cDNA ( Data source : RAP-DB )
cDNA Detail
jump to Other species ESTs data to homologous Rice cDNA
General information
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RAP - Accession No.
|
AK065788
Link to RAP-DB
(
IRGSP 1.0
)
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RAP ID
|
Os01g0118300
(
IRGSP 1.0
)
|
RAP - Chromosome No.
|
1
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RAP - Location, Length
|
1045604 -
1052166
( + )
;
6563(bp)
|
Exon (Data source : RAP-DB)
|
Exon 1
|
Location |
1045604 -
1047136
( + )
;
1533 (bp)
|
Exon 2
|
Location |
1047358 -
1047423
( + )
;
66 (bp)
|
Exon 3
|
Location |
1047736 -
1047795
( + )
;
60 (bp)
|
Exon 4
|
Location |
1048159 -
1048249
( + )
;
91 (bp)
|
Exon 5
|
Location |
1049163 -
1049217
( + )
;
55 (bp)
|
Exon 6
|
Location |
1049308 -
1049371
( + )
;
64 (bp)
|
Exon 7
|
Location |
1049498 -
1049624
( + )
;
127 (bp)
|
Exon 8
|
Location |
1049712 -
1049796
( + )
;
85 (bp)
|
Exon 9
|
Location |
1050375 -
1050466
( + )
;
92 (bp)
|
Exon 10
|
Location |
1050947 -
1051200
( + )
;
254 (bp)
|
Exon 11
|
Location |
1051592 -
1051680
( + )
;
89 (bp)
|
Exon 12
|
Location |
1051768 -
1052166
( + )
;
399 (bp)
|
Chromosome: 1
, position: 1,045,604
- 1,052,166
bp
|
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Now loading
|
Sequence (Data source : RAP-DB)
|
Nucleotide
Fasta Format
|
000001 attctgctaa aaatttcatc ttggggggta tatttctcat attttagttc atgccgccgc
000061 cactatgtac taatcccacc atagcagctc atagtattct ccattgcaat cctgtcgtct
000121 atttgtattt gttttttgtt tgttagtatt agggtgcttt tgggtttggg gtttctgcca
000181 ttgacggtta cctgaagagc tctcgatgaa gcggttcttt tttattttat tttattttcg
000241 gtgcctagtg aaatacagtg gtggttttga atcattcctg ggagttccct ggtggttttg
000301 actgatcaaa acgctacatt ttttttatgt ttatgttccc tgttgttgtt tcttgcccaa
000361 atgcagattc actcttgcat ttgtttctct tgatttcctc tgctgttttg ctctacaagg
000421 acagaggact tagtctgctt gttcgtcagc cttgcaggaa aaaaaatgca gtaaaaaacc
000481 tgtctattgc gattactttg tgttcatctt ggggcgctct tattatgcgt gggaatcacc
000541 agcagagttc atccgatttg atgcgcgcat ctctaattcc catcttttgc agcattgcaa
000601 aagctgctgc cttttagctt ttgcgctttc ttaattagga ggggttgtac ggcgcccctg
000661 ttggacctga ttacttccac agtaattgca tcatgacatt ttattccttt ttaatcgttt
000721 ccttttgcta atctttttaa gtacaaatgg agtttccccc caaaaaaata ttgcaaatgg
000781 agtttttttt tccccttctc ctctcgcctt ttgctgtttc aggtttcgta tgttatcttc
000841 acatcaatgc agcctttaat tgcagcagac cacccttctt tgctactagt atgggaaaaa
000901 aaaatcagag ccacacgaac tgtgggtatt tgctatggga acttcacaag ttcgccagca
000961 atacaacttg aatgcgtcct gaagatctag attccgcagg tcaaatcgtc gaatttcaga
001021 gctagtagta ctgtaggctt gcctggtgca actgtgggtt atgcttcaat agcctttaac
001081 tgtgggttaa tgtgtagagt atatgtcaaa tacagaattt ttacttgaag aagatgtgtt
001141 tattttcaga tgtgttggac catttcatgt tgtccacttg taggtacttt cgtggcctaa
001201 gtagtacatt attcagttgt tagttatttg tctcactgaa tgcaagtgta tctttagtaa
001261 gagttggact gcattgtact tgttttaatc ttcttgaagg ccagtaagaa tttgtactct
001321 aatacaaaat tgtggaaatt ttacagataa taagctgcta agaattatca ccatggaggt
001381 caatggtcat cacaaaccaa gaagagaata taatggccga gagtgcaatg gtgtacaatc
001441 agtaaacaat tttggcgata tcgatccatg gacagcatgg gcatacaaac cgcgcacagt
001501 ttcattgcta ctgatgggaa catgcttttt aatgtgagat cagaatcttt atctgtggat
001561 tttttttaaa gattttaaag agcattttaa taatcaaggt gttttatgca tttgttagtg
001621 ttggcctacg gcaccttttt gaaatatgtt ttattttctt cagtttcgac cattgttagg
001681 actatcaaca agatatttag gacttgcaaa ggtgctctat gtttaacaga aatttaattt
001741 acattcttta tcagttgggc aagtggtgct cttgatccag aaagaagctt ctctgttgac
001801 cgcgtttcat ctgttaaaag gtattctact catccaggtt agacggtagt tgtttttacc
001861 attcactcac taattggaca tctttaaaac tagtgttacc tggtcatctg tgttcaaaat
001921 attttttatt gaaatcacac gagtcagatc catagcagat ttcatgtgtt gatgtttttt
001981 ttgctgcact agacacgcaa attctagtcg gtttccaacc acatgagtgt tcattttatt
002041 tttaccatca tttttctcaa caatttatct gttgattatc atttaaggat tcctttttgt
002101 tgatatgtca tatgtttctc ttttattgac aggggtgtct ttgcaatgat tgctgttttt
002161 ttggcttatt catttcttca ggcaccttct acgtgagtca cataaacccc ttatccgaac
002221 tctgattatc gaactctgtt tatggtaggg atggccgtgc agatataaat aatgctattg
002281 cacattgata tggaacagaa gggggtacgc gttcctgcgt actccatttc tgaaaataac
002341 ttttcaatat cactgaggaa ttgtatcatt ttcctagatg tgttactttt atcatgaaac
002401 tgaaataact tcataaattc tcctaaataa cagttttaat ttaaaaatcc cttgaaagtg
002461 aggcactgtt ccatttccta aaaatataac ctcattgggg gcttctctgt aattttgttt
002521 aacatttact tatatttatt tatactatga ttcagtgtac ttattagacc acatcctgcc
002581 atttggcggc tggtccacgg gatggcagtt gtttaccttg ttgctctaac ttttttgctt
002641 ttccaggtaa gtacagcttt ttcttattac tcttgctcaa cacattttta ttggatcatt
002701 gatattcatg gattattaag gcattgcatt cttttacttt ttttatctct tccacataac
002761 cttataatat caacttcttt tctaatgaac ggcatagaag tccctgtctc agtttctcgt
002821 ttaattgatt agcataagga attgcactgt gcactaatac ctcacttccc tcttgattcc
002881 aaccaaaaat aggttatttt tattaaagga aaaaagagtc gtcattggca ttacacatca
002941 gcagcagaag atgaggttac caatgtcaaa agtttaacag tataactata ggtgaacata
003001 gatcagtttg gaactaggat gactcaagag attaacacac attggaaaga aaagcctggt
003061 atcccatttt tatgttaccc tgggaacttt tttagtcaat aggaagcttc ccagaaatgt
003121 tttcaagtca tccaactaat tgcgattagt catcctagtc ggtactaagg caacttgatt
003181 ctaaccacga ttgatcggaa agtctcctaa ttagtcgcga ttagttatga ttaatcatcc
003241 tagtcggtac tgaggtgatt ttcctcgagt ttccgatttg aaaacatgct gccttgttgt
003301 ggtttactcc tagaggtagc tagtcaaagt gccaagagac tattctcccg tatctttact
003361 attgtgctat actggtccat gttgcatgca ccagatgaga caatgtctca aaaagtgagg
003421 gtcttgttat aaatattttt tttcttctca aatacgcaag agaattgtgc atcattggtc
003481 ttgttataaa tatcataaaa gagagaacaa aacctgtagt ttgcatggga ttcatactct
003541 gttccactta atcttgcaga cccgtgatga tgctaggcaa tttatgaagt atcttcaccc
003601 tgatcttggt gttggtaatg aatttaattt ccatatatga tctagcagtg cagagttatg
003661 tgattggaaa aataaaaacc tgatttttac ccacctttga gcagaattac ctgaaagatc
003721 ttatggaacc gactgccgca tatatgtacc tgatcatccg aaaagcaggt ttaacaatgt
003781 ttatgtatga ctccattcac caacttgctt ctcctttttg ttctatttga tttaccttaa
003841 aactccagtt ctgcaaagtc ttggagatgc ttcaagttac tgatttgaat ataggtttct
003901 ctaggagatc ctttttgatg agtttgttat tgcccatatc cttggatggt gggggaaggc
003961 tataatgata agaaaccaac cacttttatg ggtattatca attggctttg agctaatgga
004021 ggtatgcatt taatcttaca cgatcaattt atttttggct tctgtcttct gaatctagat
004081 tccttacata gtttcacatg tcctgcagct cacctttcgc catatgctgc caaactttaa
004141 tgagtgttgg tgggatagca tcgtactaga catattaatc tgcaattggt ttggtgagat
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004501 catcttttaa atgctaagtg tacctatggt atttcactag ctatttcgta tgaagttgtg
004561 cgctataatt gttactttaa atgctaagat atttcatgtg attaaaattt cgggacagtt
004621 ttcatgcgaa tgtctgtctt tacctctatt cgttagcctc ccataagttt gattcttctc
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004921 tatacttttc ttttttttgg catctgtccc atttttatgc agtgcattgt gttgtatatc
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005281 tcttgatctt tatattgtta gcctttcccg tgagtgcata tttcaccttt tgcttctcca
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相同な Wheat 及び Barley の EST データはBLAST 結果の E-value が e-20 以下のものです。