Strains

cDNA/BAC/Fosmid

Plasmid for Knock-in Experiments

Information

Medaka Tools

Medaka Strain
in Publications

References
Lectures of
a conference

Related documents

Biological experiments for elementary, junior high and high school students (Japanese)
Medaka experiments that anyone can do (Japanese)
Life of my teacher Tatsuo AIDA (Japanese)

Featured Link

From spawning to hatching of medaka ~nibb×niconico 
A checklist of the parasites of medaka 
medaka SNP(Beta)
Official Endocrine Disruption Website
M-marker 2009
Ensembl Medaka
M-Base
NBRP Medaka Genome Project
MEPD
Genomicus - Synteny browser -
ZFIN
ZIRC
UTGB Medaka
UCSC In-Silico PCR
The Fish Biology Journal of Medaka (Vol.1 - Vol.3)
The Fish Biology Journal of Medaka (Vol.4 - Vol.11)
Introduction to Medaka (NBRP Online Forum 2020)

CLSTF04303     VD

Merge cluster information
Name CLSTF04303
Library ALL 408 cDNA [Download: FASTA]
olea 1 cDNA [Download: FASTA]
olea25o19 
oleb 149 cDNA [Download: FASTA]
oleb10b05  oleb10b07  oleb10c16  oleb10i13  oleb10j12  oleb11m07  oleb12f16  oleb12i09  oleb13j08  oleb13n21  oleb14b03  oleb14e03  oleb14e06  oleb14m18  oleb14m23  oleb15f22  oleb16m24  oleb17b18  oleb17h18  oleb17l22  oleb17m02  oleb18b06  oleb18c14  oleb18i24  oleb18k22  oleb18l08  oleb18l23  oleb19j08  oleb19o18  oleb19p16  oleb1c09  oleb1f18  oleb1j23  oleb20c19  oleb20e07  oleb20h21  oleb20n01  oleb20p20  oleb22d07  oleb23o15  oleb24a17  oleb24k02  oleb25o10  oleb25o24  oleb26f13  oleb26h14  oleb26n15  oleb26p11  oleb27j09  oleb27p15  oleb28f18  oleb28m12  oleb28o14  oleb28p01  oleb29c08  oleb2m19  oleb30b24  oleb30m01  oleb30m04  oleb31d17  oleb31g09  oleb31l12  oleb33a15  oleb34n07  oleb34o04  oleb36e15  oleb36f15  oleb36g02  oleb36j12  oleb37g05  oleb37o15  oleb38h13  oleb39o06  oleb39p13  oleb3e10  oleb3i02  oleb40h15  oleb40j11  oleb40l14  oleb40m16  oleb41e09  oleb42a10  oleb43b12  oleb43j23  oleb43l08  oleb43p08  oleb44b08  oleb44g16  oleb44i03  oleb45b10  oleb45d14  oleb45k24  oleb46b24  oleb46n03  oleb47o15  oleb48f18  oleb48m17  oleb49b15  oleb49j12  oleb4d21  oleb4k16  oleb4n14  oleb50g06  oleb51o14  oleb52g24  oleb52n13  oleb54c16  oleb54e17  oleb54o15  oleb54p12  oleb55a23  oleb55c02  oleb55f11  oleb56g19  oleb57a07  oleb57b01  oleb57l02  oleb57p21  oleb58a14  oleb58h06  oleb58j18  oleb59e10  oleb59e18  oleb59k18  oleb59n12  oleb5a08  oleb5a11  oleb60a06  oleb60d07  oleb60h08  oleb61l03  oleb61p18  oleb62b12  oleb62n08  oleb63b16  oleb64f07  oleb64j09  oleb6a11  oleb6c10  oleb6d07  oleb6g17  oleb6h01  oleb7b04  oleb7d19  oleb8d06  oleb8h11  oleb8l14  oleb9b11  oleb9c04 
olec 249 cDNA [Download: FASTA]
olec10b19  olec10h08  olec10i20  olec10l05  olec11a03  olec11b08  olec11d11  olec11e04  olec11e05  olec11f22  olec11h18  olec11j13  olec11m07  olec12b19  olec12j01  olec12j16  olec13a21  olec13b06  olec13e19  olec13h04  olec14a05  olec14a11  olec14j11  olec15c22  olec15d19  olec15g04  olec15h04  olec16c03  olec16h08  olec16i19  olec17b06  olec17b22  olec17f04  olec17n02  olec17p17  olec18g16  olec18m01  olec18p08  olec19c16  olec19e20  olec19p12  olec1a08  olec1b11  olec20k21  olec21b11  olec21b21  olec21d10  olec21h04  olec21i23  olec21m03  olec22j04  olec22m04  olec22o17  olec23b04  olec23i17  olec23o20  olec24b11  olec24f03  olec24g08  olec24h07  olec24m22  olec25f16  olec25i01  olec26h15  olec26k24  olec26l14  olec27b04  olec27e16  olec27h20  olec27i20  olec27m05  olec27p05  olec28b15  olec28d03  olec28h14  olec29a17  olec29a18  olec29e20  olec29h09  olec29l09  olec2b13  olec2l22  olec2l24  olec2m10  olec2p20  olec30a07  olec30g19  olec30i12  olec31m21  olec32c05  olec32c12  olec32d07  olec32g12  olec32i15  olec32i21  olec32j17  olec32k09  olec32o13  olec32p12  olec33e23  olec33e24  olec34d05  olec34g09  olec34h19  olec34k08  olec34p21  olec35e01  olec35e10  olec35j07  olec35p11  olec36a03  olec36c15  olec36e07  olec36h08  olec37i14  olec38c07  olec38g11  olec38i01  olec39a11  olec39h02  olec39p17  olec3b04  olec3f11  olec3g05  olec3h04  olec3m14  olec40d24  olec40h23  olec40k18  olec40n22  olec40o19  olec40p19  olec41i21  olec41m13  olec41n05  olec42l09  olec43e24  olec43n06  olec43n17  olec43o17  olec43p11  olec44g11  olec45b03  olec45c02  olec45h18  olec45m08  olec45o21  olec45p14  olec46a22  olec46f09  olec46f20  olec46g24  olec46n21  olec47e01  olec47i08  olec47p03  olec48l03  olec48m04  olec49f02  olec49f17  olec49g07  olec49i04  olec49n16  olec49p08  olec4b11  olec4g17  olec4o02  olec4o21  olec51b16  olec51l22  olec52b06  olec52c05  olec52g09  olec52h16  olec52o05  olec53i24  olec53j09  olec53l09  olec53o23  olec54f16  olec54i01  olec54j01  olec54m21  olec54o08  olec55f17  olec55k05  olec55k24  olec56j06  olec57m10  olec58g07  olec59a03  olec59a12  olec59d05  olec59f06  olec59m06  olec59o22  olec5d15  olec5d20  olec5i09  olec5j05  olec5j09  olec5k06  olec5o09  olec60a22  olec60a23  olec60g13  olec60o17  olec60p20  olec61a22  olec61c11  olec61f24  olec61g08  olec61p02  olec62k13  olec62m02  olec62m08  olec63g13  olec63g17  olec63k02  olec63o03  olec64a06  olec64g23  olec64i15  olec64j22  olec64j23  olec64m20  olec65d12  olec6a19  olec6b21  olec6g21  olec6i02  olec6o12  olec7d10  olec7e03  olec7e16  olec7h03  olec7h06  olec7i16  olec7j14  olec7n13  olec7o09  olec8f20  olec8l08  olec9a20  olec9a21  olec9b11  olec9d11  olec9e12  olec9m04 
olvl 0 cDNA
olli 0 cDNA
olbr 0 cDNA
olgi 9 cDNA [Download: FASTA]
olgi24f02  olgi2c16  olgi38j11  olgi42m10  olgi44p19  olgi47e23  olgi61m12  olgi8e18  olgi8l02 
olki 0 cDNA
olsp 0 cDNA
olte 0 cDNA
olova 0 cDNA

Before using Assemble Viewer, please ensure that you have the latest version of Java. If you are not using the latest Java version, please download it here. http://java.com/ja/download/


Contig information - 1
Name Contig1
Clone count 2 clones
Length 851
Assemble Result Assemble Viewer
Homology(BLAST)
Top Hit myosin light chain 3 [Epinephelus coioides]
Score 82
Evalue 4.25562
Detail
Sequence [Download: FASTA]
>Contig1
GACCAGTCTGTCTTGGGACTTCAGCTTCTCTTCTCCTTTCTTTCCGCTCGTCCAGCTCGCGCTCT
CCAACATGGTGTGTACAATGTTGTGTTCTGGAGCTTTTCTTGGACCAATTTTAATTTGGATACTA
TCAAAACCCTAATTCTAAGATGTGGACTTGAAATGTGTGCTAAAAGTATGAAGGCTTTTAAGAGG
AGATGGTTTAGAACCACATTTGTGTTGACAAAAAAGACCAAGTTGACCTTTGGTTAAACCCGTTT
TCTCTTTGTTCTGTTTGTTTTTTGTGTGTCTGTTTTCGTGTGACAGACCGAGTTCACACCGGACC
AGATTGAGGGTAAGTGAAGAGGAAATCCTCCAGACATCACCAAGGTCTTCAAGCAGATCAAAGAA
AAGCCCCGTAGCTCGGATTTATTAATGCCTTGTTCCTTTCAACATTTTCCGACAAACCGCGCTAT
TGTCCAAATTAAGAAGCAAAACGGTGGGGGATGAAATTCTCACCTCCGAGTGCAGTTGTCGTCTA
TTCTTGGACTACGAAGGTCTTCTAAGTTAGAGGTGTTAATGCTCAGGTCAGAGTCCAAGAAGCTG
GACTGACGGCATTGGCTTAACCGAAAAATCCAAACCATCTCTGATGAAATCCTCTATAAACATCC
AAAACAAATCACATAAAAAACACAGTCGATCAGTTGACGAAATGCAACATCTGGTATAAACAACG
AGTCAGCATTCTTCGGTTTATTGCGCTCCAAAACATGTCTTTATAAGGCCTCAGCTCGCCCATCC
CATCGTAGTGTATCAGTTTCATTCAATGTTGCCGCAACTGAAAACATGAGCAGGCATGAAGAAGA
GTGTGT

Contig information - 2
Name Contig2
Clone count 211 clones
Length 1050
Assemble Result Assemble Viewer
Homology(BLAST)
Top Hit unnamed protein product [Tetraodon nigroviridis]
Score 655
Evalue 6.26302e-91
Detail
Sequence [Download: FASTA]
>Contig2
GGGGTGAGGACCAGTCTGTCTTGGGACTTCAGCTTCTCTTCTCCTTTCTTTCCGCTCGTCCAGCT
CGCGCTCTCCAACATGACCGAGTTCACACCGGACCAGATTGAGGACTTCAAGGAGGCTTTTGGTC
TCTTTGACAGAGTTGGTGACAGCCAGGTGGCCTTCAACCAGGTGGCCGACATCATGCGCGCCCTG
GGCCAGAACCCCACCAACAAGGACGTTGCAAAAATCCTGGGCAACCCAACCGCCGACGACATGGC
CAACAAGAGGCTCAACTTCGACGCCTTCCTGCCCATGCTGAAGGAGGTTGACGCTCTTCCCAAGG
GTACCTACGACGACTACGTTGAGGGTCTGCGCGTCTTCGACAAGGAGGGCAACGGCACAGTGATG
GGCGCTGAGCTGCGGATTGTGCTGTCCACTTTGGGAGAGAAGATGACTGAGCCTGAGATCGAAGC
CCTCATGGCCGGCCAGGAGGACGAGAACGGCAGTGTGCACTATGAGGCTTTCGTCAAGCACATCA
TGTCTGTGTAAGAGGCCGGCAGCAGGAGTGCTGGTGAAGCTGTAGCTTTGCCTACAGACAGCCCA
ACGGTGTTCAGAACATCGACACTGTTTGAAAGACCAACTAAGGAAAGACAAGGACTTTGTACAAG
GGATGTTGAAGCAAACCCATCTTGTTGTTTGTTTTGTTCTCCCTTCCCTCTTCGTGTCAAACCCT
TCCTCTCTCAAGGACGCCGCCTGTGTTAAAAGACCCCCATTTCACTCGGGCCTCTACTACCCCCC
CCCTCCCGCTACACTGGGGCGTGTCTCCACTTGTCATATGGGGTGAGGAACGGGGGAAAAGGGGT
GACCGCTCATTAAGTGAGGGTAAATCCCTCCCTTCCCACCGCCACCTCATTCAGTCCCACCATCA
CTGACCCAGCAATGCCAAAGGTGCTGGATGACCGTGGTGGATAGACCGCCAAAAGTCCCCCTCCC
CTACCCCCTGAAAAGTTGTATTTATTTTCATTCTGCTCATTTCAGAATAAACTTTTCCAAAGTAC
AAAAAAAAAA
/medaka