New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 275508 | 26 (0.710) | 12 (0.340) | 11/462 | 1.1 | 27.6% | coding (184/1404 nt) | mmuP | S‑methyl‑L‑methionine transporter |
? | NC_000913 | 372749 = | 38 (1.080) | coding (635/810 nt) | mhpD | 2‑hydroxypentadienoate hydratase |
ACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTATATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGG‑TCCGGCTACCGGGT‑ATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGGATTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTA > NC_000913/275268‑275736 | aCGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTATATGCAAACAATACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCTCCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGcacgcaaaat < 2:217891‑M1/251‑11 (MQ=255) aaaCCTGCTTTGGATGTTTAGATGGCCATACGTTTAGAATGTTATATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCTCACAATGAAAACGCGTCTCCTGATTAGGCATTCCTTGGGCGGCTTTATTGGCACAGGATTATTCTGCAAGACCGGGTACATCATTGCCACCTCAGGATCGGCGGGGACCCCGCTGGCCTATCTGAATGGTGCGCCTGTGTTTGGGCTGGTTATACAGTGGCTGGGCGAGCt < 2:415146/251‑1 (MQ=255) tttAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTATATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAACGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTTGTGGGCTGGGGGGCTGGCTGGcacgcgaaatgggcagtatggggggaacgctgcgcacc > 1:211162‑M1/1‑213 (MQ=255) ttAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTATATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGcacgcaaaatggccagtctgggtgaaccgctgcgcacc < 1:307133‑M1/250‑39 (MQ=255) ttAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTATATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGcacgcaaaatggccagtctgggtgaaccgctgcgcacc < 1:303434‑M1/250‑39 (MQ=255) tAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTATATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGCTTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGGACGATGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTGTGGCGGGcacccaaaaacgacagtctggggggacagccgggcacccg > 2:421635‑M1/1‑211 (MQ=255) agaggTCCATACGTTTAGAAGGTTATATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCGTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCGCTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGAGATGCCGga < 2:123996/246‑1 (MQ=255) aTGTCCATACGTTTAGAAGGTTATATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGcacgcaaaatggccagtctgggtgaaccgctgcgcaccggaga < 1:421635‑M1/251‑44 (MQ=255) gTCCATACGTTTAGAAGGTTATATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCGCTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTTGTCGGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGAcc < 1:341033/250‑1 (MQ=255) gTCCATACGTTTAGAAGGTTATATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGAcc < 1:24287/250‑1 (MQ=255) ccATACGTTTAGAAGGTTATATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAAAGCTGCTGGCCCATCTGATTTGGGCGCTGGGGGTCTGGCTGGGTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGGCGCGATGCCgggggccggg > 1:218422/1‑243 (MQ=255) ttAGAAGGTTATATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCTCCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCTCCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTgg < 2:93660/211‑1 (MQ=255) atGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGGACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGGGGTCTGGCTGGGTATGCAGTGTCTGGGCg > 1:227131/1‑202 (MQ=255) atGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCg < 2:227131/202‑1 (MQ=255) aaaCAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTTGCCTATCTGATTTGGGGGCTGGTGGGCTGGCTGGGTATGCAGGGTCTGGGCGGGCTGTCGGGCGCGATGGCGGAGGACGGAGGGTTTTACGGTTATGCCgcgcgc > 1:71656/1‑251 (MQ=255) aacacaacaAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATc < 1:330345/251‑1 (MQ=255) aCTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGcacgcaaaatggccagtctgggtgaaccgctgcgcaccggagatatcattcttaccggggcattaggtccgatggtggcggtgaatgcgggcg < 1:18701‑M1/251‑94 (MQ=255) aaaaCGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGcacgcaaaatggccagtctgggtgaaccgctgcgcaccggagatatcattcttaccggggcattaggtccgatggtggcggtgaatgcgggcgatcgttttgaagccca < 1:132661‑M1/251‑110 (MQ=255) aCGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGcacgcaaaatggccagtctgggtgaaccgctgcgcaccggagatatcattcttaccggggcattaggtccgatggtggcggtgaatgcgggcgatcgttttgaagcccatat < 1:4955‑M1/251‑113 (MQ=255) cgcgTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGGCTATCTGATTGGTGCGCTGGGGGGCTGGCTGGGTATGCAGTGTCTGGGGGAGCTGTCGGTCGCGCTGCCGGGGACCGGGGCGGTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGG‑TCCGGCTACCGGGG‑ATACCCTGGCCTGGGttttc > 1:318985/1‑249 (MQ=255) aCCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGcacgcaaaatggccagtctgggtgaaccgctgcgcaccggagatatcattcttaccggggcattaggtccgatggtggcggtgaatgcgggcgatcgttttgaagcccatattgaaggc < 1:322772‑M1/251‑120 (MQ=255) ccTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGG‑TCCGGCTACCGGGT‑ATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGa < 1:93389/251‑1 (MQ=255) ccTGAATATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGTTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGGTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGG‑TCCGGCTACCGGGT‑ATGCCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGa < 1:94977/251‑1 (MQ=255) tCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGTCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGTCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGG‑TCCGGCTGCCGGGT‑ATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTgg < 2:218422/250‑1 (MQ=255) gggCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGG‑TCCGGCTACCg < 1:218631/203‑1 (MQ=255) gATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGCACATCATTTCCACCACTGGAGCAGCAGGAACACCGACGGCCTATCTGATTTGCGCGCAGGCGGTATGGATGGGTATGGAGGGTCTGGGCGAGGTGTAGGTCCCGCTGCCGGAGACCGGCGCGTTTCTCGTTTATGGCGCGCGCCATCCTGG‑GCCGGCGCCCGGGG‑GTACCGTGGGCCGGCGTTTTTGGCTGACCTGGACCATGGCGCTGGGGTCGAGCt > 1:230671/1‑251 (MQ=255) aTTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGGGGTCTGGCTGGGTATTCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGGTGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTTTGCCGCGGGCTATCTTGG‑TCCGGCTACCGGGT‑GTACCGTGGCCTGGCTTTAATGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCtt > 1:164069/1‑251 (MQ=255) caGGATTATTCTTCAATACCGGGTAAAACATTTCCACCACGGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGG‑TCCGGCTACCGGGT‑ATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTAccgcc < 2:375134/251‑1 (MQ=255) aaTACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAAAGATGCTGGCCACACTCATTGGTGGGCTAGGGGGCTGGCTGGGTATTCAGTGTCTAGGAGAGCTGTCGGTCGCGGTGCCGGGGACCGGGGCGGTTCAAGGTTATGCCGCGCGCTATCTTTG‑GCCGGCTACCGGGG‑CTACCCCGGCCTGGCTTTTCAGGCCGGCCTGGGCCGGGGGGCCGGGGTCGAGAATTACAGCCGCTGGGTTCTGTAt > 1:200713/1‑251 (MQ=255) ccGGGTACATCATTTCCCCCACTGGGGCGGCGGTAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGACACCGGAGCGTTGCACGTTTATGCGGCGCGCTTCCTTGG‑TCCGGCT‑CCGGGTTATCCCGTGGCCTGGTTTTACTGGCTGACCGGGACCGTGGCGCTGGGTCCGAGCTTTACCGCCGCTGGATTCTGTATGCAg < 1:408068/251‑1 (MQ=255) gTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGG‑TCCGGCTACCGGGT‑ATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGCCCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGGATTCTGTATGCAGTACt < 1:141612/251‑1 (MQ=255) tGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGcacgcaaaatggccagtctgggtgaaccgctgcgcaccggagatatcattcttaccggggcattaggtccgatggtggcggtgaatgcgggcgatcgttttgaagcccatattgaaggcataggttcagttgctgcgacattttcaagcg < 1:177805‑M1/206‑151 (MQ=255) ggcggGTACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGG‑TCCGGCTACCGGGT‑ATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGGATTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATggg > 1:115182/1‑251 (MQ=255) ggggAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGGGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTAGGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGG‑TCCGGCTACCGGGT‑ATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGGATTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTc < 1:265603/250‑1 (MQ=255) gagtgtggcgcTGGTGGTCTGGGTGGTGATGGAGTGTCGGGGCGATCTGTCGGTGGCGATGCCGGAGCCCGGGGCGTTTCGCGTTTTTGCCGCGTG‑TTTGTTGGGTCCGGCTACCGGGT‑ATCCCGGGGCCTGCCTTTTCTGGCGGCCCGTGTCGGTGGGGCGGGTTTCGAGCGTTACCGCCGCTGGATTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGGTCTgcg < 2:115182/241‑1 (MQ=255) aTTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGcacgcaaactggccagtctgggtgaaccgctgcgcaccggagatatcattcttaccggggcattaggtccgatggtggcggtgaatgcgggcgatcgttttgaagcccatattgaaggcataggttcagttgctgcgacattttcaagcgcagccccaaaaggaagtctgtcatgagtaagcgtaaagtcgccattatcggttctggccacattggtaccgatctg > 1:359601‑M1/1‑25 (MQ=255) ggTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGG‑TCCGGCTACCGGGT‑ATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGGATTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGatta < 1:125423/250‑1 (MQ=255) tggTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGCGAACGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGG‑TCCGGCTACCGGGT‑ATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGGATTCtagaatccagcggc > 1:184287/1‑168 (MQ=255) | ACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTATATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTTGG‑TCCGGCTACCGGGT‑ATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGGATTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACAGGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTA > NC_000913/275268‑275736 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |