| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,112,187 | C→T | A442V (GCC→GTC) | opgH → | osmoregulated periplasmic glucans biosynthesis protein H |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,112,187 | 0 | C | T | 96.3% | 170.4 / ‑2.4 | 56 | A442V (GCC→GTC) | opgH | osmoregulated periplasmic glucans biosynthesis protein H |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/1); new base T (35/17); total (37/19) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.42e-01 | |||||||||||
ATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGTATGGATACGCTGTATGCGCGCTGTCAGCAGTTCGCGACCCGCGTGTATGGGCCACTGTTTACAGCCGGTTTGCACTTCTGGCAACTTGGCGAGTCGCACTACTGGGGACATAACGCGATTATCCGCGTGAAACCGTTTATCGAGCACTGCGCACTGGCTCCGCTGCCGGGCGAAGGTTCCTTTGCCGGTTCAATCCTGTCACATGACTTCGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCAGGTTGGGGGGTCTGGATTGCTTACGATCTCCCGGGTTCTTATGAAGAATTGCCGCCTAACTTGCTTGATGAGCTAAAACGTGACCGCCGATGGTGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGT > NC_000913/1111949‑1112420 | aTGGAAGCCAACCAGAACGCCGGGAGCATTCCGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGTATGGATACGCTGTATGCGCGCTGTCAGCAGTTCGCGACCCGCGTGTATGGGCCACTGTTTACAGCCGGTTTGCACTTCTGGCAACTTGGCGAGTCGCACTACTGGGGACATAACGCGATTATCCGCGTGAAACCGTTTATCGCGCACTGCGCACTGGCTCCGCTGCCGGGCGAAGGTTCCTTTGTCGGTTCCATCCt > 2:270966/1‑251 (MQ=255) gAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGTATGGATACGCTGTATGCGCGCTGTCAGCAGTTCGCGACCCGCGTGTATGGGCCACTGTTTACAGCCGGTTTGCACTTCTGGCAACTTGGCGAGTCGCACTACTGGGGACATAACGCGATTATCCGCGTGAAACCGTTTATCGAGCACTGCGCACTGGCTCCGCTGCCGGGCGAAGGTTCCTTTGTCGGTTCAATCCTGTc > 1:324397/1‑251 (MQ=255) aaGCCAACCCGACCGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGTATGGATACGCTGTATGCGCGCTGTCAGCAGTTCGCGACCCGCGTGTATGGGCCACTGTTTACAGCCGGTTTGCACTTCTGGCAACTTGGCGAGTCGCACTACTGGGGACATAACGCGATTATCCGCGTGAAACCGTTTATCGAGCACTGCGCACTGGCTCCGCTGCCGGGCGAAGGTTCCTTTGTCGGTTCAATCCTGTc > 2:438714/1‑250 (MQ=255) cccGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGTATGGATACGCTGTATGCGCGCTGTCAGCAGTTCGCGACCCGCGTGTATGGGCCACTGTTTACAGCCGGTTTGCACTTCTGGCAACTTGGCGAGTCGCACTACTGGGGACATAACGCGATTATCCGCGTGAAACCGTTTATCGAGCACTGCGCACTGGCTCCGCTGCCGGGCGAAGGTTCCTTTGTCGGTTCAATCCTGTCACATGACt < 1:438714/251‑1 (MQ=255) cgaccGCCGGGATCATTCATCCGTCGCCGAAAGCGTCCGGTGTGGATACGCTGTATGCGCGCTGTCAGCAGTTCGCGACCCGCGGGTATGGGCCACTGTTTACAGCCGGTTTGCACTTCTGGCAACTTGGCGAGTCGCACTACTGGGGACATAACGCGATTATCCGCGTGAAACCGTTTAGCGAGCACTGCGCACTGGCGCCGCTGCCGGGCGAAGGTTCCTTTGTCGGTTCAATCCTGTCACATGACTTc < 2:58240/247‑1 (MQ=255) cGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGTATGGATACGCTGTATGCGCGCTGTCAGCAGTTCGCGACCCGCGTGTATGGGCCACTGTTTACAGCCGGTTTGCACTTCTGGCAACTTGGCGAGTCGCACTACTGGGGACATAACGCGATTATCCGCGTGAAACCGTTTATCGAGCACTGCGCACTGGCTCCGCTGCCGGGCGAAGGTTCCTTTGTCGGTTCAATCCTGTCACATGACTTc < 2:360897/251‑1 (MQ=255) ccGGGATCATTCAGTCGTCGCAGCAAGCGACCGGTATGGATACGCTGTATGCGCGCTGTCAGCAGTTCGCGACCCGCGTGTATGGGCCACTGTTTACAGCCGGTTTGCACTTCTGGCAACTTGGCGAGTCGCACTACTGGGGACATAACGCGATTATCCGCGTGAAACCGTTTATCGAGCACTGCGCACTGGCTCCGCTGCCGGGCGAAGGCTCCTTTGGCGGTTCAATCCTGCCACATGACTTCGTGGa > 2:338106/1‑250 (MQ=255) aTCATTCAGTCGTCGCCGAAATCGTCCGGTATGGATACGCTGTATGCGCGCTGTCAGCAGTTCGCGACCCGCGTGTATGGGCCACTGTTTACAGCCGGTTTGCACTTCTGGCAACTTGGCGAGTCGCACTACTCGGGACATAACGCGATTATCCGCGTGAAACCGTTTATCGAGCACTGCGCACTGGCTCCGCTGCCGGGCGAAGGTTCCTTTGTCGGGTCAATCCTGTCACATGACTTCGTGGAAgcggc > 2:2757/1‑251 (MQ=255) aTCATGCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGTATGGATACGCTGTATGCGCGCTGTCAGCAGTTCGCGACCCGCGTGTAGGGGCCACTGTTTACAGCCGGTTTGCACTTCTGGCAACTTGGCGAGTCGCACTACTGGGGACATAACGCTATTAGCCGCGTGAAACCGTTTATCGAGCACTGCGTACTGGCTCCGCTGCCGGGCGAAGGGGCCTTTGTCGGGCCAATCCTGTCACATGACTTCGTGGAAgcggc < 2:262167/251‑1 (MQ=255) tccgtcgtcGCCGAAAGCGTCCGGTATGGATACGCTGTATGCGCGCTGTCAGCAGTTCGCGACCCGCGTGTATGGGCCACTGTTTACAGCCGGTTTGCACTTCTGGCAACTTGGCGAGTCGCACTACTGGGGACATAACGCGATTATCCGCGTGAAACCGTTTATCGAGCACTGCGCACTGGCTCCGCTGCCGGGCGAAGGTTCCTTTGTCGGTTCAATCCTGTCCCATGACTTCGTGGAAGCGGCGTTg > 2:448829/4‑250 (MQ=255) cGAAAGCGTCCGGTATGGATACGCTGTATGCGCGCTGTCAGCAGTTCGCGACCCGCGTGTATGGGCCACTGTTTACAGCCGGTTTGCACTTCTGGCAACTTGGCGAGTCGCACTACTGGTGACATAACGCGATTATCCGCGTGAAACCGTTTATCGAGCACTGCGCACTGGCTCCGCTGCCGGGCGAAGGTTCCTTTGTCGGTTCAATCCTGTCACATGACTTCGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCa < 1:213831/251‑1 (MQ=255) aaaGCGTCCGGTATGGATACGCTGTATGCGCGCTGTCAGCAGTTCGCGACACGCGTGTATGGGCCACTGTTTACAGCCGGTTTGCACTTCTGGCAACTTGGCGAGTCGCACTACTGGGGACATAACGCGATTATCCGCGTGAAACCGTTTATCGAGCACTGCGCACTGGCTCCGCTGCCGGGCGAAGGTTCCTTTGTCGGTTCAATCCTGTCACATGACTTCGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCAgg > 1:497594/1‑251 (MQ=255) aaGCGTCCGGTATGGATACGCTGTATGCGCGCTGTCAGCAGTTCGCGACCCGCGTGTATGGGCCACTGTTTACAGCCGGTTTGCACTTCTGGCAACTTGGCGAGTCGCCCTACTGGGGACATAACGCGATTATCCGCGTGAAACCGTTTATCGAGCACTGCGCACTGGCTCCGCTGCCGGGCGAAGGTTCCTTTGTCGGTTCAATCCTGTca > 1:25991/1‑212 (MQ=255) aaGCGTCCGGTATGGATACGCTGTATGCGCGCTGTCAGCAGTTCGCGACCCGCGTGTATGGGCCACTGTTTACAGCCGGTTTGCACTTCTGGCAACTTGGCGAGTCGCACTACTGGGGACATAACGCGATTATCCGCGTGAAACCGTTTATCGAGCACTGCGCACTGGCTCCGCTGCCGGGCGAAGGTTCCTGTGTCGGTTCAATCCTGTca < 2:25991/212‑1 (MQ=255) cccGGTATGGATACGCTGTATGCGCGCTGTCAGCAGTTCGCGACCCGCGTGTATGGGCCACTGTTTACAGCCGGTTTGCACTTCTGGCAACTTGGCGAGTCGCACTACTGGGGACATAACGCGATTATCCGCGTGAAACCGTTTATCGAGCACTGCGCACTGGCTCCGCTGCCGGGCGAAGGTTCCTTTGTCGGTTCAATCCTGTCACATGACTTCGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCAGGTTgggg < 2:204370/250‑1 (MQ=255) ggtaTACGCTGTATGCGCGCTGTCATCAGTTCGCGGCCCGCGTGTATGGGCCACTGTTTACAGCCGGTTTGCACTTCTGGCAACTTGGCGAGTCGCACTACTGGGGACATAACGCGATTATCCGCGTGAAACCGTTTATCGAGCACTGCGCACTGGCTCCGCTGCCGGGCGAAGGGTCCTTTGGCGGTTCAATCCTGTCACATGACTTCGTGTAAGCGGCGTTGATGCGCCGGGCAGGTTGGGGGGTCTgg < 2:338662/248‑1 (MQ=255) gggATACGCTGTATGCGCGCTGTCAGCAGTTCGCGACCCGCGTGTATGGGCCACTGTTTACAGCCGGTTTGCACTTCTGGCAACTTGGCGAGTCGCACTACTGGGGACATAACGCGATTATCCGCGTGAAACCGTTTATCGAGCACTGCGCACTGGCTCCGCTGCCGGGCGAAGGTTCCTTTGTCGGTTCAATCCTGTCACATGACTTCGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCAGGTTGGGGGGTCTgg < 1:2757/250‑1 (MQ=255) tATGCGCGCTGTCAGCAGTTCGCGACCCGCGTGTATGGGCCACTGTTTACAGCCGGTTTGCACTTCTGGCAACTTGGCGAGTCGCACTACTGGGGACATAACGCGATTATCCGCGTGAAACCGTTTATCGAGCACTGCGCACTGGCTCCGCTGCCGGGCGAAGGTTCCTTTGTCGGTTCAATCCTGTCACATGACTTCGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCAGGTTGGGGGGTCTGGATTGCTTACg > 1:218852/1‑250 (MQ=255) gcgcgcTGTCAGCAGTTCGCGACCCGCGTGTATGGGCCACTGTTTACAGCCGGTTTGCACTTCTGGCAACTTGGCGAGTCGCACTACTGGGGACATAACGCGATTATCCGCGTGAAACCGTTTATCGAGCACTGCGCACTGGCTCCGCTGCCGGGCGAAGGTTCCTTTGTCGGTTCAATCCTGTCACATGACTTCGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCAGGTTGGGGGGTCTGGATTGCTTACGAtc < 1:413253/250‑1 (MQ=255) cagcagTTCGCGACCCGCGTGTATGGGCCACTGTTTACAGCCGGTTTGCACTTCTGGCAACTTGGCGAGTCGCACTACTGGGGACATAACGCGATTATCCGCGTGAAACCGTTTATCGAGCACTGCGCACTGGCTCCGCTGCCGGGCGAAGGTTCCTTTGTCGGTTCAATCCTGTCACATGACTTCGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCAGGTTGGGGGGTCTGGATTGCTTACGATCTCCCGGGtt < 2:469698/250‑1 (MQ=255) agTTCGCGACCCGCGTGTATGGGCCACTGTTTACAGCCGGTTTGCACTTCTGGCAACTTGGCGAGTCGCACTACTGGGGACATAACGCGATTATCCGCGTGAAACCGTTTATCGAGCACTGCGCACTGGCTCCGCTGCCGGGCGAAGGTTCCTTTGTCGGTTCAATCCTGTCACATGACTTCGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCAGGTTGGGGGGTCTGGATTGCTTACGATCTCCCGGGTTCTTAt > 1:120356/1‑251 (MQ=255) agTTCGCGACCCGCGAGTATGGGCCACTGTTTCCAGCCGGTTTGCACTTCTGGCAACTTGGCGAGTCGCACTACTGGGGACATAACGCGATTATCCGCGTGAAACCGTTTATCGAGCACTGCGCACAGGCTCCGCTGCCGGGCGCAGGTTCCTTTGTCGGTTCAATCCTGTCACATGACTTCGAGGACGCGGCGTTGATGCGACGTGCATGTTGGGGGGGCTGGATTGCTTACGAACGCCCGGGTTCTTAt > 2:326084/1‑251 (MQ=255) cgcgACCCGCGTGTATTGGCCACTGTTTACAGCCGGTTTGCACTTCTGGCAACTTGGCGAGTCGCACTACTGGGGACATAACGCGATTATCCGCGTGAAACCGTTTATCGAGCACTGCGCACTGGCTCCGCTGCCGGGCGAAGGTTCCTTTGTCGGTTCAATCCTGTCACATGACTTCGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCTTGCAGGTTGGGGGGGCTGGATTGCTTACGATCTCCCGGGTTCTTATgaag < 1:326084/251‑1 (MQ=255) ccGCGTGTATGGGCCACTGTTTACAGCCGGTTTGCACTTCTGGCAACTTGGCGAGTCGCACTACTGGGGACATAACGCGATTATCCGCGTGAAACCGTTTATCGAGCACTGCGCACTGGCTCCGCTGCCGGGCGAAGGTTCCTTTGTCGGTTCAATCCTGTCACATGACTTCGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCAGGTTGGGGGGTCTGGATTGCTTACGATCTCCCGGGTTCTTATGAAGAATTgc < 2:218852/251‑1 (MQ=255) cgcttgtATGGGCCACTGTTTACAGCCGGTTTGCACTTCTGGCAACTTGGCGAGTCGCACTACTGGGGACATAACGCGATTATCCGCGTGAAACCGTTTATCGAGCACTGCGCACTGGCTCCGCTGCCGGGCGAAGGTTCCTTTGTCGGTTCAATCCTGTCACATGACTTCGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCAGGTTGGGGGGTCTGGATTGCTTACGATCTCCCGGGTTCTTATGAAGAATTgcc < 2:324397/247‑1 (MQ=255) gCCGGTTTGCACTTACGGCAACTTGGCGAGTCGCACTACTGGGGACATAACGCGATTATCCGCGTGAAACCGTTTATCGAGCACTGCGCACTGGCTCCGCTGCCGGGCGAAGGTTCCTTTGTCGGTTCAATCCTGTCACATGACTTCGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCAGGTTGGGGGGTCTGGATTGCTTACGATCTCCCGGGTTCTTATGAAGAATTGACGCCTAACTTGCTTGATGAGCTaa > 1:393081/1‑250 (MQ=255) ccGGTTTGCACTTCTGGCAACTTGGCGAGTCGCACTACTGGGGACATAACGCGATTATCCGCGTGAAACCGTTTATCGAGCACTGCGCACTGGCTCCGCTGCCGGGCGAAGGTTCCTTTGTCGGTTCAATCCTGTCACATGACTTCGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCAGGTTGGGGGGTCTGGATTGCTTACGATCTCCCGGGTTCTTATGAAGAATTGCCGCCTAACTTGCTTGATGAGCTaaa > 1:332586/1‑250 (MQ=255) cACTTCTGGCAACTTGGCGAGTCGCACTACTGGGGACATAACGCGATTATCCGCGTGAAACCGTTTATCGAGCACTGCGCACTGGCTCCGCTGCCGGGCGAAGGTTCCTTTGTCGGTTCAATCCTGTCACATGACTTCGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCAGGTTGGGGGGTCTGGATTGCTTACGATCTCCCGGGTTCTTATGAAGAATTGCCGCCTAACTTGCTTGATGAGCTAAAACGTGAccg > 1:497121/1‑251 (MQ=255) cTGGCAACTTGGCGAGTCGCACTACTGGGGACATAACGCGATTCTCCGCGTGAAACCGTTTATCGGGCACTGCGCACTGGCTCAGCTGCCGGGCGAAGGTTCCTTTGTAGGTTCAATCCTGTCACATGACTTCGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCAGGTTGGGGGGTCTGGATTGCTTACGATCTCCCGGGTTCTTATGAAGAATTGCCGCCTAACTTGCTTGATGAGCTAAAACGTGACCGCCGAt > 1:309233/1‑251 (MQ=255) cGAGTCGCACTACTGGGGACATAACGCGATTATCCGCGTGCAACCGTTTATCGAGCACTGCGCACTGGCTCCGCTGCCGGGCGAAGGTTCCTTTGTCGGTTCAATCCTGTCACATGACTTCGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCAGGTTGGGGGGTCTGGATTGCTTACGATCTCCCGGGTTCTTATGAAGAATTGCCGCCTAACTTGCTTGATGAGCTAAAACGTGACCGCCGATGGTGCCACGGt > 1:501521/1‑250 (MQ=255) ccACTACGGGGGACTTAACGCGTTTATCCGCGTGAAACCGTTTAGCGAGCACGGCGCACTGGCTCCGCTGCCGGGCGATGGTTCTTTTGTCGGTTCAACCCGGTCACATGTCTTCGTGGAGGCGGCGTTGATGCGCCGGGCAGGTGGGGGGGTCGGGTTTGTTTACGATCTCCCGGTTTCTTATGAAAAATTGCCGCTAAACTTGTTTGATGAGGAAAAACGTGACCGCCGATGGTGCCACGGTAACCtga < 1:270966/250‑1 (MQ=255) actactGGGGACATAACGCGATTATCCGCGTGAAACCGTTTATCGAGCACTGCGCACTGGCTCCGCTGCCGGGCGAAGGTTCCTTTGTCGGTTCAATCCTGTCACATGACTTCGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCAGGTTGGGGGGTCTGGATTGCTTACGATCTCCCGGGTTCTTATGAAGAATTGCCGCCTAACTTGCTTGATGAGCTAAAACGTGACCGCCGATGGTGCCACGGTAACCtgatg > 1:78956/1‑251 (MQ=255) gggACATAACGCCATTATCCGCGTGAAACCGTCTATCCAGCCCGGCGCACTGGCTCCGCTGCCAGGAGAAGGTTCCCTTGTAGGGTCAATCCTGTCACATGACTTCGTGGAAGCGGCGTTGCTGCGCCGTGCTGGTTGGGGGGTCTGGATTGCTTACGATCTCCCGGGTTCTTATGACGAATTGCCGCCTAACTTGCTTGATGAGCTAACACGTGACCGCCCATGGTGCCACGGTACCCtactaaacttac > 2:315152/1‑240 (MQ=255) tAACGCGATTATCCGCGTGAAACCGTTTATCGAGCACTGCGCACTGGCTCCGCTGCCAGGCGAAGGTTCCTTTGTCGGTTCAATCCTGTCACATGACTTCGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCAGGTTGGGGGGTCTGGATTGCTTACGATATCCCGGGTTCTTATGAAGAATTGCCGCCTAACTTGCTTGATGAGCTAAAACGTGACCGCCGATGGTGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGt > 2:348948/1‑251 (MQ=255) gcgATTATCCGCGTGAAACCGTTTATCGAGCACTGCGCACTGGCTCCGCTGCCGGGCGAAGGTTCCTTTGTCGGTTCAATCCTGTCACATGACTTCGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCAGGTTGGGGGGTCTGGATTGCTTACGATCTCCCGGGTTCTTATGAAGAATTGCCGCCTAACTTGCTTGATGAGCTAAAACGTGACCGCCGCTGGTGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCt > 2:128874/1‑251 (MQ=255) ttATCCGCGTGAACCCTTTTACCGAGCACTGCGCACTGGCTCCGCTGCCGGGCGAAGGTTCCTTTGTCGGTTCAATCCTGTCACATGACTTCGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCAGGTTGGGGGGTCTGGATTGCTTACGACCTCCCGGTTTCTTATGAAGAATTGCCGCCTAACTTGCTTGATGAGCAAAAACGTGACCGCCGATGGTGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGt < 1:37571/250‑1 (MQ=255) accggcgTGAAACGGTTTATCGAGCACTGCCCGTTGGCCCCGCTGCGGGGCGAAGGTTCCTTTGTCGTTTAAACCCTGCCACATGATTTCGTGGAAGGGGCGTTGAGGCGCCGTGCAGGTGGGGGGGTCTGTATTGCGTACGTTCTCCCGGGTTCTTATGAAAAATTGCCGCCAAACTTGCTTGATGAGCTAAACCGTGACCGCCGATGGTGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGa < 1:448829/246‑1 (MQ=255) aTCCGCGTGAAACCGTTTATCGAGCACTGCGCACTGGCTCCGCTGCCGGGCGAAGGTTCCTTTGTCGGTTCAATCCTGTCACATGACTTCGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCAGGTTGGGGGGTCTGGATTGCTTACGATCTCCCGGGTTCTTATGACGAATTGCCGCCTAACTTGCTTGATGAGCTAAAACGTGACCGCCGATGGTGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGa > 2:385097/1‑250 (MQ=255) cgTGAAACCGTTTATCGAGCACTGCGCACTGGCTCCGCTGCCGGGCGAAGGTTCCTTTGTCGGTTCAATCCTGTCACATGACTTCGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCAGGTTGGGGGGTCTGGATTGCTTACGATCTCCCGGGTTCTTATGAAGAATTGCCGCCTAACTTGCTTGATGAGCTAAAACGTGACCGCCGATGGTGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGt > 1:135701/1‑250 (MQ=255) tGAAACCGTTTATCGAGCACTGCGCACTGGCTCCGCTGCCGGGCGAAGGTTCCTTTGTCGGTTCAATCCTGTCACATGACTTCGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCAGGTTGGGGGGTCTGGATTGCTTACGATCTCCCGGGTTCTTATGAAGAATTGCCGCCTAACTTGCTTGATGAGCTAAAACGTGACCGCCGATGGTGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATg > 2:395246/1‑251 (MQ=255) aaCCGTTTATCGCGCACTGCGCACTGGCTCCGCTGCCGGGCGAAGGTTCCTTTGTCGGTTCAATCCTGTCACATGACTTCGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCAGGTTGGGGGGTCTGGATTGCTTACGATCTCCCGGGTTCTTATGAAGAATTGCCGCCTAACTTGCTTGATGAGCTAAAACGTGACCGCCGATGGTGCAACGGTAACCTGCTGAACTTACGTCTGTTCCAGTGGAAGGGAATGCAc > 2:288396/1‑251 (MQ=255) cGTTTATCGAGCACTGCGCACTGGCTCCGCTGCAGGGCGAAGGCTCCTTTGTCGGTTCAATCCTGTCACATGACTTCGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCAGGTTGGGGGGTCTGGATTGCTTACGATCTCCCGGGTTCTTATGAAGAATTGCCGCCTAACTTGCTTGATGAGCTAAAACGTGACCGCCGATGGTGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCg > 2:343559/1‑251 (MQ=255) ttATCGAGCACTGCGCACTGGCTCCGCTGCCGGGCGAAGGTTCCTTTGTCGGTTCAATCCTGTCACATGACTTCGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCAGGTTGGGGGGTCTGGATTGCTTACGATCTCCCGGGTTCTTATGAAGAATTGCCGCCTCACTTGCTTGATGAGCTAAAACGTGACCGCCGATGGTGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGtt > 1:160604/1‑251 (MQ=255) aTCGAGCACTGCGCACTGGCTCCGCTGCCGGGCGAAGGTTCCTTAGTCGGTTCAATCCTGTCACATGACTTCGTGGAAGAGGCGTTGATGCGCCGTGCAGGTTGGGGGGGCTGGATTGCTTACGATCTCCCGGGTTCTCATGCAGAATTGCCGCCTAACTTGCTTGATGAGCTAAAACGTGACCGCCGATGGGGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCTTGGTGAAGGGAATGCACCCGGTTc > 2:478717/1‑250 (MQ=255) cgggCACTGCGCACGGGCGCCGCTGCGGGGCGAGGGTTCTTTTGTTGTTTCAATCTTTGCAAATGACTTGGTGGAAGCGGCGGTGAGGCGCGGGGCGGGTTGGGGGTTCTGGGTTGCTTAGGATCCCCGGGGTTCTTATGAAGAATTGCCGCCTAATTTTCTGTATGAGCAAAACCGTGTCCGCCGATGGTGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCAc < 1:491195/247‑1 (MQ=255) aGCACTGCGCACTGGCTCCGCTGCCGGGCGAAGGTTCCTTTGTCGGTTCAATCCTGTCACATGACTTCGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCAGGTTGGGGGGTCTGGATTGCTTACGATCTCCCGGGTTCTTATGAAGAATTGCCGCCTAACTTGCTTGATGAGCTAAAACGTGACCGCCGATGGTGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGt > 1:457215/1‑251 (MQ=255) gCACTGCGCACTGGCTCCGCTGCCGGGCGAAGGTTCCTTTTTCGGTTCAATCCTGTCACATGACTTCGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCAGGTTGGGGGGTCTGTATTGCTTACGATCTCCAGGGTTCTTCTGAGGAATTGCCGCCTAACTGGCTTGATGAGCTAAAACGTGACCGCCGATGGTGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTg > 2:285578/1‑251 (MQ=255) cgcACTGGCTCAGCTGCCGGGCGAAGGTTCCTTTGTCGGTTCAATCATGTCACATGACTTCGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCAGGTTGGGGGGACTGGATTGCTTACGATCTCCCGGGTTCTTATGAAGAATTGCCGCCTAACTTGCTTGATGAGCTAAAACGTGACCGCCGATGGTGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAGGGGTATGCACCCGGTTCCCCGTGCGgtgt > 2:327339/1‑251 (MQ=255) ggCTCCGCTGCCGGGCGAAGGTTCCTTTGTCGGTTCAATCCTGTCACATGACTTCGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCAGGTTGGGGGGTCTGGATTGCTTACGATCTCCCGGGTTCTTATGAAGAATTGCCGCCTAACTTGCTTGATGAGCTAAAACGTGACCGCCGATGGTGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTg > 1:469224/1‑250 (MQ=255) ccGCTGCCGGGCGAAGGTTCCTTTGTCGGTTCAATCCTGTCACATGACTTCGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCAGGTTGGGGGGTCTGGATTGCTTACGATCTCCCGGGTTCTTATGAAGAATTGCCGCCTAACTTGCTTGATGCGCTAAAACGTGACCGCCGATGGTGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACggg > 1:420032/1‑251 (MQ=255) gCTGCCGGGCGAAGGTTCCTTTGTCGGTTCAATCCTGTCACATGACTTCGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCAGGTTGGGGGGTCTGGATTGCTTACGATCTCCCGGGTTCTTATGAAGAATTGCCGCCTAACTTGCTTGATGAGCTAAAACGTGACCGCCGATGGTGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCg > 2:146336/1‑251 (MQ=255) gCTGCCGGGCGAAGGTTCCTTTGTCGGTTCAATCCTGTCACATGACTTCGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCAGGTTGGGGGGTCTGGATTGCTTACGATCTCCCGGGTTCTTATGAAGAATTGCCGCCTAACTTGCTTGATGAGCTAAAACGTGACCGCCGATGGTGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCg > 1:481475/1‑251 (MQ=255) cTGCCGGGCGAAGGTTCCTTTGTCGGTTCAATCCTGTCACCTGACTTCGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCAGGTTGGGGGGTCTGGCTTGCTTACGATCTCCCGGGTTATTATGAAGAATTGCCGCCTAACTTGCTTGATGAGCTAAAACGTGACCGCCGATGGTGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGt > 1:435335/1‑251 (MQ=255) gggCGAAGGTTCCTTTGTCGGTTCAATCCTGTCACATGACTTCGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCAGGTTGGGGGGTCTGGATTGCTTACGATCTCCCGGGTTCTTATGAAGAATTGCCGCCTAACTTGCTTGATGAGCTAAAACGTGACCGCCGATGGTGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGt > 1:355005/1‑251 (MQ=255) gCCGGTTCAATCCTGTCACATGACTTCGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCAGGTTGGGGGGTCTGGATTGCTTACGATCTCCCGGGTTCTTATGAAGAATTGCCGCCTAACTTGCTTGATGAGCTAAAACGTGACCGCCGATGGTGCCACGGTAACCtgatg > 2:9405/1‑165 (MQ=255) gCCGGTTCAACCCTGTCACATGACTTCGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCAGGTTGGGGGGTCTGGATTGCTTACGATCTCCCGGGTTTTTATGAAGAATTGCCGCCTAACTTGCTTGATGAGCTAAAACGTGACCGCCGATGGTGCCACGGTAACCtgatg < 1:9405/165‑1 (MQ=255) | ATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGTATGGATACGCTGTATGCGCGCTGTCAGCAGTTCGCGACCCGCGTGTATGGGCCACTGTTTACAGCCGGTTTGCACTTCTGGCAACTTGGCGAGTCGCACTACTGGGGACATAACGCGATTATCCGCGTGAAACCGTTTATCGAGCACTGCGCACTGGCTCCGCTGCCGGGCGAAGGTTCCTTTGCCGGTTCAATCCTGTCACATGACTTCGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCAGGTTGGGGGGTCTGGATTGCTTACGATCTCCCGGGTTCTTATGAAGAATTGCCGCCTAACTTGCTTGATGAGCTAAAACGTGACCGCCGATGGTGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGT > NC_000913/1111949‑1112420 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |