Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC | NC_000913 | 2,278,188 | (AGACCAGC)1→2 | coding (50/345 nt) | yejG ← | protein YejG |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2278175 = | 3 (0.090) | 17 (0.510) | 17/474 | 0.8 | 85.2% | coding (63/345 nt) | yejG | protein YejG |
? | NC_000913 | = 2278182 | 3 (0.090) | coding (56/345 nt) | yejG | protein YejG |
AGCCCCGCAAACGTGACCACGCCCGCAGATATTACTTAAATCAGAGCCATAGAGGCCACGCAGGCGAGGCATCAATCTTTACGATCTGTATAAAGACGGATTGTTGATGATGTGTTAAAATTGATGTAAACAAATTGTGAAGTGAATGTGCTTCCGGGGAAAATAAGTGACTTCATTACAACTCTCAATCGTCCATCGACTGCCGCAGAACTATCGCTGGTCTGCTGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2278403‑2278175 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gctggtCTGCTGGTTTCGCAGGTTCGAAGGTTGAACCGATTCCGCAAAATGGACCGTGCGGTGACAACAGCCTGGTGGCGCTTAAATTGCTTAGCCCGGATGGTGATAATGCATGGTCGGTGATGTATAAACTAAGCCAGGCGTTAAGCGACATCGAAGTTCCATGTTCGGTGCTGGAGTGTGAAGGTGAGCCGTGCCTGTTTGTAAATCGCCAGGACGAGTTTGCTGCAACATGCCGAT < NC_000913/2278182‑2277949 AGCCCCGCAAACGTGACCACGCCCGCAGATATTACTTAAATCAGAGCCATAGAGGCCACGCAGGCGAGGCATCAATCTTTACGATCTGTATAAAGACGGATTGTTGATGATGTGTTAAAATTGATGTAAACAAATTGTGAAGTGAATGTGCTTCCGGGGAAAATAAGTGACTTCATTACAACTCTCAATCGTCCATCGACTGCCGCAGAACTATCGCTGGTCTGCTGGTCTGCTGGTTTCGCAGGTTCGA > 2:146332/1‑250 AGAGCCATAGAGGCCACGCAGGCGAGGCATCAATCATTACGATCTGTATAAAGACGGAGTGTTGATGATGTGTTAAAATTGATGTAAACAAATTGTGAAGTGAATGTGCTTCCGGGGAAAATAAGTGACTTCATTACAACTCTCAATCGTCCATCGACTGCCGCAGAACTATCGCTGGTCTGCTGGTCTGCTGGTTTCGCAGGTTCGAAGGTTGAACCGATTCCGCAAAATGGACCGTGCGGTGACAAC > 1:284885/1‑249 ATAGAGGCCACGCAGGCGAGGCATCAATCTTTACGATCTGTATAAAGACGGAGTGTTGATGATGTGTTAAAATTGATGTAAACAAATTGTGAAGTGAATGTGCTTCCGGGGAAAATAAGTGACTTCATTACAACTCTCAATCGTCCATCGACTGCCGCAGAACTATCGCTGGTCTGCTGGGCTGCTGGTTTCGCAGGTTCGAAGGTTGAACCGATTCCGCAAAATGGACCGTGCGGTGACAACAGCCTGGT < 1:326324/251‑1 TACGATCTGTATAAAGACGGATTGTTGATGATGTGTTAAAATTGATGTAAACAAATTGAGAAGTGAATGTGCTTCCGGGGAAAATAAGTGACTTCATTACAACTCTCAATCGTCCATCGACTGCCGCAGAACTATCGCTGGTCTGCTGGTCTGCTGGTTTCGCAGGTTCGAAGGTTGAACCGATTCCGCAAAATGGACCGTGCGGTGACAACAGCCTGGTGGCGCTTAAATTGCTTAGCCCGGATGGTGAT > 1:29612/1‑251 ATAAAGACGGATTGTTGATGATGTGTTAAAATTGATGTAAACAAATTGTGAAGTGAATGTGCTTCCGGGGAAAATAAGTGACTTCATTACAACTCTCAATCGTCCATCGACTGCCGCAGAACTATCGCTGGTCTGCTGGTCTGCTGGTTTCGCAGGTTCGAAGGTTGAACCGATTCCGCAAAATGGACCGTGCGGTGACAACAGCCTGGTGGCGCTTAAATTGCTTAGCCCGGATGGTGATAATGCATGGT < 1:146332/251‑1 GATGTGTTAAAATTGATGTAAACAAATTGTGAAGTGAATGTGCTTCCGGGGAAAATAAGTGACTTCATTACAACTCTCAATCGTCCATCGACTGCCGCAGAACTATCGCTGGTCTGCTGGTCTGCTGGTTTCGCAGGTTCGAAGGTTGAACCGATTCCGCAAAATGGACCGTGCGGTGACAACAGCCTGGTGGCGCTTAAATTGCTTAGCCCGGATGGTGATAATGCATGGTCGGTGATGTATAAACTAAG < 1:161478/251‑1 GTTACAATTGCTGTAAACAAATTGTGAAGTGAATGTGCTTCCGGGGAAAATAAGTGACTTCATTACAACTCTCAATCGTCCATCGACTGCCGCAGAACTATAGCTGGTCTGCTGGTCTGCTGGTTTCGCAGGTTCGAAGGTTGAACCGATTCCGCAAAATGGACCGTGCGGTGACAACAGCCTGGTGGAGCTTAAATTGCTTAGCCCGGATGGTGATAATGCATGGTCGGTGAGGTATAAACTAAGCCAGG > 2:224867/1‑251 TGTAAACAAATTGTGAAGTGAATGTGCTTCCGGGGAAAATAAGTGACTTCATTACAACTCTCAATCGTCCATCGACTGCCGCAGAACTATCGCTGGTCTGCTGGTCTGCTGGTTTCGCAGGTTCGAAGGTTGAACCGATTCCGCAAAATGGACCGTGCGGTGACAACAGCCTGGTGGCGCTTAAATTGCTTAGCCCGGATGGTGATAATGCATGGTCGGTGATGTATAAACTAAGCCAGGCGTTAAGCGAC > 1:199845/1‑251 AAATTGTGAAGTGAATGTGCTTCCGGGGAAAATAAGTGACTTCATTACAACTCTCAATCGTCCATCGACTGCCGCAGAACTATCGCTGGTCTGCTGGTCTGCTGGTTTCGCAGGTTCGAAGGTTGAACCGATTCCGCAAAATGGACCGTGCGGTGACAACAGCCTGGTGGCGCTTAAATTGCTTAGCCCGGATGGTGATAATGCATGGTCGGTGATGTATAAACTAAGCCAGGCGTTAAGCGACATCGA > 2:19701/1‑249 TTCCGGGGAAAATAAGTGACTTCATTACAACTCTCAATCGTCCATCGACTGCCGCAGAACTATCGCTGGTCTGCTGGTCTGCTGGTTTCGCAGGTTCGAAGGTTGAACCGATTCCGCAAAATGGACCGTGCGGTGACAACAGCCTGGTGGCGCTTAAATTGCTTAGCCCGGATGGTGATAATGCATGGTCGGTGATGTATAAACTAAGCCAGGCGTTAAGCGACATCGAAGTTCCATGTTCGGTGCTGG > 2:205379/1‑249 ATAAGGGACTTCATTACAACTCTCAATCGTCCATCGACTGCCGCAGAACTATCGCTGGTCTGCTGGTCTGCTGGTTTCGCAGGTTCGAAGGTTGAACCGATTCCGCAAAATGGACCGTGCGGTGACAACAGCCTGGTGGCGCTTAAATTGCTTAGCCCGGATGGTGATCATGCATGGTCGGTGATGTATAAACTAAGCCAGGCGTTAAGCGACATCGAAGTTCCATGTTCGGTGCTGGAGTGTGAAGGTG > 2:125034/1‑250 TAAGTGACTTCATTACAACTCTCAATCGTCCATCGACTGCCGCAGAACTATCGCTGGTCTGCTGGTCTGCTGGTTTCGCAGGTTCGAAGGTTGAACCGATTCCGCAAAATGGACCGTGCGGTGACAACAGCCTGGTGGCGCTTAAATTGCTTAGCCCGGATGGTGATAATGCATGGTCGGTGATGTATAAACTAAGCCAGGCGTTAAGCGACATCGAAGTTCCATGTTCGGTGCTGGAGTGTGAAGGTG > 2:288660/1‑249 ACTCTTAATCGTCCATCGACTGCCGCAGCACTATCGCTGGTCTCTTGGTCTGCTGCTTTCGCAGGTTCGAAGGTTGCACCGATTCCGCAAAATGGAACGTGCGGTGACAACAGCCTGGTGACGCTTAAATTGCTTAGCCCGGATGGTGATACTGCATGGTCGGTGATGTATAAACTAAGCCAGGCGTTAAGCGACATCGAAGTTCCATGTTCGGTGCTGGAGTGTGAAGGTGAGCCGTGCCTGTTTGTAA > 2:122542/1‑250 CTCAATCGTCCATCGACTGCCGCAGTACTATCGCTGGTCTGCTGGTCTGCTGGTTTCGCAGGCTCGAAGGTTGAACCGATTCCGCAAAATGGCCCGTGCGGTGACAACAGCCTGGTGGCGCTTAAATTGCTTAGCCCGGATGGTGATAATGCATGGTCGGTGATGTATACACTAAG > 2:348757/1‑176 CAGAACTATCGCTGGTCTTCTGGTCTGCTGGTTTCGCAGGTTCGAAGGTTGAACCGATTCCGCAAAATGGACCGTGCGGTGACAACAGCCTGGTTGCGCTTAAATTGCTTAGCCCGGATGGTGATAATGCATGGTCGGTGATGTATAAACTAAGCCAGGGGTTAAGCGACATCGAAGTTCCATGTTCGGTGCTGGGGTGTGAAGGTGAGCCGTGCCTGTTTGTAAATCGCCAGGACGAGTTTGCTGCAACA < 1:20162/251‑1 ATCGCTGGTCTGCTGGTCTGCTGGTTTCGCAGGTTCGAAGGTTGAACCGATTCCGCAAAATGGACCGTGCGGTGACAACAGCCTGGTGGCGCTTAAATTGCTTAGCCCGGATGGTGATAATGCATGGTCGGTGATGTATAAACTAAGCCAGGCGTTAAGCGACATCGAAGTTCCATGTTCGGTGCTGGAGTGTGAAGGTGAGCCGTGCCTGTTTGTAAATCGCCAGGACGAGTTTGCTGCAACATGCCGAT > 1:205028/1‑251 ATCGCTGGTCTGCTGGTCTGCTGGTTTCGCAGGTTCGAAGGTTGAACCGATTCCGCAAAATGGACCGTGCGGTGACAACAGCCTGGTGGCGCTTAAATTGCTTAGCCCGGATGGTGATAATGCATGGTCGGTGATGTATAAACTAAGCCAGGCGTTAAGCGACATCGAAGTTCCATGTTCGGTGCTGGAGTGTGAAGGTGAGCCGTGCCTGTTTGTAAATCGCCAGGACGAGTTTGCTGCAACATGCCG < 1:315137/249‑1 AGCCCCGCAAACGTGACCACGCCCGCAGATATTACTTAAATCAGAGCCATAGAGGCCACGCAGGCGAGGCATCAATCTTTACGATCTGTATAAAGACGGATTGTTGATGATGTGTTAAAATTGATGTAAACAAATTGTGAAGTGAATGTGCTTCCGGGGAAAATAAGTGACTTCATTACAACTCTCAATCGTCCATCGACTGCCGCAGAACTATCGCTGGTCTGCTGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2278403‑2278175 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gctggtCTGCTGGTTTCGCAGGTTCGAAGGTTGAACCGATTCCGCAAAATGGACCGTGCGGTGACAACAGCCTGGTGGCGCTTAAATTGCTTAGCCCGGATGGTGATAATGCATGGTCGGTGATGTATAAACTAAGCCAGGCGTTAAGCGACATCGAAGTTCCATGTTCGGTGCTGGAGTGTGAAGGTGAGCCGTGCCTGTTTGTAAATCGCCAGGACGAGTTTGCTGCAACATGCCGAT < NC_000913/2278182‑2277949 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |