Tools - Reference - Detail

Reference Detail

Reference
Author Yang,S., Gu,T., Pan,C., Feng,Z., Ding,J., Hang,Y., Chen,J.Q. and Tian,D.
Title Genetic variation of NBS-LRR class resistance genes in rice lines
Abstract:
The use of plant disease resistance (R) genes in breeding programs needs an understanding of their variation patterns. In our current study, we investigated the polymorphisms of 44 NBS-LRR class R-genes among 21 rice cultivars and 14 wild rice populations. Our data suggested that there were four basic types of variations: conserved, diversified, intermediate-diversified, and present/absent patterns. Common characteristics at a locus of conserved R-genes were: copy-number uniformity, clear divergence (long branches) with other paralogs, and highly identical alleles. On the other hand, copy-number variability, a nearly equal and non-zero branch lengths, and high levels of nucleotide diversity were observed at the loci of highly diversified R-genes. Research suggests that the ratio of diverse alleles to the total number of genes at a locus is one of the best criteria to characterize the variation pattern of an R-gene. Our data suggested that a significant genetic reduction was detected only in four present/absent R-genes, compared with the variation observed in wild rice. In general, no difference was detected between wild rice and cultivars, japonica and indica rice, or between lines from different geographic regions. Our results also suggested that R-genes were under strong selection, which shaped R-gene variation patterns.
Journal Theor. Appl. Genet.
Country China
Volume 116(2)
Pages 165-177
Year 2008
PubMed ID 17932646
PubMed Central ID -
DOI 10.1007/s00122-007-0656-4
URL -
Relation
Gene PIB _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _
INSD EF641985 EF641986 EF641987 EF641988 EF641989 EF641990 EF641991 EF641992 EF641993 EF641994 EF641995 EF641996 EF641997 EF641998 EF641999 EF642000 EF642001 EF642002 EF642003 EF642004 EF642005 EF642006 EF642007 EF642008 EF642009 EF642010 EF642011 EF642012 EF642013 EF642014 EF642015 EF642016 EF642017 EF642018 EF642019 EF642020 EF642021 EF642022 EF642023 EF642024 EF642025 EF642026 EF642027 EF642028 EF642029 EF642030 EF642031 EF642032 EF642033 EF642034 EF642035 EF642036 EF642037 EF642038 EF642039 EF642040 EF642041 EF642042 EF642043 EF642044 EF642045 EF642046 EF642047 EF642048 EF642049 EF642050 EF642051 EF642052 EF642053 EF642054 EF642055 EF642056 EF642057 EF642058 EF642059 EF642060 EF642061 EF642062 EF642063 EF642064 EF642065 EF642066 EF642067 EF642068 EF642069 EF642070 EF642071 EF642072 EF642073 EF642074 EF642075 EF642076 EF642077 EF642078 EF642079 EF642080 EF642081 EF642082 EF642083 EF642084 EF642085 EF642086 EF642087 EF642088 EF642089 EF642090 EF642091 EF642092 EF642093 EF642094 EF642095 EF642096 EF642097 EF642098 EF642099 EF642100 EF642101 EF642102 EF642103 EF642104 EF642105 EF642106 EF642107 EF642108 EF642109 EF642110 EF642111 EF642112 EF642113 EF642114 EF642115 EF642116 EF642117 EF642118 EF642119 EF642120 EF642121 EF642122 EF642123 EF642124 EF642125 EF642126 EF642127 EF642128 EF642129 EF642130 EF642131 EF642132 EF642133 EF642134 EF642135 EF642136 EF642137 EF642138 EF642139 EF642140 EF642141 EF642142 EF642143 EF642144 EF642145 EF642146 EF642147 EF642148 EF642149 EF642150 EF642151 EF642152 EF642153 EF642154 EF642155 EF642156 EF642157 EF642158 EF642159 EF642160 EF642161 EF642162 EF642163 EF642164 EF642165 EF642166 EF642167 EF642168 EF642169 EF642170 EF642171 EF642172 EF642173 EF642174 EF642175 EF642176 EF642177 EF642178 EF642179 EF642180 EF642181 EF642182 EF642183 EF642184 EF642185 EF642186 EF642187 EF642188 EF642189 EF642190 EF642191 EF642192 EF642193 EF642194 EF642195 EF642196 EF642197 EF642198 EF642199 EF642200 EF642201 EF642202 EF642203 EF642204 EF642205 EF642206 EF642207 EF642208 EF642209 EF642210 EF642211 EF642212 EF642213 EF642214 EF642215 EF642216 EF642217 EF642218 EF642219 EF642220 EF642221 EF642222 EF642223 EF642224 EF642225 EF642226 EF642227 EF642228 EF642229 EF642230 EF642231 EF642232 EF642233 EF642234 EF642235 EF642236 EF642237 EF642238 EF642239 EF642240 EF642241 EF642242 EF642243 EF642244 EF642245 EF642246 EF642247 EF642248 EF642249 EF642250 EF642251 EF642252 EF642253 EF642254 EF642255 EF642256 EF642257 EF642258 EF642259 EF642260 EF642261 EF642262 EF642263 EF642264 EF642265 EF642266 EF642267 EF642268 EF642269 EF642270 EF642271 EF642272 EF642273 EF642274 EF642275 EF642276 EF642277 EF642278 EF642279 EF642280 EF642281 EF642282 EF642283 EF642284 EF642285 EF642286 EF642287 EF642288 EF642289 EF642290 EF642291 EF642292 EF642293 EF642294 EF642295 EF642296 EF642297 EF642298 EF642299 EF642300 EF642301 EF642302 EF642303 EF642304 EF642305 EF642306 EF642307 EF642308 EF642309 EF642310 EF642311 EF642312 EF642313 EF642314 EF642315 EF642316 EF642317 EF642318 EF642319 EF642320 EF642321 EF642322 EF642323 EF642324 EF642325 EF642326 EF642327 EF642328 EF642329 EF642330 EF642331 EF642332 EF642333 EF642334 EF642335 EF642336 EF642337 EF642338 EF642339 EF642340 EF642341 EF642342 EF642343 EF642344 EF642345 EF642346 EF642347 EF642348 EF642349 EF642350 EF642351 EF642352 EF642353 EF642354 EF642355 EF642356 EF642357 EF642358 EF642359 EF642360 EF642361 EF642362 EF642363 EF642364 EF642365 EF642366 EF642367 EF642368 EF642369 EF642370 EF642371 EF642372 EF642373 EF642374 EF642375 EF642376 EF642377 EF642378 EF642379 EF642380 EF642381 EF642382 EF642383 EF642384 EF642385 EF642386 EF642387 EF642388 EF642389 EF642390 EF642391 EF642392 EF642393 EF642394 EF642395 EF642396 EF642397 EF642398 EF642399 EF642400 EF642401 EF642402 EF642403 EF642404 EF642405 EF642406 EF642407 EF642408 EF642409 EF642410 EF642411 EF642412 EF642413 EF642414 EF642415 EF642416 EF642417 EF642418 EF642419 EF642420 EF642421 EF642422 EF642423 EF642424 EF642425 EF642426 EF642427 EF642428 EF642429 EF642430 EF642431 EF642432 EF642433 EF642434 EF642435 EF642436 EF642437 EF642438 EF642439 EF642440 EF642441 EF642442 EF642443 EF642444 EF642445 EF642446 EF642447 EF642448 EF642449 EF642450 EF642451 EF642452 EF642453 EF642454 EF642455 EF642456 EF642457 EF642458 EF642459 EF642460 EF642461 EF642462 EF642463 EF642464 EF642465 EF642466 EF642467 EF642468 EF642469 EF642470 EF642471 EF642472 EF642473 EF642474 EF642475 EF642476 EF642477 EF642478 EF642479 EF642480 EF642481 EF642482 EF642483 EF642484 EF642485 EF642486 EF642487 EF641964 EF641965 EF641966 EF641967 EF641968 EF641969 EF641970 EF641971 EF641972 EF641973 EF641974 EF641975 EF641976 EF641977 EF641978 EF641979 EF641980 EF641981 EF641982 EF641983 EF641984
Strain Wild Core Collection -
Induced Mutation Lines(NIG Collection) -
Sterile Seed Strain -
Lethal Embryo
Mutantion Strain
-
Stages in Each Organ
- Muant Lines (Gene)
-
Cultivated Varieties(NIG Collection) -
Stages in Each Organ -
/rice/oryzabase