCGgcgcgccg > 1:273931/1‑249 (MQ=255) | CGATAAGCCGCTTTCTTTTGGGTATAGCGTCGTGGACAGTCATTCATCTTTCTGCCCCTCCAAAAGCAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTTTTACGTAAATCAGGTGAAACTGACCGATAAGCCGGGTTCTGTCGTGGACAGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTC‑TGTTGCACTGGTCGTGGG‑TTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAG > NC_000913/3270116‑3270601 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |