BLASTScope Option Help
  • <Sort hits order by ...>
    並べ替えを行う要素の指定
      Hit number(Score) (default)
      Bit score
      Query from
      definition
      alignment length

    "Query from" を指定し、HIT (相同性が認められたBLAST対象DBの配列) 1件に HSP(連続した相同性の高い領域) が複数ある場合、最もスコアの高かった HSP で並べ替えを行います。



  • -h <Number of Hits> (Integer)
    Hit 表示件数の指定

    "Limit"のボタンをチェックすると、表示する Hit(相同性が認められたBLAST対象DBの配列) の件数を制限することができます。
    件数は右側のボックスで指定してください。



  • -h <Number of HSPs> (Integer)
    HSP 表示件数の指定

    "Limit"のボタンをチェックすると、Hit 1件あたりの HSP(連続した相同性の高い領域) の表示件数を制限することができます。
    HSP は、bit-score の高いものが表示されます。 件数は右側のボックスで指定してください。



  • <alignment length> (Integer)
    アライメント長の制限

    指定した数値よりも長いアライメント長を持つ HSP のみを表示させることができます。
    制限を行わない場合は、"0"を入力してください。



  • <Range of query sequence> (Integer)
    Queryの表示領域を指定

    Query(問い合わせ)配列のうち一部の領域と、その領域に相同性をもつデータベースの配列のみを表示させることができます。
    左側のボックスに領域の開始位置を、右側のボックスに領域の終了位置を入力してください。 Query配列の全体を表示する場合には、何も入力しないでください。



  • <image width> (Integer)
    画像幅の指定

    画像の幅を指定することが出来ます。(単位:ピクセル)